Het seizoen 2006/2007 was het 42e jaar in het bestaan van de Enschedese voetbalclub FC Twente. De Tukkers kwamen uit in de Nederlandse Eredivisie, namen deel aan het toernooi om de KNVB beker en speelden in de Intertoto Cup en UEFA Cup.
De ploeg Fred Rutten was als opvolger van interim-coach Jan van Staa teruggekeerd als hoofdtrainer in het Arke Stadion. Hij combineerde het trainerschap met de functie van technisch directeur, een functie waarin hij de opgestapte Johan Plageman was opgevolgd. Samen met zijn assistent René Eijkelkamp was Rutten overgekomen van PSV, waar het tweetal als assistent-trainers onder Guus Hiddink hadden gewerkt. De nieuwe trainer roerde zich stevig op de transfermarkt. Zo kwam de Australische international Luke Wilkshire over van Bristol City en werd Rob Wielaert ingelijfd van N.E.C. Doelman Cees Paauwe keerde na anderhalf jaar ADO Den Haag terug bij Twente. Ook Niels Oude Kamphuis keerde na zeven seizoenen Bundesliga terug op zijn oude nest. Wegens een hardnekkige achillespeesblessure stopte hij echter in mei 2007 na nog geen volledig seizoen met betaald voetbal.
Otman Bakkal werd voor een jaar gehuurd van PSV en Orlando Engelaar, in wie Twente al langer belangstelling had, werd op 31 augustus 2006, de laatste dag van de transferperiode, overgenomen van het Belgische KRC Genk. Tot de vertrekkende spelers behoorden Elbekay Bouchiba (Roda JC), doelverdediger Remko Pasveer (Heracles Almelo) en Karim Touzani (Aberdeen FC).
Ook tijdens de tweede transferperiode in de winter van 2007 waren er diverse mutaties. Dmitri Sjoekov en Georgi Gakhokidze hingen hun voetbalschoenen aan de wilgen. Peter Niemeyer vertrok naar Werder Bremen, Rahim naar Skoda Xanthi en Bas Sibum naar Roda JC. Van FC Utrecht werd verdediger Edson Braafheid aangetrokken. Ismaïl Aissati werd voor een half jaar gehuurd van PSV.
Het seizoen Het seizoen 2006/2007 begon zeer moeizaam met een forse nederlaag uit tegen Heracles Almelo en uitschakeling in de tweede voorronde van de UEFA Cup tegen FC Levadia Tallinn uit Estland. Hierna werd de weg omhoog ingeslagen. De eerste thuiswedstrijd was een 1-0-zege tegen landskampioen PSV. Enkele dagen later werd de transfer van Orlando Engelaar beklonken. Engelaar zou gedurende het seizoen een sleutelrol op het middenveld opeisen en wist zich zelfs in het Nederlands elftal te spelen. Vooral thuis in het Arke Stadion bleek Twente voor tegenstanders een moeilijk te nemen horde, in de competitie ging enkel het duel tegen Ajax verloren.
In de reguliere competitie eindigde Twente op een vierde plek, op negen punten van landskampioen PSV. De ploeg kwam negentienmaal tot winst, verloor zes keer en kwam negenmaal tot een gelijk spel. Hiermee plaatste het zich voor de play-offs voor de voorronde Champions League. In twee wedstrijden werden de Tukkers echter uitgeschakeld door AZ (1-1, 0-2). Met de vierde plek plaatste de ploeg zich voor het eerst sinds 2001 rechtstreeks voor de UEFA Cup. Clubtopscorer in de competitie werd voor het vierde achtereenvolgende seizoen Blaise Nkufo, die 22 keer het net wist te vinden. Ook Kennedy Bakırcıoğlu scoorde geregeld: in totaal vijftien competitiedoelpunten.
In juli 2006 was Twente een van de winnaars van de Intertoto Cup, door te winnen van het Zweedse Kalmar FF (0-1, 3-1). Hiermee plaatste de ploeg zich voor de tweede voorronde van de UEFA Cup 2006/07, waarin echter verloren werd van FC Levadia (0-1, 1-1). In het toernooi om de KNVB beker 2006/07 werd in de tweede ronde amateurclub DOTO verslagen en in de derde ronde N.E.C. In de vierde ronde werd Twente in een thuiswedstrijd door een doelpunt in de laatste minuut uitgeschakeld door NAC Breda.
