This is a list of species in the genus Phytomyza.

Phytomyza abditus Phytomyza abdominalis Phytomyza abeliae Phytomyza abiskensis Phytomyza acanthopanicis Phytomyza achilleae Phytomyza achilleaececis Phytomyza achilleanella Phytomyza aconitella Phytomyza aconiti Phytomyza aconitophila Phytomyza actaeae Phytomyza actinidiae Phytomyza acuminata Phytomyza acutiventris Phytomyza additionalis Phytomyza adenostylis Phytomyza adjuncta Phytomyza aenescens Phytomyza aesculi Phytomyza affinalis Phytomyza affinis Phytomyza africana Phytomyza agnata Phytomyza agromyzina Phytomyza aizoon Phytomyza akebiae Phytomyza alamedensis Phytomyza alaskana Phytomyza albiceps Phytomyza albifrons Phytomyza albimargo Phytomyza albipennis Phytomyza aldrichi Phytomyza alopecuri Phytomyza alpestris Phytomyza alpigenae Phytomyza alpina Phytomyza alysi Phytomyza alysicarpi Phytomyza ambigua Phytomyza analis Phytomyza ancholiae Phytomyza anderi Phytomyza anemonantheae Phytomyza anemonephila Phytomyza anemones Phytomyza anemonivora Phytomyza angelicae Phytomyza angelicastri Phytomyza angelicivora Phytomyza angulata Phytomyza anonera Phytomyza anserimontis Phytomyza antennariae Phytomyza antennata Phytomyza anthocercidis Phytomyza anthyllidis Phytomyza aphyllae Phytomyza aposeridis Phytomyza aprilina Phytomyza aquilegiae Phytomyza aquilegiana Phytomyza aquilegioides Phytomyza aquilegiophaga Phytomyza aquilegivora Phytomyza aquilonia Phytomyza araciocecis Phytomyza araciocesis Phytomyza aragonensis Phytomyza araliae Phytomyza aralivora Phytomyza archangelicae Phytomyza arctagrostidis Phytomyza arcticola Phytomyza argentata Phytomyza aristata Phytomyza arnaudi Phytomyza arnicae Phytomyza arnicicola Phytomyza arnicivora Phytomyza aronici Phytomyza artemisivora Phytomyza asparagi Phytomyza asparagivora Phytomyza asteris Phytomyza asterophaga Phytomyza astotinensis Phytomyza astrantiae Phytomyza athamantae Phytomyza atomaria Phytomyza atricornis Phytomyza atripalpis Phytomyza aulagromyzina Phytomyza aurata Phytomyza aurei Phytomyza auricornis Phytomyza avicursa Phytomyza banffensis Phytomyza beigerae Phytomyza bellidina Phytomyza bellidis Phytomyza beringiana Phytomyza bicolor Phytomyza bifida Phytomyza bipunctata Phytomyza biseta Phytomyza blackstoniae Phytomyza boulderella Phytomyza brevicornis Phytomyza brevifacies Phytomyza brevifascies Phytomyza breviseta Phytomyza brevituba Phytomyza brischkei Phytomyza brunnea Phytomyza brunnipes Phytomyza buhri Phytomyza buhriana Phytomyza buhriella Phytomyza bukkensis Phytomyza bulbiseta Phytomyza bulgarica Phytomyza burchardi Phytomyza burmensis Phytomyza caesalpiniae Phytomyza caffra Phytomyza calceata Phytomyza californica Phytomyza californiensis Phytomyza callianthemi Phytomyza calthae Phytomyza calthivora Phytomyza calthophila Phytomyza cameronensis Phytomyza campanulae Phytomyza camuna Phytomyza cana Phytomyza canadensis Phytomyza caprifoliae Phytomyza carbonensis Phytomyza carlestolrai Phytomyza carotae Phytomyza carpesicola Phytomyza castillejae Phytomyza catalaunica Phytomyza catenula Phytomyza caulinaris Phytomyza ceanothi Phytomyza cearothi Phytomyza cecidonomia Phytomyza centaurii Phytomyza centralis Phytomyza cepelaki Phytomyza ceylonensis Phytomyza chaerophylli Phytomyza chaerophylliana Phytomyza chamaemetabola Phytomyza cheilanthus Phytomyza chelonei Phytomyza chrysocera Phytomyza cichorii Phytomyza cicutae Phytomyza cicutella Phytomyza cicutivora Phytomyza ciliata Phytomyza ciliolati Phytomyza cinerea Phytomyza cinnae Phytomyza cirrhosae Phytomyza cirsii Phytomyza cirsiophaga Phytomyza clematadi Phytomyza clematicaulis Phytomyza clematidella Phytomyza clematidicaulis Phytomyza clematidophoeta Phytomyza clematiphaga Phytomyza clematisana Phytomyza clematisella Phytomyza clematisi Phytomyza clemativora Phytomyza clematoides