Die Bacteroidota (früher Bacteroidetes) bilden einen eigenen Stamm (äquivalent: Abteilung, , allgemein auch Phylum genannt) innerhalb der Domäne der Bakterien. In diesem Phylum findet sich eine breite Vielfalt von Stoffwechsel, Ökologie und Morphologie.
Erscheinungsbild Der Gram-Test ist negativ. Die Zellen der meisten Arten sind stäbchenförmig und bilden keine Sporen. Es sind aerobe, also auf Sauerstoff angewiesene, wie auch anaerobe Vertreter vorhanden. Mehrere Arten, wie z. B. von der Klasse der Flavobakterien und Cytophagen, sind durch Gleitbewegungen motil (beweglich).
Pathogenität Innerhalb der Bacteroidota (Bacteroidetes) sind auch einige für Tiere und Menschen krankheitserregende (pathogene) Arten vorhanden. In der Familie Flavobacteriaceae sind u. a. einige Arten für Vögel pathogen. Capnocytophaga gehört zu der normalen Bakterienflora des Menschen, kann aber unter bestimmten Umständen auch pathogen wirken. Auch Bacteroides fragilis und Bacteroides thetaiotaomicron sind opportunistische Krankheitserreger des Menschen. Für Fische sind z. B. Arten von Cytophaga pathogen.
Systematik Die Abteilung Bacteroidota (synonym Bacteroidetes) enthält aufgrund von 16s-rRNA-Gensequenzen die Klassen Bacteroidia, Cytophagia, Flavobacteriia und Sphingobacteriia.
Die hier angegebene Systematik basiert mit Stand 15. August 2024 auf den folgenden Quellen: L – (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) N – (NCBI, ) G – (GTDB), University of Queensland (UQ), Australien. – hier nur ersatzweise benutzt bei fehlender Referenz zu LPSN und NCBI (siehe Anmerkung unten).
Die GTDB versteht abweichend von LPSN und NCBI das Phylum Bacteroidota im weiteren Sinne, d. h. dem Umfang nach identisch mit der Bacteroidota–Chlorobiota-Gruppe (Bacteroidetes–Chlorobi); die in dieser Klade enthaltenen Phyla (entsprechend LPSN/NCBI) beinhalten (bis auf Bacteroidota selbst) jeweils nur eine einzige Klasse und sind in der GTDB auf diese Rangstufe herabgestuft.
Man beachte, dass unterschiedliche Taxa teilweise sehr ähnliche Namen haben, etwa ‚-bacteria‘ versus ‚-bacteriia‘, das doppelte ‚i‘ drückt im Allgemeinen eine Ähnlichkeit (sensu lato oder Schwestertaxon) aus. Die Systematik im Einzelnen:
Phylum Bacteroidota et al. 2021 (L,N), mit Synonymen Bacteroidetes et al. 2012 (L,N), „Sphingobacteria“ 2002 (L) Klasse Bacteroidia 2012 – die beiden folgenden Ordnungen sind bei LPSN im Gegensatz zu NCBI synonym (d. h. zusammengelegt): Ordnung Bacteroidales 2012 (L) … emend. et al. 2017 (N) inkl. Marinilabiliales et al. 2016 (L,N) Familie „Candidatus Aminobacteroidaceae“ et al. 2020 (L) Familie „Candidatus Azobacteroidaceae“ et al. 2023 Familie Bacteroidaceae 1933 Familie Balneicellaceae et al. 2016 Familie Barnesiellaceae et al. 2020 Familie Dysgonomonadaceae et al. 2020 Familie „Candidatus Homeothermaceae“ et al. 2016 Familie Lentimicrobiaceae et al. 2016 Familie Marinifilaceae et al. 2014, mit Gattung Marinifilum (L,N) Familie Marinilabiliaceae et al. 2012 Familie Muribaculaceae et al. 2019 Familie Odoribacteraceae et al. 2016 Familie Paludibacteraceae et al. 2022 Familie Porphyromonadaceae 2012 Familie Prevotellaceae 2012 Familie Prolixibacteraceae et al. 2014 syn. Draconibacteriaceae et al. 2014 Familie Rikenellaceae et al. 2012 Familie Salinivirgaceae et al. 2017 Familie Tannerellaceae et al. 2022 Familie Tenuifilaceae et al. 2021 Familie Williamwhitmaniaceae et al. 2017
