Einen Rektor der Universität Tübingen gab es seit der Gründung der Hochschule im Jahre 1477 durch Graf Eberhard im Bart. Erster Rektor der Universität Tübingen im Winterhalbjahr 1477/78 war Johannes Vergenhans (genannt Nauclerus). Das Amt des Rektors stand an der Spitze der Universitätsverwaltung noch über dem des Kanzlers und wurde in der Regel für die Dauer eines Semesters von einem Professor der Universität bekleidet. Seit 1537 konnte das Rektoramt regulär auch vornehmen Personen übertragen werden, die nicht dem Lehrkörper der Universität angehörten. Von 1767 bis 1793 war zum Beispiel Herzog Carl Eugen als Landesherr selbst auch Rektor (Rector magnificentissimus). Die tatsächlichen Amtsgeschäfte wurden in dieser Zeit vom Prorektor wahrgenommen. Das Universitätsarchiv Tübingen hat 2010 eine Liste aller Rektoren seit dem Jahre 1477 veröffentlicht.Universitätsarchiv Tübingen: Historisch-statistisches Handbuch der Universität Tübingen, Die Rektoren 15. – 21. Jahrhundert (PDF; 256 kB)
Zur Zeit der Grafschaft Württemberg 15. September 1477 – 1. Mai 1478 Johannes Nauclerus 1. Mai 1478 – 18. Oktober 1478 Konrad Vessler 18. Oktober 1478 – 1. Mai 1479 Johannes Heynlin 1. Mai 1479 – 18. Oktober 1479 Ludwig Truchsess von Höfingen 18. Oktober 1479 – 1. Mai 1480 Johannes Stein 1. Mai 1480 – 18. Oktober 1480 Christian Wolmann 18. Oktober 1480 – 1. Mai 1481 Johannes Kreuzlinger 1. Mai 1481 – 18. Oktober 1481 Elias Flick 18. Oktober 1481 – 1. Mai 1482 Konrad Schoeferlin 1. Mai 1482 – 1. Mai 1483 Georg Hartsesser 1. Mai 1483 – 18. Oktober 1483 Mangold Widmann 18. Oktober 1483 – 1. Mai 1484 Konrad Blenderer 1. Mai 1484 – 18. Oktober 1484 Konrad Summenhart 18. Oktober 1484 – 1. Mai 1485 Conrad Bömlin 1. Mai 1485 – 18. Oktober 1485 Ulrich Kraft 18. Oktober 1485 – 1. Mai 1486 Gabriel Biel 1. Mai 1486 – 18. Oktober 1486 Peter Kempchin 18. Oktober 1486 – 1. Mai 1487 Peter Bopphard 1. Mai 1487 – 18. Oktober 1487 Gregor Lamparter 18. Oktober 1487 – 1. Mai 1488 Johannes Steinmajer 1. Mai 1488 – 18. Oktober 1488 Johannes Hiller 18. Oktober 1488 – 1. Mai 1489 Johannes Stein 1. Mai 1489 – 18. Oktober 1489 Gabriel Biel 18. Oktober 1489 – 1. Mai 1490 Martin Plantsch 1. Mai 1490 – 18. Oktober 1490 Wendelin Steinbach 18. Oktober 1490 – 1. Mai 1491 Konrad Veßler 1. Mai 1491 – 18. Oktober 1491 Konrad Summenhart 18. Oktober 1491 – 1. Mai 1492 Mangold Widmann 1. Mai 1492 – 18. Oktober 1492 Hieronymus von Croaria 18. Oktober 1492 – 1. Mai 1493 Diethmar Aschmann 1. Mai 1493 – 18. Oktober 1493 Gregor Lamparter 18. Oktober 1493 – 1. Mai 1494 Veit von Fürst 1. Mai 1494 – 18. Oktober 1494 Wendelin Steinbach 18. Oktober 1494 – 1. Mai 1495 Jacob Lemp 1. Mai 1495 – 18. Oktober 1495 Johann Lupfdich
Zur Zeit des Herzogtums Württemberg 15. Jahrhundert 18. Oktober 1495 – 1. Mai 1496 Andreas Rempis 1. Mai 1496 – 18. Oktober 1496 Hieronymus von Croaria 18. Oktober 1496 – 1. Mai 1497 Konrad Summenhart 1. Mai 1497 – 18. Oktober 1497 Konrad Vessler 18. Oktober 1497 – 1. Mai 1498 Johannes Gentner (Johannes Adler) 1. Mai 1498 – 18. Oktober 1498 Johannes Leo 18. Oktober 1498 – 1. Mai 1499 Andreas Trostel 1. Mai 1499 – 18. Oktober 1499 Laurentius Hornstein 18. Oktober 1499 – 1. Mai 1500 Wendelin Steinbach 1. Mai 1500 – 18. Oktober 1500 Konrad Summenhart
