Patescibacteriia

Candidatus Patescibacteriia (früher auch ABY1-Gruppe) ist eine vielfältige Klasse von Bakterien, deren Ihre Mitglieder sich durch eine selbst für Prokaryoten extrem kleiner Zellgröße, ein reduziertes Genom, begrenzte Stoffwechsel­kapazitäten und die Abhängigkeit von anderen prokaryotischen Wirten auszeichnen.

Der Begriff ist zu unterscheiden von „Patescibacteria“ (mit einem eimzelnen ‚i‘ jeweils in der Mitte und gegen Ende, korrigiert zu „Ca. Patescibacteriota“) für die enthaltende Bakterienklade (heute Phylum Minisyncoccota).

Mit Stand Ende 2025 gab es noch keine gültige Beschreibung (inklusive Kultivierung – d. h. hier Co-Kultivierung) eines Mitglieds dieser Verwandtschaftsgruppe (Klade) nach den Regeln des Internationalen Kodex für die Nomenklatur von Prokaryoten (, ICNP). Um die Jahreswende 2025/25 beschrieben Zuzanna Dutkiewicz, Philip Hugenholtz, Christian Rinke et al. immerhin eine nahezu vollständige Gensequenz (ABY1ᵀˢ), die eine Art Patescibacterium danicum nach den Regeln des SeqCode repräsentiert, die ihrerseits nach diesen Regeln als Typus für die Klasse und die in der Rangstufe dazwischenliegenden Taxa dient. Da der SeqCode mit den Regeln des ICNP nicht kompatibel ist, werden diese Taxa in der (LPSN) mit Kandidaten­status geführt.

Phylogenetische Analysen bestätigen nach „Rangnormalisierung“ eine stabile Einordnung von „Ca. P. danicum“ᵀˢ in die früher so bezeichnete Klasse ABY1 alias „Ca. Patescibacteria“ (heute korrigiert zu „Ca. Patescibacteriia“) Das durch diese Bakterien repräsentierte Phylum (Abteilung, ) wurde früher als CPR-Gruppe oder Ca. Patescibacteria (mit nur einem ‚i‘ am Ende) bezeichnet. Die Autoren schlugen auch vor, dieses nun mit korrekten Suffix „Patescibacteriota“ zu nennen, was aber alsbald durch von der (co-)kultivierten Spezies Minisyncoccus archaeiphilus (Klasse Minisyncoccia) abgeleitete ICNP-Bezeichnung Minisyncoccota ersetzt wurde.

Die Analysen von Dutkiewicz et al. bestätigten nochmals die kleinen Genomgrößen – kleiner als 1 Mbp (Megabasenpaar); einen niedrigen GC-Gehalt (jedoch > 36 %) und das Vorkommen langer Gen-kodierender Insertionen in den 23S-rRNA-Sequenzen; zusammen mit dem reduzierten Stoffwechsel­potenzial (aufgrund der vermutlich symbiotischen Lebensweise); sowie und die globalen Verbreitung dieser Bakterien (als Kosmopoliten).

Die taxonomische Rangstufe der älteren Mitglieds-Ordnung und wurden früher höher angesetzt (meist als Phyla, s. u.).entsprechend das enthaltende Phylum Minisyncoccota selbst als „Superphylum“ CPR ()

Systematik

Die (auszugsweise) Systematik der Klasse ist mit Stand 3. März 2026 wie folgt:

Klasse „Ca. Patescibacteriia“ et al. 2025(L,G) [Microgenomatia(G), c__ABY1(G°)] ​Klade (Ordnung?) „Brownbacteria“ – früher Phylum „Ca. Browniibacteriota“ corrig. et al 2017 [„Ca. Brownbacteria“ et al. 2017](L°) – abgetrennt von „Ca. Uhrbacterales“ [o__SG8-24(G)] Familie und Gattung nicht zugewiesen Spezies „Ca. Brownbacteria X1_MetaBAT.2“ Spezies „Ca. Brownbacteria X3_MetaBAT.20“ Spezies „Ca. Brownbacteria Y2_MetaBAT.18“ Spezies „Ca. Brownbacteria Y4_MetaBAT.36“ ​Ordnung „Ca. Buchananbacterales“(G) – früher Phylum „Ca. Buchananiibacteriota“ corrig. et al. 2016 [„Ca. Buchananbacteria“ et al. 2016](L°,N) Familie f__21-14-0-10-42-9(G) Gattung 21-14-0-10-42-9(G) Spezies 21-14-0-10-42-9 sp002773845(G) [Ca. Buchananbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_42_9(N,G)] Familie f__SURF-54(G) Gattung JAHIRB01(G) Gattung SURF-54(G) Spezies SURF-54 sp003599635(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate SURF_54(N,G)] Familie …(G) ​Ordnung „Jacksonbacterales“(G°) [o__UBA9629(G)] – früheres Phylum „Ca. Jacksoniibacteriota“ corrig. et al. 2016 [„Ca. Jacksonbacteria“ et al. 2016](L°,N) Familie f__UBA9629(G) Gattung JBBTVS01(G) Gattung UBA9629(G) Spezies UBA9629 sp001818235(G) [Ca. Jacksonbacteria bacterium RIFOXYB2_FULL_44_15(N,G)] Gattung UBA9645(G) Spezies UBA9645 sp001818155(G) [Ca. Jacksonbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_02_FULL_44_20(N,G)] ​Ordnung „Kerfeldbacterales“(G°) [o__SBBC01(G)] – früheres Phylum „Ca. Kerfeldiibacteriota“ corrig. et al. 2016 [„Ca. Kerfeldbacteria“ et al. 2016](L°,N) Familie f__SBBC01(G) Gattung Microgenomatus_A(G) Spezies Microgenomatus_A auricola_A – mit Stamm Bin_28_1_1(G) Gattung CAINXF01(G) Spezies CAINXF01 sp903854795(G) [Ca. Kerfeldbacteria bacterium isolate AlinenSediments_bin-3800(N,G)] Gattung JACQKH01(G) Gattung JACQPYOI(G) Familie …(G) ​Ordnung „Komeilibacterales“(G°) [o__UBA1558(G)] – früheres Phylum „Ca. Komeiliibacteriota“ corrig. et al. 2016 [„Ca. Komeilibacteria“ et al. 2016, „Komelilbacteria“](L°,N) Familie f__2-01-FULL-52-15(G) Gattung 2-01-FULL-52-15(G) Spezies 2-01-FULL-52-15 sp001818365(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_01_FULL_52_14(N,G)] Gattung JACQKJ01(G) Spezies JACQKJ01 sp016204595(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium isolate NC_groundwater_1174_Ag_S-0.1um_52_33(N,G)] Gattung …(G) Familie f__GWA2-36-10 Gattung BM519(G) Spezies BM519 sp002869235(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate BM519(N,G)] Gattung GWA2-36-10(G) Gattung JACKFO01(G) Spezies JACKFO01 sp020632415(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate HK-STAS-PATE-4(N,G)] (verschoben) Gattung UM-FILTER-36-13(G) Spezies UM-FILTER-36-13 sp002787405(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium CG11_big_fil_rev_8_21_14_0_20_36_20(N,G)] Gattung XYD1-37-29(G) Spezies XYD1-37-29 sp001818495(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium RIFOXYD1_FULL_37_29(N,G)] Gattung …(G) Familie f__S5-K13(G) Gattung S5-K13(G) Spezies S5-K13 sp019248485(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium S5_K13(N,G)] Gattung …(G) Familie f__UBA10009(G) Gattung 2-01-FULL-45-10-B(G) Spezies 2-01-FULL-45-10-B sp001818835(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium RIFCSPLOWO2_01_FULL_45_10(N,G)] Gattung UBA10009(G) Spezies UBA1558 