Die folgende Systematik der rezenten Knochenfische (Osteichthyes) ist eines von zahlreichen vorhandenen Modellen zur Klassifikation der über 30.000 derzeit bekannten Knochenfisch-Arten, die heute auf der Erde leben. Sie folgt im Wesentlichen einer aktuellen Revision der Knochenfischsystematik, die im April 2013 veröffentlicht und im November 2013, im Juli 2014, 2016 sowie im Juli 2017 aktualisiert wurde (Betancur-R. et al., 2013, 2014, 2016, 2017; DeepFin.org).
Diese Revision ist das Ergebnis des Vergleichs der DNA-Sequenzen von 21 genetischen Markern (einem der Mitochondrialen DNA und 20 der Zellkern-DNA) von 1410 Knochenfischarten aus 1093 Gattungen, 369 Familien und allen traditionellen Ordnungen. Im Unterschied zu allen vorherigen Systematiken werden hier auch die problematischen Gruppen der Percomorpha (Barschverwandten) und Perciformes (Barschartigen) zu monophyletischen Taxa. Die Percomorpha können in acht gut begründete Taxa oberhalb des Ordnungsrangs unterteilt werden. Die Ordnung der Perciformes, bisher eine polyphyletische Sammelgruppe von über 10.000 Arten, über 1500 Gattungen, 160 Familien und 20 Unterordnungen barschähnlicher Fische (engl. „wastebag“-Taxon), wird erstmals zu einer monophyletischen Ordnung.
Weiter verfeinert wurde die Systematik durch eine andere Arbeitsgruppe im Jahr 2022. Dabei konnten einige Familie, deren Stellung innerhalb der Barschverwandten rätselhaft blieb, durch den Vergleich von ultrakonservierten Elementen aus der DNA von 1.084 Arten etablierten Ordnungen zugeordnet werden.
Die Knochenfische gliedern sich in zwei gut unterscheidbare Gruppen, die Fleischflosser (Sarcopterygii), von denen es nur noch acht rezente Arten gibt, aus denen aber die Landwirbeltiere (Tetrapoda) hervorgegangen sind, und die Strahlenflosser (Actinopterygii), zu denen über 95 % der heute lebenden Fischarten gehören. Ausgestorbene Gruppen sind in dieser Systematik bisher nicht berücksichtigt.
Fleischflosser (Sarcopterygii) Phylogenetische Systematik der basalen Knochenfische
Coelacanthimorpha (= Actinistia) Klasse Quastenflosser (Coelacanthi) Ordnung Quastenflosser (Coelacanthiformes) Latimeriidae Rhipidistia Klasse Lungenfische (Dipneusti) Ordnung Lungenfische (Ceratodontiformes) Australische Lungenfische (Neoceratodontidae) Südamerikanische Lungenfische (Lepidosirenidae) Afrikanische Lungenfische (Protopteridae)
Strahlenflosser (Actinopterygii) Klasse Cladistiamini|Senegal-Flösselhecht (Polypterus senegalus) Ordnung Polypteriformes Familie Flösselhechte (Polypteridae) Klasse Actinopteri Unterklasse Knorpelganoiden (Chondrostei) Ordnung Störartige (Acipenseriformes) Störe (Acipenseridae) Löffelstöre (Polyodontidae) Unterklasse Neopterygii Teilklasse Knochenganoiden (Holostei) Ordnung Amiiformes Amiidae Ordnung Knochenhechtartige (Lepisosteiformes)mini|Gefleckter Knochenhecht (Lepisosteus oculatus) Knochenhechte (Lepisosteidae) Teilklasse Echte