mini|Genom von DHSV-1 (Ispindelvirus danakilense; Xigoviridae) und DNSV-1 (Gomizavirus danakilense) mini|Genom-Vergleich der spindelförmigen Viren der Danakil-Depression mit ihren nächsten Verwandten: DNSV1 mit DNSV2 und SNSV1. Homologe Gene (>25 % Identität) wurden mit der gleichen Farbe hervorgehoben und durch Schattierungen miteinander verbunden. Lomiviridae ist die Bezeichnung einer eine Familie spindelförmiger Archaeenviren, die monotypisch als einziges die Gattung Gomizavirus enthält, deren beide Gründungsmitglieder DNSV1 und DNSV2 im/am Karumsee (alias Lake Assala), einem Salzsee im Norden der Danakil-Depression in Äthiopien (Afar-Region) gefunden wurden. Diese Viren werden als bezeichnet; offenbar wird eine Morphologie ähnlich wie in der Familie Bicaudaviridae mit einem oder zwei derartigen „Schwänzen“ angenommen. Ihre Wirte sind halophile Archaeen.
Beschreibung Metagenomik-Analysen von Proben aus der Danakil-Depression (Senke) in Äthiopien lieferten u. a. MAGs (vollständige oder nahezu vollständige) Genom-Sequenzen einer Reihe von Archaeenviren, darunter das zirkuläre Genom von Danakil Halobacteriales spindle-shaped virus 1 (DHSV1, neue Spezies Ispindelvirus danakilense, Familie Xigoviridae) mit einer Länge von 9.045 bp lang, während die Genome Danakil Nanohaloarchaeota tailed virus 1 und 2 (DNSV1 bzw. DNSV2), beide neue Gattung Gomizavirus, Familie Lomiviridae, sich mit 22.062 bp respektive 20.830 bp als etwa doppelt so groß erwiesen. Alle drei Viren haben nur wenige Gene mit anderen zur Zeit ihrer Entdeckung bekannten Viren gemeinsam, kodieren aber Homologe für spindelförmige Archaeenviren spezifischen (mutmaßlichen) Hauptkapsidproteins. Um die Verwandtschaft zwischen DHSV1, DNSV1 und DNSV2 sowie dem verwandten Virus aus der IMG/VR-Datenbank (SNSV1 alias SNSV-1); Ga0307790_1000112 und weiteren zuvor charakterisierten spindelförmigen Viren zu untersuchen, führten wurden proteomweite Vergleiche mit ViPTree durchgeführt. Diese Analyse bestätigte die Monophylie der zuvor etablierten Familien spindelförmiger Viren und legte nahe, dass DHSV1 einerseits und DNSV1/DNSV2/SNSV1 andererseits zwei Verwandtschaftsgruppen (Kladen) bilden. Diese Erkenntnisse gaben dann Anlass zur Einrichtung zweier neuer Familien für diese beiden Virusgruppen. Obwohl DNSV1 und DNSV2 sich als nur als entfernt verwandt zeigten, wurden sie vorerst derselbe Gattung zugewiesen, bis weitere Vertreter identifiziert und charakterisiert sind.
Systematik Die Systematik der Familie Lomiviridae ist mit Stand 11. April 2026 wie folgt:
Familie Lomiviridae Gattung Gomizavirus (veraltet „Danakil Nanohaloarchaeota spindle-shaped virus“, DNSV) Spezies: Gomizavirus assalense Danakil Nanohaloarchaeota spindle-shaped virus 2 (DNSV2: PQ827564)– Fundort: Metagenom aus dem hypersalinen See Assala in der Koba-Senke am Nordende der Danakil-Depression (Äthiopien)– Genomlänge: 22.062 bp Spezies: Gomizavirus danakilense Danakil Nanohaloarchaeota spindle-shaped virus 1 (DNSV1: PQ827563)– Fundort: ebenda– Genomlänge: 20.830 bp Spezies Ga0307790_1000112 SNSV1 SNSV-1
Etymologie Die Namensherkunft der Bezeichnungen ist wie folgt:
Die Bezeichnung der Familie Lomiviridae geht zurück auf , , ein Verweis auf die zitronen- oder spindelförmige Morphologie dieser Viruspartikel, gefolgt von der Virusfamilien kennzeichnenden Endung .
Die Bezeichnung der Gattung Gomizavirus geht zurück auf . Das Art-Epitheton danakilense ist neu, eine latinisierte Form mit der Bedeutung ‚vom Danakil‘ oder ‚zum Danakil gehörig‘ und verweist damit auf den Fundort, von dem dieser isolierte bzw. sequenzierte Vertreter stammt. Das Art-Epitheton assalense ist ebenfalls neu mit der Bedeutung ‚vom (See) Assala‘ oder ‚zum (See) Assala gehörig‘, wiederum ein Verweis auf den Fundort, von dem dieser isolierte bzw. sequenzierte Vertreter stammt.
Anmerkungen
Weiterführende Literatur Yifan Zhou, Ana Gutiérrez-Preciado, Ying Liu, David Moreira, Michail M. Yakimov, Purificación López-García, Mart Krupovic: Nested parasitism in hypersaline environments: viruses and virus satellites of haloarchaea and their nanosized cellular symbionts. Auf: bioRχiv vom 15. Februar 2025; ()
Einzelnachweise ICTV: Master Species Lists (MSL). Abgerufen am 9. April 2026. ICTV: Virus Metadata Resource (VMR). Abgerufen am 9. April 2026. ICTV: 2025.005A.Spindle-shaped_viruses_2nf_3ns. Mit: 2025.005A.Spindle-shaped_viruses_2nf_3ns.docx. NCBI Nuccleotide: Danakil Nanohaloarchaeota spindle-shaped virus isolate DNSV-2, Accession: PQ827564. NCBI : Danakil Nanohaloarchaeota spindle-shaped virus isolate DNSV-1, Accession: PQ827563.
Kategorie:Virusfamilie Kategorie:Archaeenvirus