Klasse Chitinophagia et al. 2017 (L,N) Ordnung Chitinophagales et al. 2017 (L) … emend. et al. 2016 (N) Familie Chitinophagaceae et al. 2011 (L) Klasse „Candidatus Costitxiia“ et al. 2024 (L) Ordnung „Candidatus Costitxiales“ et al. 2024 (L) Familie „Candidatus Costitxiaceae“ et al. 2024 (L) mit Gattung „Candidatus Costitxia“ et al. 2024 (L) Klasse Cytophagia 2012 (L) … emend. et al. 2016 (N), mit Synonym Flavobacteria 2002 (L), Ordnung Cytophagales 1974 (L,N) Familie Bernardetiaceae et al. 2017 (L) Familie Catalinimonadaceae corrig. et al. 2013 (L), syn. Catalimonadaceae et al. 2013 (L) Familie Cesiribacteraceae et al. 2020 (L) Familie Cyclobacteriaceae 2012 (L) Familie Cytophagaceae 1940 (L) Familie Flammeovirgaceae et al. 2011 (L) Familie Flexibacteraceae et al. 2020 (L) Familie Fulvivirgaceae et al. 2020 (L) Familie Hymenobacteraceae et al. 2016 (L) Familie Mangrovivirgaceae et al. 2021 (L) Familie Marivirgaceae et al. 2020 (L) Familie Microscillaceae et al. 2017 (L) Familie Mooreiaceae et al. 2013 (L) Familie Persicobacteraceae et al. 2016 (L) Familie Raineyaceae et al. 2018 (L) Familie Reichenbachiellaceae et al. 2020 (L) Familie „Rhodocytophagaceae“ et al. 2023 (L) Familie Roseivirgaceae et al. 2020 (L) Familie Shiellaceae et al. 2023 (L) Familie Spirosomataceae corrig. 1978 (L), syn. Spirosomaceae 1978 (L) Familie Splendidivirgaceae et al. 2024 (L) Familie Thermoflexibacteraceae et al. 2020 (L) Familie Thermonemataceae et al. 2016 (L) Klasse Flavobacteriia 2012 (L,N) Ordnung Flavobacteriales 2012 (L), zuvor „Flavobacteriales“ 2011 (N) Familie Blattabacteriaceae 2012 (L) Familie Crocinitomicaceae et al. 2016 (L) Familie Cryomorphaceae et al. 2003 (L), syn. Luteibaculaceae 2021 (L), Salibacteraceae 2021 (L) und Vicingaceae 2021 (L) Familie Flavobacteriaceae 1992 (L) Familie Ichthyobacteriaceae et al. 2016 (L) Familie Schleiferiaceae et al. 2011 (L) Familie Weeksellaceae et al. 2020 (L) Klasse Saprospiria et al. 2018 (N) bzw. 2017 (L) Ordnung Saprospirales et al. 2017 (L,N) Familie Lewinellaceae Hahnke et al. 2017, syn. Haliscomenobacteraceae Hahnke et al. 2017 Familie Saprospiraceae Krieg et al. 2012 Klasse Sphingobacteriia 2012 (L,N) Ordnung Sphingobacteriales 2012 (L,N) Familie Aurantibacillaceae et al. 2023 (L) Familie Filobacteriaceae et al. 2016 (L) Familie Sphingobacteriaceae et al. 1998 (L) ohne Klassen- und Ordnungszuweisung Familie „Candidatus Amoebophilaceae“ et al. 2014 (L)
Verschoben in ein eigenes Phylum:
Phylum Rhodothermota et al. 2021 Klasse Rhodothermia et al. 2017 Ordnung Rhodothermales et al. 2017 Familie Rhodothermaceae et al. 2012, mit Gattung Rhodothermus (L) Familie Rubricoccaceae et al. 2016, mit Gattung Salisaeta (L) Familie Salinibacteraceae et al. 2016, mit Gattung Salinibacter (L) Familie Salisaetaceae et al. 2019 (L)
Verschoben in bestehendes Phylum:
Phylum Pseudomonadota et al. 2021 (L) Klasse Gammaproteobacteria et al. 2005 (L) Ordnung Methylococcales 2005 (L) Familie Crenotrichaceae 1888, mit Gattung Toxothrix (L)
Unsichere Mitglieder: Klasse OC31 (N: ohne Zuordnung) Klasse Bacteroidota "Incertae sedis 253" et al. 2001 mit Gattung: Amoebophilus in der Familie „Candidatus Amoebophilaceae“ (L,N) – bei NCBI ist diese Mitglied der Ordnung Cytophagales und damit wäre die Klasse identisch mit Cytophagia. Klasse Bacteroidota "Incertae sedis 355" et al. 2007 mit Gattung: Uzinura (L,N) – bei NCBI ist diese Mitglied der Ordnung Flavobacteriales und damit wäre die Klasse identisch mit Flavobacteriia. Klasse JABWAT01 (G), mit Spezies JABWAT01 sp013360915 Klasse SZUA-365 (G), u. a. mit Spezies SZUA-365 sp003246455
Synonymien Bacteroidetes et al. 2012 (L,N), Synonyme: Bacteroidota et al. 2021 (L), Bacteroidota et al. 2018 (L,N) „Bacteroidaeota“ et al. 2015 (L,N) „Sphingobacteria“ 2002 (L) BCF group (N), Bacteroides-Cytophaga-Flexibacter group (N) CFB group (N), Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides phylum (N) Bacteroidia 2012 (L,N), Synonyme: „Bacteroidetia“ 2020 (L) Bacteroidetes s. s. (N) Cytophagia 2012 (L) bzw. 2012 emend. et al. 2016 (N), Synonym: Flavobacteria 2002 (L) Sphingobacteriales 2012 (L,N), alias Bacteroidetes Order IV. Incertae sedis (N: fehlerhaft, vergleiche Mitglieder: Gattung Toxothrix ist bei LPSN in der Sphingobacteriales-Familie Crenotrichaceae)
