mini|hochkant=0.7|Synechocystis aquatilis mini|hochkant=0.7|Synechocystis aquatilis Synechocystis ist eine Gattung einzelliger Süßwasser-Cyanobakterien aus der Familie der Merismopediaceae. Sie umfasst eine (unbenannte) Spezies, Synechocystis sp. PCC 6803,NCBI: Synechocystis sp. PCC 6803 – tree und Synechocystis sp. PCC 6803 – detail (species) die ein gut untersuchter Modellorganismus ist.
Evolution Cyanobakterien sind photosynthetische Bakterien, die seit schätzungsweise 2,7 Milliarden Jahren auf der Erde existieren. Die Fähigkeit der Cyanobakterien, Sauerstoff zu produzieren, leitete den Übergang von einem Planeten mit hohem Kohlendioxidgehalt und wenig Sauerstoff zu einer Phase, die als Große Sauerstoffkatastrophe () bezeichnet wird, in der große Mengen an Sauerstoff produziert wurden. Cyanobakterien haben eine große Vielfalt an Lebensräumen besiedelt, darunter Süß- und Salzwasser-Ökosysteme und die meisten terrestrischen Umgebungen.
Phylogenetisch gesehen verzweigt sich Synechocystis später im evolutionären Stammbaum der Cyanobakterien, weit weg von der basalen Spezies Gloeobacter violaceus (, „Urwurzel“). Synechocystis ist nicht diazotroph (Stickstoff-fixierend), aber eng mit einem anderen Modellorganismus, Cyanothece ATCC 51442, verwandt, welches diazotroph ist. Daher wird vermutet, dass Synechocystis ursprünglich die Fähigkeit besaß, Stickstoffgas zu fixieren, aber später die Gene verloren hat, die erforderlich sind für ein voll funktionsfähiges Gencluster zur Stickstofffixierung (nif, ).
Systematik Gattung: Synechocystis , 1892LPSN: Genus SynechocystisNCBI: Synechocystis Sauvageau 1892 (genus); graphisch: Synechocystis, auf: Lifemap, NCBI Version. Spezies: Synechocystis aquatilis 1892 Spezies: „S. bourrellyi“ 1976nur bei NCBI, nicht in der LPSN Spezies: „S. fuscopigmentosa“ 1988 Spezies: „S. limnetica“ 1968 Spezies: „S. minuscula“ 1926 Spezies: „S. nigrescens“'Nom. inval.' (= nomen invalidum, = invalid name) Spezies: S. pevalekii 1925 Spezies: S. salina 1924 Spezies: S. trididemni 1979 Spezies: Synechocystis sp. PCC 6301 Spezies: Synechocystis sp. PCC 6803 Stamm: PCC 6803 A Stamm: PCC 6803 B Stamm: ATCC 27184 Stamm: GT-IY. Kanesaki,, Y. Shiwa, N. Tajima, M. Suzuki, S. Watanabe, N. Sato, M. Ikeuchi, H. Yoshikawa: Identification of substrain-specific mutations by massively parallel whole-genome resequencing of Synechocystis sp. PCC 6803, in: DNA Res Band 19, Nr. 1, S. 67-79, 2012, PMID 22193367GT: Glucose-tolerant Stamm: GT-SNaoyuki Tajima, Shusei Sato, Fumito Maruyama, Takakazu Kaneko, Naobumi V. Sasaki, Ken Kurokawa, Hiroyuki Ohta, Yu Kanesaki, Hirofumi Yoshikawa, Satoshi Tabata, Masahiko Ikeuchi, Naoki Sato: Genomic structure of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 strain GT-S, in: DNA Res Band 18, Nr. 5, S. 393-399, Oktober 2011, doi:10.1093/dnares/dsr026, PMID 21803841. Stamm: Kazusa Stamm: PCC-N Stamm: PCC-P
Die Spezies Synechocystis didemni 1975 wird heute in die Gattung Prochloron (ex 1977) et al. 1986LPSN: Genus Prochloron (ex 1977) et al. 1986, Genus Prochloron 1977NCBI: Prochloron (ex Lewin 1977) Florenzano et al. 1986 (genus); graphisch: Prochloron, auf: Lifemap, NCBI Version. gestellt mit gültigem Namen Prochloron didemni (ex 1977) et al. 1986.
Neben dem Referenzstamm von Synechocystis sp. PCC 6803 wurden weitere Modifikationen dieses Elternstamms geschaffen, wie z. B. ein Unterstamm apcE−, dem das Photosystem I (PS1, auf dem apcE-Gen) fehlt. PDF Ein anderer weit verbreiteter Unterstamm von S. sp. PCC 6803 ist ein glukosetoleranter Stamm mit Bezeichnung ATCC 27184 – der Elternstamm PCC 6803 kann keine externe Glukose verwerten.
