thumb|Heutiges Logo der Universität Liste der Rektoren der Universität Tartu von ihrer Gründung 1632 bis heute.
Academia Gustaviana (1632–1665) Jakob Skytte (1632–1633) Andreas Virginius (1633) Heinrich Hein (1633–1634) Johann Below (1634) Michael Savonius (Prorektor, 1634–1635) Georg Manzel (Prorektor, 1635–1636) Georg Manzel (1636) Lorenz Luden (1636–1637) Peter Schomer (1637–1638) Salomon Matthiae (1638) Andreas Virginius (1638–1639) Heinrich Hein (1639–1640) Johann Below (1641–1641) Andreas Virginius (1641–1642) Lorenz Luden (1642–1643) Johannes Ericsson (1643–1644) Salomon Matthiae (1644–1645) Andreas Virginius (1645–1646) Heinrich Hein (1648–1649) Salomon Matthiae (1649–1650) Sebastian Wirdig (1650–1651) Johannes Stiernstråle (1651–1652) Lorenz Luden (1652–1653) Joachim Schelen (1653–1654) Johannes Stiernstråle (1654–1655) Heinrich Hein (1655–1656) Andreas Virginius (Prorektor, 1657) Georg Preuss (Prorektor, 1658) Gabriel Elffring (Prorektor, 1659–1660) Georg Preuss (Prorektor, 1661–1662) Gabriel Elffring (Prorektor, 1663–1665)
Academia Gustavo-Carolina (1690–1710) Olaus Moberg (1690) Carl Lund (1690–1691) Lars Micrander (1691) Gustav Carlholm (1691–1692) Crispin Jernfeld (1692) Olaus Skragge (1692–1693) Gabriel Skragge (1693) Gabriel Sjöberg (1693–1694) Sven Cameenhjelm (1694) Sven Dimberg (1694–1695) Michael Dau (1695) Olaus Moberg (1695–1696) Olaus Skragge (1696) Jakob Friedrich Below (1696–1697) Gabriel Skragge (1697) Lars Molin (1697–1698) Gabriel Sjöberg (1698) Sven Cameenhjelm (1698–1699) Michael Dau (1699–1700) Daniel Sarcovius (1700) Daniel Eberhard (1700) Olaus Moberg (1700–1701) Sven Cameenhjelm (1701) Lars Molin (1701–1702) Michael Dau (1702) Johan Folcher (1702–1703) Samuel Auseen (1703) Daniel Sarcovius (1703–1704) Anders Palmrooth (1704) Erik Fahlenius (1704–1705) Samuel Auseen (1705) Lars Braun (1705–1706) Johan Folcher (1706–1707) Jakob Wilde (1707) Ingemund Bröms (1707–1708) Conrad Quensel (1708) Nicolaus Wiraeus (1708–1709) Carl Schultén (1709) Elof Holstenius (1709–1710)
Kaiserliche Universität Dorpat (1802–1893) Georg Friedrich Parrot (Prorektor, 1802–1803) Georg Friedrich Parrot (1803) Daniel Georg Balk (1803–1804) Adam Christian Gaspari (1804–1805) Georg Friedrich Parrot (1805–1806) Carl Friedrich Meyer (1806–1808) Christian Friedrich von Deutsch (1809–1810) David Hieronymus Grindel (1810–1812) Georg Friedrich Parrot (1812–1813) Martin Ernst von Styx (Prorektor, 1813–1814) Martin Ernst von Styx (1814) Friedrich Eberhard Rambach (1814–1816) Christian Steltzer (1816) Ferdinand Giese (Prorektor, 1816–1817) Ferdinand Giese (1817–1818) Gustav von Ewers (1818–1830) Johann Parrot (Prorektor, 1830–1831) Johann Parrot (1831–1834) Johann Christian Moier (1834–1836) Christian Friedrich Neue (1836–1839) Karl Christian Ulmann (1839–1841) Alfred Wilhelm Volkmann (Prorektor, 1841–1842) Alfred Wilhelm Volkmann (1842) Christian Friedrich Neue (1843–1851) Eduard Haffner (1851–1858) Friedrich Heinrich Bidder (1858–1865) Guido Samson von Himmelstjerna (1865–1868) Georg Philipp von Oettingen (1868–1876) Ottomar Meykow (1876–1881) Eduard von Wahl (1881–1885) Alexander Schmidt (1885–1890) Ottomar Meykow (1890–1892) Anton Budilowitsch (1892–1901)
Kaiserliche Universität Jurjew (1893–1918) Anton Budilowitsch (1892–1901) Aleksandr Filippow (1901–1903) Grigori Lewitski (1903–1905) Jewgeni Passek (1905–1908) Wissarion Aleksejew (Prorektor, 1908–1909) Wissarion Aleksejew (1909–1914) Pjotr Pustoroslew (1915–1917) Wissarion Aleksejew (1917–1918)
Landesuniversität Dorpat (1918) Karl Dehio (1918)
Universität Tartu der Republik Estland (Eesti Vabariigi Tartu Ülikool, 1919–1940) Peeter Põld (Kurator, 1919) Heinrich Koppel (1920–1928) Johan Kõpp (1928–1937) Hugo Kaho (1938–1940) Heinrich Riikoja (1940)
Universität Tartu der estnischen Selbstverwaltung (Eesti Omavalitsuse Tartu Ülikool, 1941–1944) Edgar Kant (provisorisch, 1941–1944)
Staatliche Universität Tartu (Tartu Riiklik Ülikool, 1940–1941 und 1944–1989) Hans Kruus (1940–1941) Hans Kruus (1944) Alfred Koort (1944–1951) Feodor Klement (1951–1970) Arnold Koop (1970–1988) Jüri Kärner (1988–1993)
Universität Tartu (Tartu Ülikool, seit 1989) Jüri Kärner (1988–1993) Peeter Tulviste (1993–1998) Jaak Aaviksoo (1998–2006) Tõnu Lehtsaar (geschäftsführend, 2006/2007) Alar Karis (2007–2012) Volli Kalm (2012–2017) Tõnu Lehtsaar (geschäftsführend, 2017/2018) Toomas Asser (seit 1. August 2018)
Literatur Album Rectorum Universitatis Tartuensis, 1632–1997. Hrsg. von Sirje Tamul. Tartu 1997
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