Phytomyza cnidii Phytomyza coloradella Phytomyza columbiana Phytomyza columbinae Phytomyza compta Phytomyza confinis Phytomyza confusa Phytomyza conglomerata Phytomyza conii Phytomyza coniopais Phytomyza conioselini Phytomyza conjuncta Phytomyza continua Phytomyza conyzae Phytomyza coquilletti Phytomyza corni Phytomyza cornuta Phytomyza cortusifolii Phytomyza corvimontana Phytomyza crassiseta Phytomyza crawfurdiae Phytomyza crepidis Phytomyza curvipes Phytomyza cygnicollina Phytomyza cytisi Phytomyza dalmatiensis Phytomyza dasyops Phytomyza davisii Phytomyza deflecta Phytomyza deirdreae Phytomyza delphinivora Phytomyza demissa Phytomyza despinosa Phytomyza deutziae Phytomyza digitalis Phytomyza dioni Phytomyza disjuncta Phytomyza disjunctivena Phytomyza distantia Phytomyza distantinervis Phytomyza ditmani Phytomyza diversicornis Phytomyza doellingeriae Phytomyza doolittlei Phytomyza doronici Phytomyza dorsata Phytomyza dreisbachi Phytomyza dryas Phytomyza dryoptericola Phytomyza dubia Phytomyza duplex Phytomyza echo Phytomyza edmontonensis Phytomyza elgonensis Phytomyza elsae Phytomyza enigma Phytomyza enigmatosa Phytomyza epistomella Phytomyza erigeronis Phytomyza erigerontophaga Phytomyza erigerophila Phytomyza eriodictyi Phytomyza esakii Phytomyza eumorpha Phytomyza eupatorii Phytomyza euphrasiae Phytomyza evanescens Phytomyza evansi Phytomyza exilis Phytomyza facialis Phytomyza fallaciosa Phytomyza farfarae Phytomyza farfarella Phytomyza fasciata Phytomyza fasciata Phytomyza felix Phytomyza fennoscandiae Phytomyza ferina Phytomyza ferruginea Phytomyza ferulae Phytomyza ferulivora Phytomyza filiformis Phytomyza filipenduliphila Phytomyza fimbriata Phytomyza flavens Phytomyza flaviantennalis Phytomyza flaviceps Phytomyza flavicornis Phytomyza flavida Phytomyza flavifacies Phytomyza flavifascies Phytomyza flavilabris Phytomyza flavilonicera Phytomyza flavimanus Phytomyza flavinervis Phytomyza flaviventris Phytomyza flavivertex Phytomyza flavofemoralis Phytomyza flavofemorata Phytomyza flavohumeralis Phytomyza flexuosa Phytomyza formosae Phytomyza franzi Phytomyza fricki Phytomyza frontalis Phytomyza fulgens Phytomyza fulvovittata Phytomyza fumariacea Phytomyza furcata Phytomyza fuscipes Phytomyza fuscula Phytomyza gei Phytomyza gelida Phytomyza geminata Phytomyza genalis Phytomyza geniculata Phytomyza geniculata Phytomyza gentianae Phytomyza gentianella Phytomyza gentii Phytomyza genualis Phytomyza gilva Phytomyza glabricola Phytomyza glacialis Phytomyza glechomae Phytomyza globulariae Phytomyza gracilis Phytomyza grandella Phytomyza gregaria Phytomyza griffithsella Phytomyza griffithsi Phytomyza griffithsiana Phytomyza grisescens Phytomyza gymnostoma Phytomyza haemorrhoidalis Phytomyza hasegawai Phytomyza hatfieldae Phytomyza hebronensis Phytomyza hecate Phytomyza heckfordi Phytomyza hedingi Phytomyza helianthi Phytomyza hellebori Phytomyza helosciadii Phytomyza hendeli Phytomyza heracleana Phytomyza heraclei Phytomyza heringiana Phytomyza heterophylli Phytomyza hiemalis Phytomyza himachali Phytomyza hirsuta Phytomyza hirta Phytomyza holosericea Phytomyza homogyneae Phytomyza hoppi Phytomyza hoppiella Phytomyza horticola Phytomyza humeralis Phytomyza humilis Phytomyza hyalipennis Phytomyza hyaloposthia Phytomyza hydrangeae Phytomyza hydrophyllivora Phytomyza hyperborea Phytomyza hypophallus Phytomyza hypophylla Phytomyza hypospinosa Phytomyza ignota Phytomyza ilicicola Phytomyza ilicis Phytomyza immanis Phytomyza immerita Phytomyza impunita Phytomyza infelix Phytomyza integerrimi Phytomyza inulicola Phytomyza inusitata Phytomyza involucratae Phytomyza isais Phytomyza isicae Phytomyza ixeridopsis Phytomyza japonica Phytomyza jasperensis Phytomyza jonaitisi Phytomyza jucunda Phytomyza jugalis Phytomyza kalopanacis Phytomyza kaltenbachi Phytomyza