16. Jahrhundert 18. Oktober 1500 – 1. Mai 1501 Jacob Lemp 1. Mai 1501 – 18. Oktober 1501 Andreas Rempis 18. Oktober 1501 – 17. Februar 1502 Andreas Trostel 17. Februar 1502 – 1. Mai 1503 Konrad Vessler 1. Mai 1503 – 18. Oktober 1503 Peter Braun 18. Oktober 1503 – 1. Mai 1504 Kaspar Forstmeister 1. Mai 1504 – 18. Oktober 1504 Reinhard Gaißer 18. Oktober 1504 – 1. Mai 1505 Sigismund Epp 1. Mai 1505 – 18. Oktober 1505 Johannes Vesenmajer 18. Oktober 1505 – 1. Mai 1506 Johannes Gentner (Johannes Adler) 1. Mai 1506 – 1. Mai 1507 Jacob Lemp 1. Mai 1507 – 1. Mai 1508 Wendelin Steinbach 1. Mai 1508 – 1. Mai 1509 Peter Braun 1. Mai 1509 – 1. Mai 1510 Heinrich Winkelhofer 1. Mai 1510 – 1. Mai 1511 Jacob Lemp 1. Mai 1511 – 1. Mai 1512 Wendelin Steinbach 1. Mai 1512 – 1. Mai 1513 Johannes Scheurer 1. Mai 1513 – 1. Mai 1514 Peter Braun 1. Mai 1514 – 1. Mai 1515 Jacob Lemp 1. Mai 1515 – 18. Oktober 1515 Balthasar Sattler 18. Oktober 1515 – 1. Mai 1516 Wendelin Steinbach 1. Mai 1516 – 18. Oktober 1516 Johannes Kreß 18. Oktober 1516 – 1. Mai 1517 Gallus Müller 1. Mai 1517 – 18. Oktober 1517 Alexander Rieger 18. Oktober 1517 – 1. Mai 1518 Jacob Lemp 1. Mai 1518 – 18. Oktober 1518 Peter Braun 18. Oktober 1518 – 1. Mai 1519 Franz Kircher 1. Mai 1519 – 18. Oktober 1519 Balthasar Sattler 18. Oktober 1519 – 1. Mai 1520 Gallus Müller 1. Mai 1520 – 1. Mai 1521 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1521 – 18. Oktober 1521 Jacob Lemp 18. Oktober 1521 – 1. Mai 1522 Johannes Epp 1. Mai 1522 – 18. Oktober 1522 Johann Stoeffler 18. Oktober 1522 – 1. Mai 1523 Peter Braun 1. Mai 1523 – 18. Oktober 1523 Johannes Eschenbach 18. Oktober 1523 – 1. Mai 1524 Konrad Braun 1. Mai 1524 – 18. Oktober 1524 Friedrich Schaup 18. Oktober 1524 – 1. Mai 1525 Gallus Müller 1. Mai 1525 – 18. Oktober 1525 Jacob Lemp 18. Oktober 1525 – 1. Mai 1526 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1526 – 18. Oktober 1526 Peter Braun 18. Oktober 1526 – 1. Mai 1527 Jacob Lemp 1. Mai 1527 – 18. Oktober 1527 Gallus Müller 18. Oktober 1527 – 1. Mai 1528 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1528 – 18. Oktober 1528 Peter Braun 18. Oktober 1528 – 1. Mai 1529 Jacob Lemp 1. Mai 1529 – 18. Oktober 1529 Martin Kügelin 18. Oktober 1529 – 1. Mai 1530 Gallus Müller 1. Mai 1530 – 18. Oktober 1530 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1530 – 18. Oktober 1531 Johannes Kingsattler 18. Oktober 1531 – 2. April 1532 Jacob Lemp 2. April 1532 – 1. Mai 1532 Johannes Kingsattler 1. Mai 1532 – 18. Oktober 1532 Peter Braun 18. Oktober 1532 – 1. Mai 1533 Gallus Müller 1. Mai 1533 – 18. Oktober 1533 Johannes Kingsattler 18. Oktober 1533 – 1. Mai 1534 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1534 – 18. Oktober 1534 Peter Braun 