sp002785295(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium CG_4_10_14_0_8_um_filter_37_78(N,G)] Gattung …(G) Familie f__UBA1558(G) Gattung UBA1558(G) Gattung UM-FILTER-37-10(G) Spezies UM-FILTER-37-10 sp002793075(G) [Ca. Komeilibacteria bacterium CG_4_10_14_0_2_um_filter_37_10(N,G)] Gattung …(G) Familie …(G) ​Ordnung „Kuenenbacterales“(G°) [o__UBA2196(G)] – früheres Phylum „Ca. Kueneniibacteriota“ corrig. et al. 2015 [„Ca. Kuenenbacteria“ et al. 2015](L°,N) Familie f__GWA2-42-15(G) Gattung 2-02-FULL-39-13(G) Spezies 2-02-FULL-39-13 sp001783595(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium RIFCSPHIGHO2_02_FULL_39_13(N,G)] Gattung GCA-002787375(G) – GCA-002787375 sp002778965(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium CG08_land_8_20_14_0_20_37_23(N,G)] Gattung GWA2-42-15(G) Spezies GWA2-42-15 sp000998185(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium GW2011_GWA2_42_15(N,G)] Gattung JAAZMX01(G) Spezies JAAZMX01 sp012797775(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium isolate AS27yjCOA_59(N,G)] Gattung …(G) Familie f_S139-112(G) Familie f_UBA2196(G) Gattung 1-14-0-10-36-11(G) Spezies 1-14-0-10-36-11 sp002778535(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_36_11(N,G)] Gattung UBA2196(G) Gattung …(G) ​Ordnung „Ca. Magasanikbacterales“(G) – früheres Phylum „Ca. Magasanikiibacteriota“ corrig. et al. 2015 [„Ca. Magasanikbacteria“ et al. 2015](L°,N) Familie f__2-02-FULL-50-9b(G) Gattung 2-02-FULL-50-9b(G) Familie f__GWA2-37-8(G) Familie f__JACTTX01(G) Familie f__UBA10003(G) Familie f__UBA10146(G) Familie f__UBA10197(G) Familie f__UBA922(G) Gattung 1-14-0-20-39-34 Spezies 1-14-0-20-39-34 sp020632445(G) [Ca. Nomurabacteria bacterium isolate HK-STAS-PATE-1(N,G)] (verschoben) Gattung BM521 Spezies BM521 sp002869205(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate BM521(N,G)] Gattung …(G) Familie …(G) ​Ordnung „Moisslbacterales“(G°) [o__UBA2591(G)] – früheres Phylum „Ca. Moissliibacteriota“ corrig. et al. 2018 [ „Ca. Moisslbacteria“ et al. 2018](L°) Familie f__JABMQE01(G) – abgetrennt von „Falkowbacterales“ [o__BM507, „Ca. Patescibacteriales“] Gattung JABMQE01(G) Spezies JABMQE01 sp013203415(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate bin.303(N,G)] Gattung JAHIMF01(G) Familie f__PGYQ01(G) – abgetrennt von „Kuenenbacterales“ [o__UBA2196] Gattung PGYQ01(G) Spezies PGYQ01 sp016209005(G) [Ca. Kuenenbacteria bacterium isolate NC_groundwater_1502_Pr4_B-0.1um_29_5(N,G)] Familie f__UBA2591(G) Gattung UBA2591(G) Spezies UBA2591 sp002339755(G) [Patescibacteria group bacterium UBA2591(N,G)] Spezies UBA2591 sp002339755(G) [Ca. Paceibacter sp. isolate AfrMine_MM5_33_1146(N,G)] (verschoben) Familie …(G) ​Ordnung „Ca. Patescibacteriales“ et al. 2025(L,G) [„Ca. Falkowbacterales“(G°), o__BM507(G°)] – inkl. früheres Phylum „Ca. Falkowiibacteriota“ corrig. et al. 2015 [„Ca. Falkowbacteria“ et al. 2015](L°,N) Familie „Ca. Patescibacteriaceae“ et al. 2025(L,G) Gattung „Ca. Patescibacterium“ et al. 2025(L,G) Spezies „Ca. Patescibacterium danicum“ et al. 2025(L,G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate Mari_18-Q3-R65-66_BAT3C.341_fly chromosome(N,G)] – mit Stämmen ABY1TS(L), Fred.cMAG.1 und Mari_18-Q3-R65-66_BAT3C.341_fly(G) Spezies Patescibacterium sp002344425(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium UBA2355(N,G)] Spezies Patescibacterium sp026396835(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate LacPavin_0818_WC55_MAG_36_20(N,G)] Spezies Patescibacterium sp030583705(G) [Patescibacteria group bacterium isolate cMAG.25(N,G)] Spezies Patescibacterium sp035438725(G) [Bacterium isolate AMR_MDS_5567(N,G)] Spezies Patescibacterium sp937868555(G) [Uncultured bacterium isolate SRR5676451_bin.83_CONCOCT_v1.1_MAG(N,G)] Gattung 1-14-0-10-37-14(G) Spezies 1-14-0-10-37-14 sp002778705(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_37_14(N,G)] Gattung UBA1359(G) Spezies UBA1359 sp002306385(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium UBA1359(N,G)] Gattung UBA917(G) Spezies UBA917 sp002293855(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium UBA917(N,G)] Gattung …(G) Familie f__BM507(G) Gattung BM507(G) Spezies BM507 sp002869265(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate BM507(N,G)] Familie f__SZUA-104(G) Gattung AJVWV01(G) Gattung SZUA-104(G) Spezies SZUA-104 sp003231075(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate SZUA-104(N,G)] Familie f__GWC2-42-12(G) Gattung GWC2-42-12(G) Spezies GWC2-42-12 sp001778055(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium RIFCSPLOWO2_12_FULL_45_13(N,G)] Gattung …(G) Familie f__UBA12075(G) Gattung B7-G4(G) Spezies B7-G4 sp003647675(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate B7_G4(N,G)] Gattung BM705(G) Spezies BM705 sp002869165(G) [Ca. Parcubacteria bacterium isolate BM705(N,G)] Gattung XYA2-FULL-47-19(G) Spezies XYA2-FULL-47-19 sp001780275(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium RIFOXYA2_FULL_47_19(N,G)] Gattung XYC2-34-220(G) Spezies XYC2-34-220 sp001780285(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium RIFOXYD12_FULL_34_57(N,G)] Gattung UBA12075(G) Spezies UBA12075 sp003514005(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate UBA12426(N,G)] Gattung …(G) Familie f__UBA12465(G) Gattung CAINDR01(G) Spezies CAINDR01 sp903847415(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate Loclat_bin-10343(N,G)] Gattung CG1-02-41-21(G) Spezies CG1-02-41-21 sp001871235(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium CG1_02_41_21(N,G)] Gattung GCA-002840305(G) Spezies GCA-002840305 sp002840305(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium HGW-Falkowbacteria-1(N,G)] Gattung GCA-002841655(G) Spezies GCA-002841655 sp002841655(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium HGW-Falkowbacteria-2(N,G)] Gattung PWHG01(G) Spezies PWHG01 sp003554785(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium isolate T1Sed10_134(N,G)] Gattung UBA12465(G) Spezies UBA12465 sp000999715(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium GW2011_GWF2_43_32(N,G)] Gattung …(G) Familie f__UM-FILTER-36-11(G) Gattung UM-FILTER-36-11(G) Spezies UM-FILTER-36-11 sp002781265(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium CG02_land_8_20_14_3_00_36_14(N,G)] Familie f__XYC2-FULL-47-12(G) Gattung 1-14-0-10-43-10(G) Spezies 1-14-0-10-43-10 sp002773655(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_43_10(N,G)] Gattung 1-14-0-10-43-11(G) Spezies 1-14-0-10-43-11 sp002778635(G) [Ca. Falkowbacteria bacterium CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_43_11(N,G)] Gattung 2-12-FULL-45-10(G)