kamtschatkensis Phytomyza kandybinae Phytomyza kareliensis Phytomyza karmarensis Phytomyza karnarensis Phytomyza kasi Phytomyza kerteszi Phytomyza kerzhneri Phytomyza kibunensis Phytomyza kisakai Phytomyza klondikensis Phytomyza kluanensis Phytomyza knowltoniae Phytomyza krygeri Phytomyza kugleri Phytomyza kumaonensis Phytomyza kurilensis Phytomyza kyfhusana Phytomyza lactuca Phytomyza lacustris Phytomyza lanati Phytomyza lappae Phytomyza lappivora Phytomyza laterella Phytomyza lateritia Phytomyza latifolii Phytomyza latifrons Phytomyza latifrons Phytomyza leptargyreae Phytomyza leslieae Phytomyza lethe Phytomyza leucanthemi Phytomyza leucocephala Phytomyza libanotidis Phytomyza ligusticifoliae Phytomyza lindbergi Phytomyza lineata Phytomyza linnaeae Phytomyza lithospermi Phytomyza liturata Phytomyza loewii Phytomyza lonicerae Phytomyza lugentis Phytomyza lupini Phytomyza lupinivora Phytomyza lusatica Phytomyza luteoscutellata Phytomyza luzulae Phytomyza luzulivora Phytomyza lycopi Phytomyza majalis Phytomyza major Phytomyza malaca Phytomyza malaisei Phytomyza manni Phytomyza marginella Phytomyza maritima Phytomyza masoni Phytomyza masumiae Phytomyza matricariae Phytomyza medicaginis Phytomyza melana Phytomyza melanella Phytomyza melanogaster Phytomyza melanosoma Phytomyza melanostoma Phytomyza meridensis Phytomyza meridialis Phytomyza meridionalis Phytomyza merita Phytomyza mertensiae Phytomyza merula Phytomyza milii Phytomyza mimula Phytomyza mimuli Phytomyza minima Phytomyza minimoides Phytomyza minuens Phytomyza minuta Phytomyza minuta Phytomyza minutissima Phytomyza miranda Phytomyza misella Phytomyza mitchelli Phytomyza mitellae Phytomyza modica Phytomyza modocensis Phytomyza monori Phytomyza montana Phytomyza montanoides Phytomyza montella Phytomyza montereyensis Phytomyza monticola Phytomyza multifidae Phytomyza multifidi Phytomyza murina Phytomyza mutellinae Phytomyza mylini Phytomyza myosotica Phytomyza nagvakensis Phytomyza nana Phytomyza narcissiflorae Phytomyza natalensis Phytomyza neglecta Phytomyza nemopanthi Phytomyza nemophilae Phytomyza nepalensis Phytomyza nepetae Phytomyza nervi Phytomyza nervosa Phytomyza nigella Phytomyza nigra Phytomyza nigrella Phytomyza nigricans Phytomyza nigriceps Phytomyza nigricornis Phytomyza nigricornis Phytomyza nigricoxa Phytomyza nigrifemur Phytomyza nigrilineata Phytomyza nigrinervis Phytomyza nigripennis Phytomyza nigrissima Phytomyza nigrita Phytomyza nigritella Phytomyza nigrociliata Phytomyza nigroclypea Phytomyza nigroorbitalis Phytomyza nilgiriensis Phytomyza nishijimai Phytomyza nitidicollis Phytomyza nordica Phytomyza norwegica Phytomyza notata Phytomyza notopleuralis Phytomyza novitzkyi Phytomyza nowakowskiana Phytomyza nugax Phytomyza obscura Phytomyza obscurata Phytomyza obscurella Phytomyza obscuriceps Phytomyza obscuripennis Phytomyza obscuritarsis Phytomyza ochracea Phytomyza oenanthes Phytomyza oenanthica Phytomyza oenanthoides Phytomyza oligochaeta Phytomyza omlandi Phytomyza omphalivora Phytomyza opaca Phytomyza opacae Phytomyza opacella Phytomyza orbitella Phytomyza oreas Phytomyza oreophila Phytomyza orientalis Phytomyza origani Phytomyza orindensis Phytomyza orlandensis Phytomyza orobanchia Phytomyza oscinina Phytomyza osmorhizae Phytomyza ovalis Phytomyza ovimontis Phytomyza oxytropidis Phytomyza palionisi Phytomyza pallens Phytomyza pallida Phytomyza pallipes Phytomyza pallitarsis Phytomyza palmeri Phytomyza palpata Phytomyza palustris Phytomyza pampeana Phytomyza paniculatae Phytomyza paraciliata Phytomyza paracontinua Phytomyza paranigrifemur Phytomyza paratripolii Phytomyza paratrolliivora Phytomyza parva Phytomyza parvicella Phytomyza pastinacae Phytomyza pauliloewi Phytomyza pedicularicaulis Phytomyza pedicularidis Phytomyza pedicularifolii Phytomyza penicilla