18. Oktober 1534 – 1. Mai 1535 Johann Armbruster 1. Mai 1535 – 18. Oktober 1535 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1535 – 1. Mai 1536 Johannes Sichardt 1. Mai 1536 – 18. Oktober 1536 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1536 – 1. Mai 1537 Leonhart Fuchs 1. Mai 1537 – 18. Oktober 1537 Gebhard Brastberger 18. Oktober 1537 – 1. Mai 1538 Paulus Constantinus Phrygio 1. Mai 1538 – 18. Oktober 1538 Joachim Camerarius 18. Oktober 1538 – 1. Mai 1539 Ludwig Gremp von Freudenstein 1. Mai 1539 – 18. Oktober 1539 Michael Rucker 18. Oktober 1539 – 1. Mai 1540 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1540 – 18. Oktober 1540 Caspar Volland 18. Oktober 1540 – 1. Mai 1541 Leonhart Fuchs 1. Mai 1541 – 18. Oktober 1541 Albert Arbogast Freiherr von Hewen 18. Oktober 1541 – 18. Oktober 1542 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1542 – 1. Mai 1543 Johannes Sichardt 1. Mai 1543 – 18. Oktober 1543 Michael Rucker 18. Oktober 1543 – 1. Mai 1544 Gebhard Brastberger 1. Mai 1544 – 18. Oktober 1544 Jakob Scheckh 18. Oktober 1544 – 1. Mai 1545 Erhard Schnepff 1. Mai 1545 – 18. Oktober 1545 Caspar Volland 18. Oktober 1545 – 1. Mai 1546 Johannes Sichardt 1. Mai 1546 – 18. Oktober 1546 Leonhart Fuchs 18. Oktober 1546 – 1. Mai 1547 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1547 – 18. Oktober 1547 Melchior Rufus Volmar 18. Oktober 1547 – 1. Mai 1548 Gebhard Brastberger 1. Mai 1548 – 18. Oktober 1548 Michael Rucker 18. Oktober 1548 – 1. Mai 1549 Balthasar Käuffelin 1. Mai 1549 – 18. Oktober 1549 Johannes Sichardt 18. Oktober 1549 – 1. Mai 1550 Leonhart Fuchs 1. Mai 1550 – 18. Oktober 1550 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1550 – 1. Mai 1551 Caspar Volland 1. Mai 1551 – 18. Oktober 1551 Michael Rucker 18. Oktober 1551 – 1. Mai 1552 Gebhard Brastberger 1. Mai 1552 – 18. Oktober 1552 Balthasar Käuffelin 18. Oktober 1552 – 1. Mai 1553 Caspar Volland 1. Mai 1553 – 18. Oktober 1553 Jakob Scheckh 18. Oktober 1553 – 1. Mai 1554 Jacob Beurlin 1. Mai 1554 – 18. Oktober 1554 Nikolaus Varenbüler 18. Oktober 1554 – 18. Oktober 1555 Leonhart Fuchs 18. Oktober 1555 – 1. Mai 1556 Martin Frecht 1. Mai 1556 – 18. Oktober 1556 Jakob Cappelbeck 18. Oktober 1556 – 1. Mai 1557 Kilian Vogler 1. Mai 1557 – 18. Oktober 1557 Michael Rucker 18. Oktober 1557 – 1. Mai 1558 Jacob Beurlin 1. Mai 1558 – 18. Oktober 1558 Nikolaus Varenbüler 18. Oktober 1558 – 1. Mai 1559 Jakob Scheckh 1. Mai 1559 – 18. Oktober 1559 Gebhard Brastberger 18. Oktober 1559 – 1. Mai 1560 Jacob Heerbrand 1. Mai 1560 – 18. Oktober 1560 Anastasius Demler 18. Oktober 1560 – 1. Mai 1561 Kilian Vogler 1. Mai 1561 – 18. Oktober 1561 Jakob Cappelbeck 18. Oktober 1561 – 1. Mai 1562 Dietrich Schnepff 1. Mai 1562 – 18. Oktober 1562 Kilian Vogler 18. Oktober 1562 – 1. Mai 1563 Jakob Scheckh 1. Mai 1563 – 18. Oktober 1563 Johann Hochmann 18. Oktober 1563 – 1. Mai 1564 Jacob Heerbrand 1. Mai 1564 – 18. Oktober 1564 Anastasius Demler 18. Oktober 1564 – 1. Mai 1565 