Wedstrijdstatistieken Eredivisie 2006/07 20 augustus 2006 Heracles Almelo 3 - 0 (1 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Polman Stadion8.500 toeschouwersJan Wegereef Kwame Quansah 38'Stefaan Tanghe 80'Diego Biseswar 90' Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer (64' Bakkal), Heubach, Niemeyer, Brama, Bakırcıoğlu, Gerritsen (64' Gakhokidze), Nkufo, Touma (73' Afonso)
10px Luke Wilkshire (43') 27 augustus 2006 FC Twente 1 - 0 (0 - 0) PSV Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersDick van Egmond Blaise Nkufo 72' Boschker, Wielaert, Niemeyer, Zomer, Heubach, Sibum, Brama (77' Rahim), Bakırcıoğlu, Bakkal, Nkufo, Touma (69' Gakhokidze) 8 september 2006 FC Twente 2 - 2 (1 - 2) Roda JC Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersKevin Blom Rob Wielaert 24'Kennedy Bakırcıoğlu 49' 11' Adil Ramzi28' Adil Ramzi Boschker, Niemeyer, Wielaert, Zomer, Heubach, Brama (46' Engelaar), Sibum, Bakırcıoğlu, Bakkal (85' Gerritsen), Nkufo, Touma 17 september 2006 AZ 2 - 2 (0 - 1) FC Twente Opstelling FC Twente: DSB Stadion15.900 toeschouwersRené Temmink Sjota Arveladze 57'Mousa Dembélé 88' 14' Blaise Nkufo (p)81' Sharbel Touma Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, Sibum (53' Oude Kamphuis), Niemeyer, Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo (70' Bakkal), Touma 23 september 2006 FC Twente 2 - 0 (1 - 0) Sparta Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersJack van Hulten Edwin van Bueren (ed) 19'Blaise Nkufo (p) 49' Boschker, Wielaert, Niemeyer, Zomer, Heubach, Wilkshire, Sibum (59' Oude Kamphuis), Engelaar, Bakırcıoğlu (64' Bakkal), Nkufo, Touma (84' Gerritsen) 30 september 2006 FC Twente 4 - 3 (1 - 2) RKC Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.100 toeschouwersRichard Liesveld Orlando Engelaar 45'Sharbel Touma 70'Nkufo 73'Kennedy Bakırcıoğlu 89' 17' Tim Janssen24' Pius Ikedia63' Tim Janssen Boschker, Niemeyer, Wielaert, Zomer, Heubach, Sibum (37' Bakkal), Wilkshire (90' Brama), Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (81' Gerk) 13 oktober 2006 ADO Den Haag 1 - 2 (1 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Zuiderpark Stadion6.500 toeschouwersPieter Vink Michael Mols 38' 57' Blaise Nkufo (p)74' Kennedy Bakırcıoğlu Boschker, Niemeyer, Wielaert, Zomer, Heubach, Wilkshire (74' Gerk), Sibum (46' Bakkal), Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (58' Oude Kamphuis) ADO-speler Stijn Vreven kreeg in de 57e minuut een rode kaart en een strafschop tegen, nadat hij een inzet van Peter Niemeyer op de doellijn pareerde. 21 oktober 2006 FC Twente 4 - 1 (2 - 0) Excelsior Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.125 toeschouwersPol van Boekel Sharbel Touma 22'Otman Bakkal 29'Orlando Engelaar 56'Blaise Nkufo 63' 88' Jarda Šimr Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, Brama (61' Oude Kamphuis), Engelaar (79' Sibum), Bakkal (65' Zijler), Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma 26 oktober 2006 Feyenoord 2 - 1 (0 - 1) FC Twente Opstelling FC Twente: Stadion Feijenoord38.000 toeschouwersDick Jol Stein Huysegems 46'Jonathan de Guzmán 85' 30' Sharbel Touma Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach (73' Wellenberg), Oude Kamphuis (81' Brama), Bakkal (76' Sibum), Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma 29 oktober 2006 FC Twente 4 - 0 (3 - 0) N.E.C. Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.225 toeschouwersRuud Bossen Rob Wielaert 10'Otman Bakkal 12'Otman Bakkal 16'Nkufo 89' Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer (80' Viðarsson), Heubach, Brama (82' Sibum), Bakkal (65' Gerk), Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma 5 november 2006 FC Utrecht 0 - 0 FC Twente Opstelling FC Twente: Stadion Galgenwaard19.700 toeschouwers Peter Vervecken Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, Oude Kamphuis (83' Brama), Bakkal, Engelaar, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma 12 november 2006 FC Twente 7 - 1 (2 - 1) FC Groningen Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.225 toeschouwersPieter Vink Blaise Nkufo (p) 16'Kennedy Bakırcıoğlu 45'Kennedy Bakırcıoğlu 52'Blaise Nkufo 71'Luke Wilkshire 85'Sergio Zijler 89'Sergio Zijler 90' 22' Goran Lovre Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, Brama (46' El Ahmadi), Engelaar (87' Sibum), Bakkal, Bakırcıoğlu, Nkufo (80' Gerk), Zijler De uitslag van 7-1 betekende een recordoverwinning van FC Twente in het Arke Stadion. Het was FC Twente's 1400e competitieduel in het betaalde voetbal, daarnaast was het eerste doelpunt van Kennedy Bakırcıoğlu Twente's 2200e competitiegoal in het betaalde voetbal en speelde Sander Boschker zijn 424e competitiewedstrijd voor FC Twente: een verbetering van het clubrecord van Epi Drost. 19 november 2006 Ajax 1 - 1 (0 - 1) FC Twente Opstelling FC Twente: Amsterdam ArenA49.364 toeschouwersKevin Blom Wesley Sneijder 48' 8' Orlando Engelaar Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, Bakkal (50' Niemeyer), Engelaar, El Ahmadi, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (69' Zijler) 24 november 2006 FC Twente 2 - 0 (1 - 0) Vitesse Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.250 toeschouwersRoelof Luinge Kennedy Bakırcıoğlu 34'Blaise Nkufo 89' Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, El Ahmadi, Engelaar, Bakkal (75' Zijler), Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (56' Niemeyer) 2 december 2006 NAC Breda 0 - 0 FC Twente Opstelling FC Twente: Rat Verlegh Stadion14.125 toeschouwersBen Haverkort Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer, Heubach, El Ahmadi, Engelaar, Bakkal, Bakırcıoğlu (90' Sibum), Nkufo (61' Zijler), Touma (32' Niemeyer)
15px Ramon Zomer (29') 2 december 2006 Willem II 1 - 3 (1 - 2) FC Twente Opstelling FC Twente: Willem II Stadion12.076 toeschouwersPol van Boekel Kevin Bobson 45' Blaise Nkufo 30'Blaise Nkufo 42'Blaise Nkufo 67' Boschker, Wilkshire, Wielaert, Niemeyer, Heubach (65' Wellenberg), El Ahmadi (83' Brama), Engelaar, Bakkal (80' Zijler), Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma 17 december 2006 FC Twente 5 - 1 (2 - 1) sc Heerenveen Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.250 toeschouwersJack van Hulten Blaise Nkufo 8'Sharbel Touma 41'Jeroen Heubach 57'Blaise Nkufo 72'Kennedy Bakırcıoğlu 80' 24' Afonso Alves Boschker, Wilkshire (85' Niemeyer), Wielaert, Zomer, Heubach, El Ahmadi (79' Sibum), Engelaar, Bakkal (83' Gerk), Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma Thomas Prager van Heerenveen kreeg in de 62e minuut een tweede gele kaart en dus rood. 24 december 2006 Roda JC 2 - 0 (2 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Parkstad Limburg Stadion13.000 toeschouwersRoelof Luinge Dieter Van Tornhout 2'Dieter Van Tornhout 31' Boschker, Wilkshire, Wielaert, Zomer (37' Niemeyer), Heubach, El Ahmadi, Engelaar, Bakkal, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (68' Zijler)
15px Jeroen Heubach (87') 27 december 2006 FC Twente 3 - 0 (2 - 0) AZ Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.250 toeschouwersPieter Vink Blaise Nkufo 30'Kennedy Bakırcıoğlu 42'Luke Wilkshire 59' Boschker, Niemeyer, Wielaert, Zomer, Wilkshire, El Ahmadi (90' Sibum), Engelaar, Bakkal (77' Wellenberg), Bakırcıoğlu, Nkufo (81' Gerk), Touma 30 december 2006 Sparta 3 - 0 (2 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Het Kasteel10.000 toeschouwersJan Wegereef Sjaak Polak 24'Rachid Bouaouzan 31'Ivan Tsvetkov 88' Boschker, Niemeyer, Wielaert, Zomer (55' Heubach), Wilkshire (73' Kleizen), El Ahmadi, Engelaar, Bakkal, Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma