thumb|Ontploffing van de Zandpoort in Mechelen
Het jaar 1546 is het 46e jaar in de 16e eeuw volgens de christelijke jaartelling.
Gebeurtenissen juni 7 juni - Verdrag van Ardres: Einde van de Italiaanse Oorlog: Hendrik VIII van Engeland behoudt Boulogne tot 1554, en zal het daarna teruggeven aan Frankrijk voor 2 miljoen ecus. 30 - De Index van Leuven krijgt kracht van wet door keizerlijk edict, waarvan de eerste bepaling de theologiefaculteit machtigt om boeken "te reproberen, doemen en suspect te verklaren".
juli 4 - Huwelijk van Albrecht van Beieren en Anna van Oostenrijk. 18 - Huwelijk van Willem V van Kleef en Maria van Oostenrijk. 20 - Begin van de Schmalkaldische Oorlog tussen het Heilige Roomse Rijk en het Schmalkaldisch Verbond van protestantse Duitse vorsten.
augustus 6 - Ontploffing van de Zandpoort: Een ontploffing van een kruitmagazijn in Mechelen eist meer dan 200 slachtoffers.
november 3 - Keizer Karel V confisqueert na de eerste nederlagen van het Schmalkaldisch Verbond het graafschap Tecklenburg inclusief Lingen, en beleent er zijn stadhouder Maximiliaan van Egmont mee.
december december - Thomas Howard wordt opgesloten in de Tower op verdenking van hoogverraad.
zonder datum Basra wordt door de Turken ingenomen. Gonzalo Pizarro verslaat en doodt onderkoning Blasco Núñez Vela van Peru en roept zichzelf uit tot onderkoning. Op het Concilie van Trente wordt de Vulgaat als officiële Bijbelvertaling bevestigd. Oprichting van het Trinity College aan de Universiteit van Cambridge. Anhalt-Dessau wordt verdeeld in Anhalt-Zerbst, Anhalt-Plötzkau en Anhalt-Dessau. Juan de Tolosa sticht de stad Zacatecas
Literatuur Georgius Agricola: De natura fossilium Alonso Mudarra: Tres libros de música en cifra para vihuela Petrus Phalesius (uitgever): Carminum quae chely vel testudine canuntur, trium, quatuor, et quinque partium... François Rabelais: Le tiers livre
Beeldende kunst
Opvolging Ayutthaya - Chairacha opgevolgd door Kaeofa patriarch van Constantinopel - Joannicus I als opvolger van Jeremias I, op zijn beurt opgevolgd door Dionysius II Dominicanen (magister-generaal) - Francesco Romeo als opvolger van Alberto de las Casas Brunswijk-Lüneburg - Ernst opgevolgd door zijn zoon Frans Otto Milaan (gouverneur) - Alfonso d'Avalos opgevolgd door Ferrante Gonzaga Moldavië - Peter IV Rareș opgevolgd door zijn zoon Ilie II Rareș Sicilië (onderkoning) - Ferrante Gonzaga opgevolgd door Ambrogio Santapace Vietnam - Mac Hien Tong opgevolgd door zijn zoon Mac Phuc Nguyen onder regentschap van diens oom Mac Kinh Dien
Afbeeldingen
Geboren 27 januari - Joachim Frederik, keurvorst van Brandenburg 13 februari - Henricus Antonides Nerdenus, Nederlands predikant 21 maart - Bartholomeus Spranger, Zuid-Nederlands kunstschilder 29 maart - Annas de Perusse-d'Escars de Givry, Frans kardinaal 14 juni - Wolfgang van Hohenlohe-Weikersheim, Duits edelman 29 juni - Dorothea van Denemarken, Deens prinses 4 juli - Murat III, sultan van het Ottomaanse Rijk (1574-1595) juli - Godevaert van Haecht, Zuid-Nederlands dagboekschrijver 11 september - Arild Huitfeldt, Deens historicus 5 oktober - Rudolph Snel van Royen, Nederlands wiskundige 14 december - Tycho Brahe, Deens astronoom Adrien Baltyn, Zuid-Nederlands historicus William Barclay, Schots rechtsgeleerde Dirck Outgaertsz. Cluyt, Nederlands apotheker Hendrik van Cuyk, Zuid-Nederlands prelaat Jan David, Zuid-Nederlands schrijver Levinus Hulsius, Nederlands instrumentenmaker Katharina Kepler, moeder van Johannes Kepler Lodrö Gyatso, Tibetaans geestelijk leider Cornelius Loos, Nederlands theoloog Francesco de Mendoza, Spaans legerleider Takeda Katsuyori, Japans daimyo Feijo Sickinghe, Nederlands edelman en politicus Jan Baptist van Tassis, Spaans legerleider Jan Verdonck, Zuid-Nederlands componist (jaartal onzeker) Jacob Blasaeus, Zuid-Nederlands prelaat (jaartal bij benadering) Charlotte van Bourbon, echtgenote van Willem van Oranje (jaartal bij benadering) Cornelis Claesz, Nederlands drukker (jaartal bij benadering) Lodewijk Elsevier, Zuid-Nederlands uitgever (jaartal bij benadering)
Overleden 11 januari - Ernst I van Brunswijk-Lüneburg (48), Duits edelman 21 januari - Azai Sukemasa (~52), Japans daimyo 18 februari - Maarten Luther (62), Duits theoloog en kerkhervormer 23 februari - Frans van Bourbon-Condé (26), Frans edelman 1 maart - George Wishart (~32), Schots kerkhervormer 10 maart - Thomas Elyot (~46), Engels wetenschapper 10 maart - Adrianus Thiebault (~49), Zuid-Nederlands componist 4 april - Ruy López de Villalobos, Spaans ontdekkingsreiziger 17 mei - Philipp von Hutten (40), Duits conquistador 14 juli - Petrus Bonomo (~88), Italiaans prelaat 18 juli - Willem van Rennenberg, Duits edelman 1 augustus - Peter Faber (40), Savoyaards theoloog 3 augustus - Antonio da Sangallo (62), Italiaans architect 12 augustus - Francisco de Vitoria (~63), Spaans theoloog 3 september - Peter IV Rareș, woiwode van Moldavië (1527-1538, 1541-1546) 6 september - Johannes Kleberger (~60), Duits filantroop 14 september - Margareta van Bronkhorst-Batenburg (28), Noord-Nederlands edelvrouw 28 september - Marino Grimani (~58), Italiaans kardinaal 1 november - Giulio Romano (~47), Italiaans kunstschilder en architect november - Francisco de Orellana (~35), Spaans conquistador 13 december - Syds Tjaerda (~53), Fries edelman Nicolaus Archius (~53), Italiaans dichter Chairacha, koning van Ayutthaya (1533-1546) Anton van Croÿ-Chimay, Duits edelman Khair ad-Din (~71), Albanees-Ottomaans vloothoofd en piraat Jasper Lievenz van Hoogelande (~64), Noord-Nederlands jurist Roelof van Lennep, Noord-Nederlands staatsman Mac Hien Tong, keizer van Vietnam (1540-1546) Oswald II van den Bergh (~38), Nederlands edelman Blasco Núñez Vela, onderkoning van Peru Isabella di Morra, Italiaans dichteres (jaartal bij benadering) Marinus van Reymerswale, Noord-Nederlands kunstschilder (jaartal bij benadering)