RasMol ist eine Software für die molekulare Modellierung. Sie erlaubt, Makromoleküle grafisch darzustellen, beispielsweise wie in der Protein Data Bank. Ursprünglich wurde das Programm von Roger Sayle in den frühen 1990er-Jahren entwickelt, heute wird es von einer Community am ARCiB laboratory weiterentwickelt. In Frankreich wurde das Programm durch das Bildungsministerium empfohlen und im Unterricht an Universitäten, Fachhochschulen und Oberstufen der Schulen eingesetztMolecular Modeling mit RasMol von Andreas Bohne und Henryette Roth. mini|Beispiel eines Moleküls (TRAF2 trimer PDB:1DOA) in Rasmol Historisch gesehen war es ein wichtiges Instrument für Molekularbiologen, da das Programm es früh ermöglichte, Moleküle auf den damaligen Heimcomputern zu visualisieren. Weil RasMol bereits auf diesen Computern lauffähig war und keine Großrechner benötigte, die wegen ihrer hohen Anschaffungskosten nicht beliebig zur Verfügung standen, wurde RasMol ein wichtiges Forschungsinstrument in der Molekularbiologie Universität zu Köln TU Darmstadt und ist es immer noch Universität Ulm chemistryteaching.com.
RasMol hat eine komplexe Versionsgeschichte und steht ab der Version 2.7 unter einer Duallizenz (GPL oder unter kommerzieller Lizenz „RASLIC“). RasMol ist neben BALLView, Avogadro, Molekel, Jmol und PyMOL ein Open-Source-Programm, das Moleküle visualisieren kann. RasMol verfügt über eine eigene Skriptsprache, die von Jmol übernommen wurde – somit laufen RasMol-Scripte auch unter Jmol. Rasmol-Scripte können auch von SIRIUS ausgelesen werden.
RasMol ist sowohl unter Unix-Systemen als auch unter Windows verfügbar. Unter UNIX kann es mit anderen Programmen via Tcl/Tk kommunizieren, unter Windows via Dynamic Data Exchange (DDE).
Entwicklung Mittlerweile wird die Software kaum noch weiter entwickelt und die Nutzerzahlen gehen stark zurück.Craig PA, Michel LV, Bateman RC.: A survey of educational uses of molecular visualization freeware. In: Biochem Mol Biol Educ. 2013 May-Jun;41(3):193-205. doi:10.1002/bmb.20693. PMID 23649886; .
Ähnliche Software Avogadro Chemcraft
Weblinks Handbuch (englisch) National Science Foundation
Einzelnachweise
Kategorie:Freie Chemiesoftware