Synechocystis sp. PCC 6803 mini|hochkant=0.8|Synechocystis sp. PCC 6803 im J-PhänomEin Phänom ist die Gesamtheit aller Phänotypen, die von einer Zelle, einem Gewebe, einem Organ, einem Organismus oder einer Spezies ausgedrückt werden. Analoge Bildung zu Genom, Proteom, Mitogenom/Chondriom, Plastom etc. Siehe Phänom, auf: spektrum.de, Lexikon der Biologie. mini|hochkant=0.8|Optischer Schnitt durch Zellen von Synechocystis sp. PCC 6803. Kantenlänge etwa 10 × 10 µm mini|hochkant=0.8|Synechocystis sp. PCC 6803 mini|hochkant=0.8|Synechocystis sp. PCC 6803
Eine ganze Reihe von Cyanobakterien sind Modellmikroorganismen für die Untersuchung der Photosynthese, der Kohlenstoff- und Stickstoffassimilation, der Evolution von Plastiden (Chloroplasten etc.) und der Anpassungsfähigkeit an Umweltstress. Synechocystis sp. PCC 6803 ist eine Linie einzelliger Süßwasser-Cyanobakterien der Gattung Synechocystis und wird vom NCBI als Spezies gelistet. S. sp. PCC 6803 ist eine der am besten untersuchten Arten von Cyanobakterien, denn diese Cyanobakterien sind sowohl zu autotrophem (phototrophem Wachstum durch Photosynthese während der Lichtperioden) als auch zu heterotrophem Wachstum durch Glykolyse und oxidative Phosphorylierung während der Dunkelperioden fähig (Mixotrophie). Der Photosyntheseapparat selbst ist dem von Landpflanzen sehr ähnlich. Der Organismus zeigt auch eine phototaktische Bewegung. Die Genexpression wird durch eine zirkadiane Uhr () reguliert, und der Organismus kann sich Übergänge zwischen den Licht- und Dunkelphasen effektiv einstellen. S. sp. PCC 6803 kann leicht exogene DNA aufnehmen, zusätzlich zur Aufnahme von DNA durch Elektroporation, Ultraschalltransformation und Konjugation.
Fundort Die Linie wurde 1968 aus einem Süßwassersee isoliert und wächst am besten zwischen 32 und 38 °C.
Kultivierung Synechocystis sp. PCC 6803 kann entweder auf Agarplatten oder in Flüssigkultur kultiviert werden. Das am weitesten verbreitete Kulturmedium ist eine BG-11-Salzlösung, wie es auch für Synechococcus elongatus und Gloeomargarita lithophora Verwendung findet. Der ideale pH-Wert liegt zwischen 7 und 8,5; eine Lichtintensität von 50 μmol Photonen m−2 s−1 (pro Quadratmeter und Sekunde) führt zu bestem Wachstum. Das Sprudeln mit kohlendioxidangereicherter Luft (1–2 % CO2) kann die Wachstumsrate erhöhen, erfordert aber möglicherweise zusätzliche Puffer zur Aufrechterhaltung des pH-Werts.
Die Selektion erfolgt typischerweise über Antibiotikaresistenzgene. Heidorn et al. 2011 ermittelten in S. sp. PCC 6803 experimentell die idealen Konzentrationen von Kanamycin, Spectinomycin, Streptomycin, Chloramphenicol, Erythromycin und Gentamicin. Die Kulturen können für ca. 2 Wochen auf Agarplatten aufbewahrt und unbegrenzt nachgestreut werden. Für die Langzeitlagerung sollten flüssige Zellkulturen in einer 15%igen Glycerinlösung bei −80 °C gelagert werden.
Synthetische Biology und Gentechnik Synechocystis sp. PCC 6803 ist ein Modellorganismus, dennoch gibt es nur wenige synthetische Teile, die für die Gentechnik verwendet werden können. Da Cyanobakterien im Allgemeinen im Vergleich zu vielen pathogenen Bakterien langsame Verdopplungszeiten haben (4,5 bis 5 h bei S. sp. PCC 6301), ist es effizienter, stattdessen möglichst viel DNA-Klonierung in einem schnell wachsenden Wirt wie Escherichia coli durchzuführen. Um Plasmide (stabile, sich replizierende zirkuläre DNA-Fragmente) – zu erzeugen, die erfolgreich in mehreren Spezies funktionieren, wird ein Shuttle-Plasmid () mit einem breiten Wirtsspektrum benötigt.
Produktion von Biotreibstoff Cyanobakterien wurden auf verschiedene Weise zur Herstellung von erneuerbarem Biokraftstoff verwendet. Die ursprüngliche Methode bestand darin, Cyanobakterien für die Biomasse zu züchten um diese durch Verflüssigung in Flüssigkraftstoff umzuwandeln. Schätzungen legen nahe, dass die Biokraftstoffproduktion aus (unveränderten) Cyanobakterien nicht realisierbar ist, da der Erntefaktor EROEI () ungünstig ist. Dies liegt daran, dass zahlreiche große, in sich geschlossene Bioreaktoren mit idealen Wachstumsbedingungen (Sonnenlicht, Düngemittel, konzentriertes Kohlendioxid, Sauerstoff) gebaut und betrieben werden müssen, was fossile Brennstoffe verbraucht. Außerdem ist eine weitere Nachbearbeitung der Cyanobakterienprodukte notwendig, was zusätzliche fossile Brennstoffe erfordert.
