Die J.League Division 1 1999 war die siebte Spielzeit der höchsten Division der japanischen J.League und die erste unter dem Namen Division 1. An ihr nahmen sechzehn Vereine teil. Die reguläre Saison wurde in zwei Halbserien ausgetragen und begann am 6. März 1999. Nach dem Ende der zweiten Halbserie am 27. November 1999 spielten die Sieger der beiden Halbserien, Júbilo Iwata und Shimizu S-Pulse, in zwei Spielen um den japanischen Meistertitel. Diese Endspiele wurden nach der regulären Saison am 4. und 11. Dezember ausgetragen.https://data.j-league.or.jp/SFMS01/search?competition_years=1999&competition_frame_ids=1&competition_frame_ids=12 Beide Spiele wurden jeweils vom Heimverein mit 2:1 gewonnen, sodass ein Elfmeterschießen um den Titel entscheiden musste. Hierbei behielt Júbilo Iwata knapp die Oberhand, für das Team war es der zweite Ligatitel insgesamt.

Absteiger in die J.League Division 2 2000 waren Urawa Red Diamonds und Bellmare Hiratsuka.

Modus Wie in der Vorsaison standen sich die Vereine zweimal, also je einmal zuhause und einmal auswärts, gegenüber, allerdings wurden beide Halbserien als getrennte Meisterschaften gewertet. Bei Gleichstand nach 90 Minuten wurde die Spielzeit um zweimal fünfzehn Minuten verlängert, wobei die Golden-Goal-Regel zur Anwendung kam. Stand es danach immer noch unentschieden, wurde das Spiel als solches gewertet; dies war eine Neuerung, denn bislang endete ein nach 120 Minuten unentschiedenes Spiel stets mit einem Elfmeterschießen.

Für einen Sieg nach regulärer Spielzeit gab es drei, für einen Sieg in der Verlängerung zwei Punkte; bei einem Unentschieden gab es für jede Mannschaft einen Zähler. Die Tabelle einer jeden Halbserie wurde also nach den folgenden Kriterien erstellt: Anzahl der erzielten Punkte Tordifferenz Erzielte Tore Ergebnisse der Spiele untereinander Entscheidungsspiel oder Münzwurf Nach Ende einer Halbserie qualifizierte sich der Verein mit den meisten Punkten für die Endspiele um die japanische Meisterschaft. Der Sieger der Endspiele qualifizierte sich als japanischer Meister für die Asian Club Championship 2000/01. Neu eingeführt wurde die Ermittlung von zwei festen Absteigern in die Division 2. Hierzu wurde nach Ende der Saison nach den gleichen Kriterien wie oben angegeben eine Tabelle über die gesamte Spielzeit gebildet, die beiden schlechtesten Mannschaften mussten den Gang in die Zweitklassigkeit antreten.

Aufgrund der Einführung der zweiten Division und der damit einhergehenden Verkleinerung auf sechzehn Teilnehmer verringerte sich die Anzahl der zu absolvierenden Partien pro Team; statt 34 waren nun nur noch 30 Spiele auszutragen.

Teilnehmer Insgesamt nahmen sechzehn Mannschaften an der Spielzeit teil. Durch die Gründung der J.League Division 2 gab es im Vorjahr keinen Aufsteiger aus der Japan Football League, obwohl mit Kawasaki Frontale der Zweitplatzierte an den Abstiegsplayoffs teilnahm; die Mannschaft scheiterte in einem Qualifikationsspiel an Avispa Fukuoka. Avispa selbst sicherte erst in den Finalspielen der Playoffs den Klassenerhalt. Leidtragender war Vorjahresaufsteiger Consadole Sapporo, die direkt wieder in die Zweitklassigkeit zurückgereicht wurden.

Eine weitere Mannschaft schied durch Fusion mit einem Konkurrenten aus der Liga aus. Nachdem die Yokohama Flügels durch Ausstieg einer der Hauptsponsoren in finanzielle Schieflage geraten waren, blieb Teambesitzer All Nippon Airways keine andere Wahl, als mit Nissan, Eigentümer des Stadtrivalen Marinos, Verhandlungen zur Verschmelzung beider Vereine aufzunehmen, um so die Flügels vor dem Bankrott zu bewahren. Der Zusammenschluss wurde Anfang des Jahres 1999 vollzogen, die Mannschaft spielte nun unter dem Namen Yokohama F. Marinos.

Verein Stadt/Region Avispa Fukuoka Fukuoka, Fukuoka Bellmare Hiratsuka Hiratsuka, Kanagawa Cerezo Osaka Osaka, Osaka Gamba Osaka Suita, Osaka JEF United Ichihara Ichihara, Chiba Júbilo Iwata Iwata, Shizuoka Kashima Antlers Kashima, Ibaraki Kashiwa Reysol Kashiwa, Chiba Kyōto Purple Sanga Kyōto, Kyōto Nagoya Grampus Eight Nagoya, Aichi Sanfrecce Hiroshima Hiroshima, Hiroshima Shimizu S-Pulse Shizuoka, Shizuoka Urawa Red Diamonds Urawa, Saitama Verdy Kawasaki Kawasaki, Kanagawa Vissel Kōbe Kōbe, Hyōgo Yokohama F. Marinos Yokohama, Kanagawa

Trainer VereinCheftrainerKashima Antlers Zé Mário → Zico → Takashi SekizukaUrawa Reds Hiromi Hara → Aad de Mos → Yasushi YoshidaJEF United Ichihara Gert Engels → Nicolae ZamfirKashiwa Reysol Akira NishinoVerdy Kawasaki Hideki MatsunagaYokohama F. Marinos Antonio de la CruzBellmare Hiratsuka Eiji Ueda → Mitsuru KomaedaShimizu S-Pulse Steve PerrymanJúbilo Iwata Takashi KuwaharaNagoya Grampus Eight Kōji Tanaka → Daniel Sanchez → Mazarópi → João CarlosKyoto Purple Sanga Hidehiko Shimizu → Bunji Kimura → Shū KamoGamba Osaka Frédéric Antonetti → Hiroshi HayanoCerezo Osaka René DesaeyereVissel Kobe Ryōichi KawakatsuSanfrecce Hiroshima Eddie ThomsonAvispa Fukuoka Yoshio Kikugawa

Spieler J.League (japanisch)