Eine RING-Fingerdomäne (kurz für Really Interesting New Gene) ist eine Proteindomäne vom Typ Zinkfinger, die ein C3HC4-Aminosäuremuster enthält. Dieses Motiv (sieben Cysteinreste und ein Histidinrest, die nicht aufeinanderfolgend angeordnet sind) bindet zwei Zink-Kationen. Diese Proteindomäne umfasst 40 bis 60 Aminosäuren. Viele Proteine mit einer RING-Finger spielen eine zentrale Rolle in der Ubiquitinierung. Umgekehrt stellen Proteine mit RING-Fingerdomänen die größte Klasse von Ubiquitin-Ligasen im menschlichen Genom dar.
Funktion Viele RING-Fingerdomänen binden gleichzeitig Ubiquitinierungsenzyme und deren Substrate und fungieren daher als Ligasen. Die Ubiquitinierung wiederum markiert das Substratprotein für den Abbau.
Meiotische Rekombination Während der Meiose fördert das Crossing-over zwischen homologen Chromosomen (Homologen) eine präzise Chromosomensegregation. Bei Säugetieren unterstützen die RING-Domänen-Proteine RNF212, HEI10 und RNF212B das Crossing-over zwischen den einzelnen Homologenpaaren im Verlauf der Meiose. Studien an der Maus haben gezeigt, dass diese Crossing-over-fördernden RING-Domänen-Proteine zwar unterschiedliche, aber voneinander abhängige Funktionen bei der Ermöglichung der homologen Rekombination und der DNA-Reparaturprozesse – die zu Crossovers führen – wahrnehmen.
Struktur Die RING-Fingerdomäne besitzt die Konsensussequenz C-X2-C-X[9–39]-C-X[1–3]-H-X[2–3]-C-X2-C-X[4–48]-C-X2-C. Dabei gilt: C ist ein konservierter Cysteinrest, der an der Koordination des Zinkions beteiligt ist, H ist ein konservierter Histidinrest, der an der Koordination des Zinkions beteiligt ist, Zn steht für Zink und X steht für einen beliebigen Aminosäurerest.
mini|hochkant=1.8|links|Schematische Darstellung der Sequenz der RING-Fingerdomäne (nach Borden et al., modifiziert)|klasse=skin-invert-image
Beispiele Beispiele für menschliche Gene, die Proteine mit einer RING-Fingerdomäne kodieren, sind:
AMFR, BARD1, BBAP, BFAR, BIRC2, BIRC3, BIRC7, BIRC8, BMI1, BRAP, BRCA1, CBL, CBLB, CBLC, CBLL1, CHFR, CNOT4, COMMD3, DTX1, DTX2, DTX3, DTX3L, DTX4, DZIP3, HCGV, HLTF, HOIL-1, IRF2BP2, LNX1, LNX2, LONRF1, LONRF2, LONRF3, MARCH1, MARCH2, MARCH3, MARCH4, MARCH5, MARCH6, MARCH7, MARCH8, MARCH9, MARCH10, MDM2, MEX3A, MEX3B, MEX3C, MEX3D, MGRN1, MIB1, MID1, MID2, MKRN1, MKRN2, MKRN3, MKRN4, MNAT1, MYLIP, NFX1, NFX2, PCGF1, PCGF2, PCGF3, PCGF4, PCGF5, PCGF6, PDZRN3, PDZRN4, PEX10, PHRF1, PJA1, PJA2, PML, PML-RAR, PXMP3, RAD18, RAG1, RAPSN, RBCK1, RBX1, RC3H1, RC3H2, RCHY1, RFP2, RFPL1, RFPL2, RFPL3, RFPL4B, RFWD2, RFWD3, RING1, RNF2, RNF4, RNF5, RNF6, RNF7, RNF8, RNF10, RNF11, RNF12, RNF13, RNF14, RNF19A, RNF20, RNF24, RNF25, RNF26, RNF32, RNF38, RNF39, RNF40, RNF41, RNF43, RNF44, RNF55, RNF71, RNF103, RNF111, RNF113A, RNF113B, RNF121, RNF122, RNF123, RNF125, RNF126, RNF128, RNF130, RNF133, RNF135, RNF138, RNF139, RNF141, RNF144A, RNF145, RNF146, RNF148, RNF149, RNF150, RNF151, RNF152, RNF157, RNF165, RNF166, RNF167, RNF168, RNF169, RNF170, RNF175, RNF180, RNF181, RNF182, RNF185, RNF207, RNF213, RNF215, RNFT1, SH3MD4, SH3RF1, SH3RF2, SYVN1, TIF1, TMEM118, TOPORS, TRAF2, TRAF3, TRAF4, TRAF5, TRAF6, TRAF7, TRAIP, TRIM2, TRIM3, TRIM4, TRIM5, TRIM6, TRIM7, TRIM8, TRIM9, TRIM10, TRIM11, TRIM13, TRIM15, TRIM17, TRIM21, TRIM22, TRIM23, TRIM24, TRIM25, TRIM26, TRIM27, TRIM28, TRIM31, TRIM32, TRIM33, TRIM34, TRIM35, TRIM36, TRIM38, TRIM39, TRIM40, TRIM41, TRIM42, TRIM43, TRIM45, TRIM46, TRIM47, TRIM48, TRIM49, TRIM50, TRIM52, TRIM54, TRIM55, TRIM56, TRIM58, TRIM59, TRIM60, TRIM61, TRIM62, TRIM63, TRIM65, TRIM67, TRIM68, TRIM69, TRIM71, TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIML1, TTC3, UHRF1, UHRF2, VPS11, VPS8, ZNF179, ZNF294, ZNF313, ZNF364, ZNF451, ZNF650, ZNFB7, ZNRF1, ZNRF2, ZNRF3, ZNRF4 und ZSWIM2.
Datenbanklinks Pfam: PF00097 Pfam Clan: CL0229 Evolutionary Classification of Protein Domains (ECOD): 376.1.1 InterPro IPR001841 Simple Modular Architecture Research Tool (SMART): SM00184 PROSITE: PDOC00449 Structural Classification of Proteins database (SCOP2): 1chc / SCOPe / SUPFAM
Weblinks
Dieser Artikel enthält Text aus den gemeinfreien Datenbanken Pfam und InterPro: IPR001841.
Einzelnachweise
Kategorie:Proteinstrukturmotiv