Knochenfische (Teleostei) ohne Rang Elopomorpha Ordnung Tarpunartige (Elopiformes)mini|Atlantischer Tarpun (Megalops atlanticus) Frauenfische (Elopidae) Tarpune (Megalopidae) Ordnung Grätenfischartige (Albuliformes) Grätenfische (Albulidae) Ordnung Dornrückenaalartige (Notacanthiformes) Echsenaale (Halosauridae) Dornrückenaale (Notacanthidae) Ordnung Aalartige (Anguilliformes)mini|Geistermuräne (Rhinomuraena quaesita) Protanguillidae Pelikanaale (Eurypharyngidae) Sackmäuler (Saccopharyngidae) Flussaale (Anguillidae) Schnepfenaale (Nemichthyidae) Muränen (Muraenidae) Sägezahn-Schnepfenaale (Serrivomeridae) Meeraale (Congridae) Hechtconger (Muraenesocidae) Schlangenaale (Ophichthidae) Heterenchelyidae Wurmaale (Moringuidae) Chlopsidae Myrocongridae Grubenaale (Synaphobranchidae) Colocongridae Langhalsaale (Derichthyidae) Entenschnabelaale (Nettastomatidae) Cyematidae Neocyematidae Einkieferaale (Monognathidae) Knochenzünglerähnliche (Osteoglossomorpha)mini|Arapaima (Arapaima gigas) Ordnung Hiodontiformes Mondaugen (Hiodontidae) Ordnung Knochenzünglerartige (Osteoglossiformes) Schmetterlingsfisch (Pantodontidae) Knochenzüngler (Osteoglossidae) Arapaimidae Großnilhecht (Gymnarchidae) Nilhechte (Mormyridae) Altwelt-Messerfische (Notopteridae) ohne Rang Clupeocephala ohne Rang Otocephala (= Otomorpha, Ostarioclupeomorpha) Ordnung Heringsartige (Clupeiformes)mini|Atlantischer Hering (Clupea harengus) Unterordnung Denticipitoidei Zähnchen-Heringe (Denticipitidae) Unterordnung Clupeoidei Spratelloididae Sardellen (Engraulidae) Heringe (Clupeidae) Wolfsheringe (Chirocentridae) Dussumieriidae Beilbauchheringe (Pristigasteridae) Ehiravidae Alosidae Dorosomatidae Hyperlophidae Ordnung Alepocephaliformesmini|Alepocephalus tenebrosus Schwarzköpfe (Alepocephalidae) Leuchtheringe (Platytroctidae) Ostariophysi Sektion Anotophysa Ordnung Sandfischartige (Gonorynchiformes) Sandfische (Gonorynchidae) Milchfische (Chanidae) Afrikanischer Schlammfisch (Phractolaemidae) Schlankfische (Kneriidae) Sektion Otophysi Ordnung Karpfenartige (Cypriniformes)mini|Karpfen (Cyprinus carpio) Überfamilie Schmerlenartige (Cobitoidea) Saugkarpfen (Catostomidae) Saugschmerlen (Gyrinocheilidae) Steinbeißer (Cobitidae) Plattschmerlen (Balitoridae) Prachtschmerlen (Botiidae) Bachschmerlen (Nemacheilidae) Vaillantellidae Gastromyzontidae Ellopostomatidae Barbuccidae Serpenticobitidae Überfamilie Karpfenfischähnliche (Cyprinoidea) Spindelschmerlen (Psilorhynchidae) Paedocyprididae Karpfenfische (Cyprinidae) Sundadanionidae Bärblinge (Danionidae) Leptobarbidae Xenocyprididae Schleie (Tincidae) Bitterlinge (Acheilognathidae) Gründlingsverwandte (Gobionidae) Kardinalfische (Tanichthyidae) Weißfische (Leuciscidae) Ordnung Salmlerartige (Characiformes)mini|Roter Neon (Paracheirodon axelrodi) Unterordnung Geradsalmler (Citharinoidei) Eigentliche Geradsalmler (Citharinidae) Distichodontidae Unterordnung Characoidei