Vor der Kreisgebietsreform am 1. Juli 1972 gliederte sich der Regierungsbezirk Niederbayern in 4 Stadtkreise und 22 Landkreise.
Stadtkreise Landshut Passau Straubing Deggendorf (heute Große Kreisstadt im Landkreis Deggendorf)
Landkreise Bogen: heute Landkreise Deggendorf und Straubing-Bogen (Hauptteil) Deggendorf Dingolfing: heute Landkreis Dingolfing-Landau Eggenfelden: heute Landkreise Dingolfing-Landau, Passau und Rottal-Inn (Hauptteil) Grafenau: heute Landkreis Freyung-Grafenau Griesbach: heute Landkreise Passau (Hauptteil) und Rottal-Inn Kelheim Kötzting: heute Landkreise Cham in der Oberpfalz (Hauptteil) und Regen Landau an der Isar: heute Landkreise Deggendorf und Dingolfing-Landau (Hauptteil) Landshut Mainburg: heute Landkreise Freising in Oberbayern, Kelheim (Hauptteil), Landshut und Pfaffenhofen an der Ilm in Oberbayern Mallersdorf: heute Landkreise Dingolfing-Landau, Landshut, Regensburg in der Oberpfalz und Straubing-Bogen (Hauptteil) Passau Pfarrkirchen: heute Landkreis Rottal-Inn Regen Rottenburg an der Laaber: heute Landkreise Kelheim, Landshut (Hauptteil) und Regensburg in der Oberpfalz Straubing: heute Landkreis Straubing-Bogen (Hauptteil) und kreisfreie Stadt Straubing Viechtach: heute Landkreis Regen Vilsbiburg: heute Landkreise Dingolfing-Landau, Landshut (Hauptteil) und Rottal-Inn Vilshofen: heute Landkreise Deggendorf und Passau (Hauptteil) Wegscheid: heute Landkreis Passau Wolfstein (Verwaltungssitz Freyung): heute Landkreis Freyung-Grafenau
Anmerkung: Bis 1954 wurden die Regierungsbezirke Niederbayern und Oberpfalz gemeinsam verwaltet.
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