Ökologie Es sind aerobe (auf Sauerstoff angewiesene) wie auch anaerobe Vertreter vorhanden. Einige sind pathogen. Zu den anaeroben Bacteroidetes zählt z. B. die Gattung Bacteroides, die im menschlichen Darm die mit 1011 Zellen pro Gramm häufigsten Bakterien sind.Katharina Munk (Hrsg.): Taschenlehrbuch Biologie: Mikrobiologie. Thieme Verlag, Stuttgart 2008, ISBN 978-3-13-144861-3 Die Klasse der Flavobacteriia enthält einige Kommensalen und opportunistisch pathogene Bakterien. Die Arten sind in verschiedenen Habitaten zu finden, z. B. im Boden, Süßwasser und Meerwasser, innerhalb von verschiedenen Arten von Fischen, Amphibien, Insekten, Weichtieren, Krebstieren und in Pflanzen. Arten von Blattabacterium (Familie Blattabacteriaceae) wurden in Termiten und Schaben gefunden. Auch die Mitglieder der Klasse Sphingobacteria besiedeln ein breites Spektrum von Habitaten, so z. B. Böden, Grund-, Frisch- und Meerwasser. Auch einige psychrophile (kälteliebende) Arten sind vorhanden, wie z. B. Flavobacterium psychrophilum und Psychroflexus. Beide Gattungen zählen zu der Familie Flavobacteriaceae.
Literatur George M. Garrity: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Band 5: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Springer, New York 2011, ISBN 978-0-387-95042-6. Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.) The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria. Volume 7, ISBN 978-0-387-33493-6
Einzelnachweise UQ, Australia. Bacteroidota, GTDB. UQ, Australia. JABWAT01 sp013360915, GTDB. UQ, Australia. SZUA-365 sp003246455, GTDB. UQ, Australia. J. P. Euzéby: List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a Folder Available on the Internet. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 47, Nr. 2, S. 590–592; doi:10.1099/00207713-47-2-590, PMID 9103655. LPSN: Phylum "Bacteroidetes" Krieg et al. 2010 und . NCBI: FCB group, Details: FCB group (clade, heterotypic synonyms: Fibrobacteres-Chlorobi-Bacteroidetes superphylum,…); graphisch: lifemap-ncbi.univ-lyon1.fr FCB group, Lifemap NCBI Version. NCBI: MAG: Bacteroidetes bacterium isolate MAG_11, whole genome shotgun sequencing project, GenBank: JABWAT000000000.1 NCBI: MAG: Bacteroidetes bacterium isolate SZUA-365, whole genome shotgun sequencing project, GenBank: QKAF00000000.1 NCBI: Uncultured bacterium clone oc31 16S ribosomal RNA gene, partial sequence, GenBank: AY491574.1. NamesforLife: (phylum), doi:10.1601/tx.7927. NamesforLife: "Flavobacteria" Cavalier-Smith 1998 emend. Cavalier-Smith 2002 (class), doi:10.1601/tx.8068. Anm.: Die Seite kennzeichnet diese Bezeichnung als angebliches Synonym von "Flavobacteriia", gibt aber Cytophagales als eine darin enthaltene Ordnung an. Auf der Seite Cytophagia Cytophagia Nakagawa 2012 emend. García-López et al. 2019 (class) wird aber ebenfalls Cytophagales in dieser Klassen enthaltene Ordnung genannt (so wie bei LPSN). Das kann nicht sein, weil es sich um verschiedene Klassen handelt. Wir folgen LPSN, synonymisieren „Flavobacteria“ mit Cytophagia, und verstehen „Flavobacteriia“ als ähnlich, aber nicht gleich „Flavobacteria“. NamesforLife: "Incertae sedis 253" Horn et al. 2001 (class), doi:10.1601/nm.32165. NamesforLife: "Incertae sedis 355" Gruwell et al. 2007 (class), doi:10.1601/nm.32445 Silva: AY491574 – Uncultured bacterium clone oc31 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Deutsches Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur (de.NBI).
Matthew E. Gruwell, Geoffrey E. Morse, Benjamin B. Normark: Phylogenetic congruence of armored scale insects (Hemiptera: Diaspididae) and their primary endosymbionts from the phylum Bacteroidetes. In: Molecular Phylogenetics and Evolution, Band 44, Nr. 1, Juli 2007, S. 267–280; doi:10.1016/j.ympev.2007.01.014, PMID 17400002.