Merkendorf ist der Name folgender geographischer Orte: Merkendorf (Mittelfranken), Stadt im Landkreis Ansbach, Bayern
Ortsteile: Merkendorf (Itzgrund), Ortsteil der Gemeinde Itzgrund im Landkreis Coburg, Bayern Merkendorf (Memmelsdorf), Ortsteil der Gemeinde Memmelsdorf im Landkreis Bamberg, Bayern Merkendorf (Schashagen), Ortsteil der Gemeinde Schashagen im Kreis Ostholstein, Schleswig-Holstein Merkendorf (Zeulenroda-Triebes), Ortsteil der Stadt Zeulenroda-Triebes im Landkreis Greiz, Thüringen
Merkendorf (Gemeinde Bad Gleichenberg), Katastralgemeinde der Gemeinde Bad Gleichenberg im Bezirk Südoststeiermark, Steiermark Merkendorf (Gemeinde Schollach), Katastralgemeinde der Gemeinde Schollach im Bezirk Melk, Niederösterreich