Synechocystis sp. PCC 6803 wurde aber als Modell verwendet, um die Energieausbeute von Cyanobakterien durch gentechnische Eingriffe zu erhöhen: Erweiterung des Bereichs der photosynthetischen Lichtabsorption Veränderung der Antennengröße im Photosystem II Erhöhung der Bicarbonataufnahme Modifikation des RuBisCO-Enzyms zur Erhöhung der Kohlenstofffixierung Einführung von Biokraftstoff-produzierenden Stoffwechselwegen. Es ist allerdings noch nicht klar, ob cyanobakterielle Biokraftstoffe in Zukunft eine brauchbare Alternative zu nicht-erneuerbaren fossilen Kraftstoffen sein werden.
Genom Das Genom von Synechocystis sp. PCC 6803 befindet sich in etwa 12 Kopien eines einzelnen DNA-Moleküls (Chromosoms) mit 3,57 Mbp (Megabasenpaare) Länge; drei kleinen Plasmiden: pCC5.2 mit 5,2 kbp (Kilobasenpaare), pCA2.4 mit 2,4 kbp und pCB2.4 mit 2,4 kbp; und vier großen Plasmiden: pSYSM mit 120 kbp, pSYSX mit 106 kbp, pSYSA mit 103 kbp und pSYSG mit 44 kbp.
Licht-induzierte Heterotrophie mini|hochkant=1.5|Schematische Darstellung von Synechocystis, die die Organisation der photosynthetischen Thylakoid- und äußeren Membranen zeigt Der Glukose-tolerante Unterstamm ATCC 27184 von S. sp. PCC 6803 kann heterotroph im Dunkeln auf der Kohlenstoffquelle Glukose leben, benötigt aber aus noch unbekannten Gründen ein Minimum von 5 bis 15 Minuten (blaues) Licht pro Tag. Diese regulatorische Rolle des Lichts ist sowohl bei PS1- als auch bei PS2-defizienten Stämmen intakt.
Einige glykolytische Gene werden durch das Gen sll1330 unter Licht- und Glukose-supplementierten Bedingungen reguliert. Eines der wichtigsten glykolytischen Gene ist das für Fructose-1,6-Bisphosphat-Aldolase (fbaA). Der mRNA-Spiegel von fbaA ist unter Licht- und Glukose-supplementierten Bedingungen erhöht.
Photosystem-I-unabhängige oxygene Photosynthese Wie Untersuchungen an der LMU München zeigten, ist Synechocystis sp. PCC 6803 in der Lage unter bestimmten Bedingungen auch mit einem ausgeschalteten Photosystem I Sauerstoff-erzeugende (oxygene) Photosynthese zu betreiben, d. photoautotroph zu leben. Der Stamm benötigt dafür als Ersatz einen funktionalen NDH-1-Komplex ( ).
Natives CRISPR-Cas-System Das CRISPR-Cas-System () sorgt für adaptive Immunität in Archaeen und Bakterien. Synechocystis sp. PCC 6803 enthält drei verschiedene CRISPR-Cas-Systeme: Typ I-D und zwei Versionen von Typ III. Alle drei CRISPR-Cas-Systeme sind auf dem pSYSA-Plasmid lokalisiert. Das Typ-II-System, das bei vielen Spezies für gentechnische Zwecke adaptiert wurde, fehlt generell bei Cyanobakterien.
Natürliche Genetische Transformation Synechocystis sp. PCC 6803 ist zu einer natürlichen Genetischen Transformation fähig. Damit eine Transformation stattfinden kann, müssen sich die Empfängerbakterien in einem kompetenten Zustand befinden. Es konnte gezeigt werden, dass das Gen comF an der Kompetenzentwicklung in S. sp. PCC 6803 beteiligt ist.
Homologien der Membranproteine zu solchen von Eukaryoten Im Jahr 2023 untersuchten Dirk Schneider et al. Homologien zwischen Membranproteinen der Eukaryoten und DER Cyanobakterien (am Beispiel Synechocystis sp. PCC 6803). Ein Beispiel ist das Dynamin-ähnliche Protein SynDLP von Synechocystis sp. PCC 6803.
Siehe auch Archaikum, ein Äon in der Urgeschichte der Erde Proterozoikum, dito Systematik der Bakterien Biodünger (Biofertilizer) Biokraftstoff Cyanobakterien Endosymbiont mit einem Cyanobionten (cyanobakteriellen Endosymbionten) Große Sauerstoffkatastrophe Grünalgen und Mikroalgen Biofilm und Mikrobenmatten Phytoplankton Stromatolith
Weblinks
STRING – Datenbank mit bekannten und vorhergesagten Protein-Protein-Interaktionen. Speziell bietet die Datenbank Interaktionen für Synechocystis sp. PCC 6803. Bradley Lynn Postier: Studies On The Photosynthetic Microorganism Synechocystis PCC6803 And How It Responds To The Effects Of Salt Stress, Thesis, Oklahoma State University, Stillwater, 1996