Kopfsteher (Chilodidae) Engmaulsalmler (Anostomidae) Breitlingssalmler (Curimatidae) Amerikanische Hechtsalmler (Ctenoluciidae) Pracht- und Bodensalmler (Crenuchidae) Afrikanische Salmler (Alestidae) Afrikanische Hechtsalmler (Hepsetidae) Lepidarchidae Raubsalmler (Erythrinidae) Tarumaniidae Wolfssalmler (Cynodontidae) Sägesalmler (Serrasalmidae) Algensalmler (Parodontidae) Keulensalmler (Hemiodontidae) Barbensalmler (Prochilodontidae) Schlanksalmler (Lebiasinidae) Chalceidae Bryconidae Iguanodectidae Triportheidae Acestrorhamphidae Characidae Spintherobolidae Stevardiidae Beilbauchsalmler (Gasteropelecidae) Acestrorhynchidae Ordnung Neuwelt-Messerfische (Gymnotiformes)mini|Zitteraal (Electrophorus electricus) Zitteraale (Electrophoridae) Messeraale (Gymnotidae) Schwanzflossen-Messeraale (Apteronotidae) Glasmesserfische (Sternopygidae) Sand-Messeraale (Rhamphichthyidae) Kleine Messerfische (Hypopomidae) Ordnung Welsartige (Siluriformes)mini|Kopf eines Antennen-Harnischwels (Ancistrus sp.) Kryptoglanidae Unterordnung Loricarioidei Nematogenyidae Schmerlenwelse (Trichomycteridae) Harnischwelse (Loricariidae) Kletterwelse (Astroblepidae) Stachlige Zwergwelse (Scoloplacidae) Panzer- und Schwielenwelse (Callichthyidae) Unterordnung Diplomystoidei Primitivwelse (Diplomystidae) Unterordnung Siluroideimini|Hemibagrus wyckioides Gebirgswelse (Sisoridae) Flusswelse (Akysidae) Schlankwelse (Amblycipitidae) Stachelwelse (Bagridae) Ritidae Afrikanische Glaswelse (Schilbeidae) Ailiidae Horabagridae Kiemensackwelse (Clariidae) Großmaulwelse (Chacidae) Walwelse (Cetopsidae) Panzerkopfwelse (Cranoglanididae) Katzenwelse (Ictaluridae) Haiwelse (Pangasiidae) Anchariidae Kreuzwelse (Ariidae) Claroteidae Quappenwelse (Amphiliidae) Elektrische Welse (Malapteruridae) Fiederbartwelse (Mochokidae) Echte Welse (Siluridae) Aal- und Korallenwelse (Plotosidae) Dornwelse (Doradidae) Falsche Dornwelse (Auchenipteridae) Phreatobiidae Heptapteridae Großmaul-Antennenwelse (Pseudopimelodidae) Antennenwelse (Pimelodidae) Austroglanididae Erethistidae Bratpfannen- und Banjowelse (Aspredinidae) Lacantuniidae ohne Rang Euteleostei Ordnung Lepidogalaxiiformes Salamanderfisch (Lepidogalaxiidae) Ordnung Galaxiiformes Galaxien (Galaxiidae) Ordnung Goldlachsartige (Argentiniformes) Tiefseestinte (Bathylagidae) Microstomatidae Gespensterfische (Opisthoproctidae) Goldlachse (Argentinidae) Ordnung Lachsartige (Salmoniformes)mini|Rotlachs (Oncorhynchus nerka) Lachsfische (Salmonidae) Ordnung Hechtartige (Esociformes) Hundsfische (Umbridae) Hechte (Esocidae) ohne Rang Stomiati Ordnung Maulstachler (Stomiiformes)mini|Pazifischer Viperfisch (Chauliodus macouni) Diplophidae Borstenmäuler (Gonostomatidae) Ichthyococcidae Phosichthyidae Tiefsee-Beilfische (Sternoptychidae) Stomiidae Vinciguerriidae Yarrellidae Ordnung Stintartige (Osmeriformes) Neuseelandlachse (Retropinnidae) Stinte (Osmeridae) Plecoglossidae Salangidae ohne Rang Neoteleostei Ordnung Ateleopodiformes Tiefseequappen (Ateleopodidae) Ordnung Eidechsenfischverwandte (Aulopiformes) Unterordnung Synodontoidei Eidechsenfische (Synodontidae) Unterordnung Paraulopoidei Paraulopidae Unterordnung Alepisauroideimini|Alepisaurus ferox Netzaugenfische (Ipnopidae) Teleskopfische (Giganturidae) Tiefsee-Eidechsenfische (Bathysauridae) Bathysauroididae Perlaugen (Scopelarchidae) Grünaugen (Chlorophthalmidae) Säbelzahnfische (Evermannellidae) Sudidae Omosudidae Alepisauridae Barrakudinas (Paralepididae) Lestidiidae Notosudidae Unterordnung Aulopoidei Pseudotrichonotidae Flaggenflosser (Aulopidae) Harpadontidae Ordnung Laternenfischartige (Myctophiformes)mini|Schlankschwänziger Laternenfisch (Myctophum punctatum) Laternenfische (Myctophidae) Laternenzüngler (Neoscopelidae) Acanthomorpha Division Lampripterygii Ordnung Glanzfischartige (Lampriformes) Segelträger (Veliferidae) Gotteslachse (Lampridae) Schopffische (Lophotidae) Strahlenköpfe (Radiicephalidae) Riemenfische (Regalecidae) Sensenfische (Trachipteridae) Division Paracanthopterygii (sensu Grande et al.) Ordnung Bartfischartige (Polymixiiformes) Bartfische (Polymixiidae) Ordnung Barschlachsartige (Percopsiformes) Blindfische (Amblyopsidae) Piratenbarsche (Aphredoderidae) Barschlachse (Percopsidae) Ordnung Petersfischartige (Zeiformes)mini|Petersfisch (Zeus faber) Petersfische (Zeidae) Parazenidae Cyttidae Oreosomatidae Zeniontidae Grammicolepididae Ordnung Stylephoriformes Stylephoridae Ordnung Dorschartige (Gadiformes)mini|Kabeljau (Gadus morhua) Unterordnung Bregmacerotoidei Einhorndorsche (Bregmacerotidae) Unterordnung Gadoidei Gabeldorsche (Phycidae) Seequappen (Gaidropsaridae) Quappen (Lotidae) Dorsche (Gadidae) Unterordnung Ranicipitoidei Froschdorsche (Ranicipitidae) Unterordnung Merluccioidei Seehechte (Merlucciidae) Unterordnung Macrouroidei Trachyrincidae Euclichthyidae Aaldorsche (Muraenolepididae) Hochseedorsche (Melanonidae) Tiefseedorsche (Moridae) Bathygadidae Lyconidae Macruronidae Leuchtseehechte (Steindachneriidae) Grenadierfische (Macrouridae) Division Stachelflosser (Acanthopterygii) Ordnung Schleimkopfartige (Beryciformes) Soldaten- und Husarenfische (Holocentridae) Unterordnung Berycoidei Schleimköpfe (Berycidae) Großschuppenfische (Melamphaidae) Unterordnung Dornfischähnliche (Stephanoberycoidei) Barbourisiidae Rotmäulige Walkopffische (Rondeletiidae) Walköpfe (Cetomimidae) Gibberichthyidae Hispidoberycidae Dornfische (Stephanoberycidae) Ordnung Trachichthyiformesmini|Anoplogaster cornuta Laternenträger (Anomalopidae) Fangzahnfische (Anoplogastridae) Silberköpfe (Diretmidae) Tannenzapfenfische (Monocentridae) Sägebäuche (Trachichthyidae) Unterdivision Barschverwandte (Percomorpha) Ordnung Eingeweidefischartige (Ophidiiformes) Acanthonidae Brotulidae Bartmännchen (Ophidiidae) Eingeweidefische (Carapidae) Lebendgebärende Brotulas (Bythitidae)