Leonhart Fuchs 1. Mai 1565 – 18. Oktober 1565 Johannes Mendlin 18. Oktober 1565 – 1. Mai 1566 Dietrich Schnepff 1. Mai 1566 – 18. Oktober 1566 Kilian Vogler 18. Oktober 1566 – 1. Mai 1567 Jakob Scheckh 1. Mai 1567 – 18. Oktober 1567 Jakob Cappelbeck 18. Oktober 1567 – 1. Mai 1568 Valentin Volz 1. Mai 1568 – 18. Oktober 1568 Jacob Heerbrand 18. Oktober 1568 – 1. Mai 1569 Anastasius Demler 1. Mai 1569 – 18. Oktober 1569 Johann Hochmann 18. Oktober 1569 – 1. Mai 1570 Dietrich Schnepff 1. Mai 1570 – 18. Oktober 1570 Kilian Vogler 18. Oktober 1570 – 1. Mai 1571 Jakob Scheckh 1. Mai 1571 – 18. Oktober 1571Jakob Cappelbeck 18. Oktober 1571 – 1. Mai 1572 Valentin Volz 1. Mai 1572 – 18. Oktober 1572 Jacob Heerbrand 18. Oktober 1572 – 1. Mai 1573 Anastasius Demler 1. Mai 1573 – 18. Oktober 1573 Johannes Vischer 18. Oktober 1573 – 1. Mai 1574 Friedrich I., Herzog von Württemberg 1. Mai 1574 – 18. Oktober 1574 Johann Hochmann 18. Oktober 1574 – 1. Mai 1575 Dietrich Schnepff 1. Mai 1575 – 18. Oktober 1575 Kilian Vogler 18. Oktober 1575 – 1. Mai 1576 Georg Hamberger 1. Mai 1576 – 18. Oktober 1576 Anastasius Demler 18. Oktober 1576 – 1. Mai 1577 Valentin Volz 1. Mai 1577 – 18. Oktober 1577 Jacob Heerbrand 18. Oktober 1577 – 1. Mai 1578 Jakob Cappelbeck 1. Mai 1578 – 18. Oktober 1578 Johannes Vischer 18. Oktober 1578 – 1. Mai 1579 Nikolaus Varenbüler 1. Mai 1579 – 18. Oktober 1579 Johann Hochmann 18. Oktober 1579 – 1. Mai 1580 Kilian Vogler 1. Mai 1580 – 18. Oktober 1580 Georg Hamberger 18. Oktober 1580 – 1. Mai 1581 Anastasius Demler 1. Mai 1581 – 18. Oktober 1581 Dietrich Schnepff 18. Oktober 1581 – 1. Mai 1582 Jacob Heerbrand 1. Mai 1582 – 18. Oktober 1582 Johannes Vischer 18. Oktober 1582 – 1. Mai 1583 Johann Hochmann 1. Mai 1583 – 18. Oktober 1583 Anastasius Demler 18. Oktober 1583 – 1. Mai 1584 Dietrich Schnepff 1. Mai 1584 – 18. Oktober 1584 Konrad Graf von Tübingen Herr zu Lichteneck 18. Oktober 1584 – 1. Mai 1585 Georg Hamberger 1. Mai 1585 – 18. Oktober 1585 Jacob Heerbrand 18. Oktober 1585 – 1. Mai 1586 Andreas Laubmaier 1. Mai 1586 – 18. Oktober 1586 Andreas Planer 18. Oktober 1586 – 1. Mai 1587 Jacob Heerbrand 1. Mai 1587 – 18. Oktober 1587 Johann Hochmann 18. Oktober 1587 – 1. Mai 1588 Georg Hamberger 1. Mai 1588 – 18. Oktober 1588 Georg Liebler 18. Oktober 1588 – 1. Mai 1589 Matthäus Entzlin 1. Mai 1589 – 18. Oktober 1589 Andreas Laubmaier 18. Oktober 1589 – 1. Mai 1590 Andreas Planer 1. Mai 1590 – 18. Oktober 1590 Johann Hochmann 18. Oktober 1590 – 1. Mai 1591 Georg Hamberger 1. Mai 1591 – 18. Oktober 1591 Matthäus Entzlin 18. Oktober 1591 – 1. Mai 1592 Stephan Gerlach 1. Mai 1592 – 18. Oktober 1592 Daniel Mögling 18. Oktober 1592 – 1. Mai 1593 Johann Hochmann 1. Mai 1593 – 18. Oktober 1593 Johannes Halbritter 18. Oktober 1593 – 1. Mai 1594 Georg Hamberger 1. Mai 1594 – 18. Oktober 1594 Andreas Planer 18. Oktober 1594 – 1. Mai 1595 Andreas Laubmaier Prorektor: 18. Oktober 1594 – 1. Mai 1595 Stephan Gerlach 1. Mai 1595 – 18. Oktober 1595 Johann Hochmann