Die Familie Caliciviridae (Caliciviren) umfasst derzeit vier Gattungen von unbehüllten Viren mit einer einzelsträngigen, linearen RNA mit positiver Polarität. Caliciviridae sind die Erreger verschiedener Erkrankungen beim Menschen und bei Tieren, darunter auch Kaninchen, Hasen, Schweine, Katzen, Mäuse, Rinder, Wale, Flossenfüßer (Robben) und Reptilien. Mit Ausnahme der Spezies der Gattung Vesivirus zeigen die jeweiligen Caliciviren ein enges Wirtsspektrum und können nur schwer von einer Wirtsspezies zu einer anderen übertragen werden.
Morphologie mini|hochkant=1.30|Schemazeichnung: Virionen der Familie Caliciviridae mit Triangulationszahl T=3 (groß) und T=1 (klein) – Querschnitt und Aufsicht Die kugelförmigen Viruspartikel der Caliciviridae erscheinen bei Negativkontrastierung im TEM etwa 27 bis 40 nm im Durchmesser groß (Bild rechts mit 50-nm-Markierung), im Kryoelektronenmikroskop 35 bis 40 nm. Bei der Abbildung im TEM zeigen die Caliciviren eine kleine, kelchförmige Eindellung, von der sie ihren Namen erhielten (lat. calix: Becher, Pokal). Die Partikel sind unbehüllte Kapside, die aus 90 Dimeren des Haupt-Strukturproteins aufgebaut sind. Sie zeigen eine ikosaedrische T=3 Symmetrie.
Genom
Das Genom der Caliciviridae ist monopartit (nicht-segmentiert) und besteht aus einem linearen ssRNA-Molekül positiver Polarität. Seine Größe beträgt 7,3 bis 8,3 kb (Kilobasen). Das 5'-Ende ist an ein VPg-Protein gebunden und das 3'-Ende ist polyadenyliert.SIB: Caliciviridae . Auf: ViralZone.
Systematik Innere Systematik Familie Caliciviridae Genus BavovirusIan N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages (Hühner) Spezies Bavaria virus (alias Hühner-Calicivirus) Genus LagovirusSIB: Lagovirus, auf: ViralZone Spezies Rabbit Hemorrhagic Disease Virus Spezies European brown hare syndrome virus Genus MinovirusIan N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages Spezies Minovirus A (veraltet Fathead minnow calicivirus, FHMCV, Amerikanische Dickkopfelritze Pimephales promelas) Genus NacovirusIan N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages (Hühner und Truthühner) Genus Nebovirus (früher Becovirus, Nabovirus, Bovines Entero-Calicivirus, en. Bovine enteric calcivirus, Enteropathogenic bovine calicivirus)Turhan Turan et al.: Detection and Molecular Analysis of Bovine Enteric Norovirus and Nebovirus in Turkey. In: J Vet Res., 2018 Juni; 62(2), S. 129–135., doi:10.2478/jvetres-2018-0021, J. R. Smiley, K. O. Chang, J. Hayes, J. Vinjé, L. J. Saif: Characterization of an Enteropathogenic Bovine Calicivirus Representing a Potentially New Calicivirus Genus. In: J Virol., 2002 Oct; 76(20), S. 10089–10098. doi:10.1128/JVI.76.20.10089-10098.2002, Spezies Newbury-1-Virus (englisch Newbury 1 virus) Stamm NB Spezies „Kırklareli Virus“Feray Alkan et al.: Identification of a Bovine Enteric Calicivirus, Kırklareli Virus, Distantly Related to Neboviruses, in Calves with Enteritis in Turkey. In: J Clin Microbiol., 2015 Nov; 53(11), S. 3614–3617. doi:10.1128/JCM.01736-15, Genus NorovirusEda Altan, Kristen Aiemjoy, Tung G. Phan, Xutao Deng, Solomon Aragie, Zerihun Tadesse, Kelly E. Callahan, Jeremy Keenan, Eric Delwart: Enteric virome of Ethiopian children participating in a clean water intervention trial, in: Plos One, 16. August 2018, doi:10.1371/journal.pone.0202054 Spezies Norwalk-Virus (NoV, 7 Genotypen) Vorläufige Spezies des Genus Norovirus: Spezies „Bovines Norovirus-CH126“ Spezies „Bovines Norovirus-Jena“ (kurz „Jena virus“) Spezies „Humanes Norovirus-Alphatron“ Spezies „Humanes Norovirus Saitama“ Spezies „Murines Norovirus 1“ Spezies „Porcines Norovirus“ (Norovirus des Schweines) Spezies „Norovirus der Auster“ Genus Recovirus (Rhesus enteric calicivirus, in Stuhlproben von Rhesusaffen nachgewiesen)T. Farkas, K. Sestak, C. Wei, X. Jiang: Characterization of a rhesus monkey calicivirus representing a new genus of Caliciviridae. In: J Virol, 2008, 82, S. 5408–5416. doi:10.1128/JVI.00070-08Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages Spezies Recovirus AICTV: Proposal 2018.014S Stamm Tulane-Virus (TV)Najoua Drouaz, Julien Schaeffer, Tibor Farkas, Jacques Le Pendu, Françoise S. Le Guyader; K. E. Wommack, Editor (Hrsg.): Tulane Virus as a Potential Surrogate To Mimic Norovirus Behavior in Oysters. In: Appl Environ Microbiol, 81, S. 5249–5256. American Society for Microbiology, 7. Juli 2015, PMID 26025893, doi:10.1128/AEM.01067-15 Genus SalovirusIan N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages (Atlantischer Lachs Salmo salar) Genus SapovirusSIB: Sapovirus, auf: ViralZone Spezies Sapporo-Virus (SaV, 6 Genotypen) Vorläufige Spezies des Genus Sapovirus: Spezies „Porcines Entero-Sapovirus“ (Cowden) Spezies „Nerz-Entero-Sapovirus“ Genus ValovirusY. L’Homme, R. Sansregret, E. Plante-Fortier, A.M. Lamontagne, M. Ouardani, G. Lacroix, C. Simard: Genomic characterization of swine caliciviruses representing a new genus of Caliciviridae. In: Virus Genes, 39, S. 66–75, PMID 19396587. Epub 2009 Apr 26.Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages Spezies St-Valerien-Schweine-Virus , veraltet , SVV, bei SchweinenB. Di Martino, V. Martella, F. Di Profio, C. Ceci, F. Marsilio: Detection of St-Valerien-like viruses in swine, Italy. In: Vet Microbiol., 2011 Apr 21;149(1-2), S. 221–224. doi:10.1016/j.vetmic.2010.10.008, PMID 21115307. Epub 16. Oktober 2010Go Sato, Hisayuki Ido, Masahiro Kiuchi, Michiyo Kataoka, Kazuhiko Katayama, Yukinobu Tohya: Characterization of St-Valerien-Like Virus Genome Detected in Japan. In: J Vet Med Sci., 2014 Jul; 76(7), S. 1045–1050. doi:10.1292/jvms.13-0468, , PMID 24662519 Genus VesivirusSIB: Vesivirus, auf: ViralZone Spezies Felines Calicivirus (en. Feline calicivirus, 2 Genotypen) Spezies Vesikulärexanthem-Virus (en. Vesicular exanthema of swine virus, VEV oder VESV, Typusspezies), urspr. Erkrankung beim Schwein mit bislang 9 Stämmen (Subspezies): Subspezies Bovines Calicivirus Subspezies Wal-Calicivirus Subspezies Primaten-Calicivirus Subspezies Reptilien-Calicivirus Subspezies San-Miguel-Seelöwenvirus (SMSV) Serotypen 1, 4, 17 Subspezies Calicivirus des Stinktieres Subspezies Vesikulärexanthem-Virus Serotyp A48 Vorläufige Spezies der Gattung Vesivirus: Spezies „Nerz-Calicivirus“ Spezies „Canines Calicivirus“ Spezies „Walross-Calicivirus“ Vorläufige – mit Stand März 2019 noch nicht vom ICTV bestätigte – Gattungen: Genus „Sanovirus“Ian N. Clarke et al.: Sanovirus. The Calcivirus Pages Spezies „Gänse-Calicivirus“ Genus „Secalivirus“Ian N. Clarke et al.: Secalivirus. The Calcivirus Pages Spezies „Sewage associated calici-like virus“ (SecaliV, gefunden im Abwasser, ) Weitere vorgeschlagene Spezies innerhalb der Familie Calciviridae ohne Genuszuordnung (Auswahl): „Fledermaus-Calicivirus“ (englisch „Bat calcivirus“)Jacob F. Kocher, Lisa C. Lindesmith, Kari Debbink, Anne Beall, Michael L. Mallory, Boyd L. Yount, Rachel L. Graham, Jeremy Huynh, J. Edward Gates, Eric F. Donaldson, Ralph S. Barić; W. Ian Lipkin (Hrsg.): Bat Caliciviruses and Human Noroviruses Are Antigenically Similar and Have Overlapping Histo-Blood Group Antigen Binding Profiles. In: mBio Mai 2018, 9 (3) e00869-18; doi:10.1128/mBio.00869-18
Für die innere Systematik gibt es verschiedene Vorschläge. Gemeinsamkeit ist, dass sich die Calciviridae in zwei Hauptgruppen teilen: „Sapovirus-Gruppe“: Genera Lagovirus, Nebovirus, Vesivirus und Sapovirus (mit typischem Aussehen der Virionen) „Norovirus-Gruppe“: Genus Norovirus zusammen mit weiteren vorgeschlagenen Genera (mit kleinen, rundlichen, strukturierten Virionen) Das folgende Kladogramm basiert auf dem Vorschlag von Siqueira et al. (2018),Juliana D. Siqueira, Maria Gloria Dominguez-Bello, Monica Contreras, Orlana Lander, Eric Delwart: Complex virome in feces from Amerindian children in isolated Amazonian villages. In: Nature Communications, 9(1), Dezember 2018, doi:10.1038/s41467-018-06502-9 ergänzt durch vorgeschlagene Genera nach Mikalsen et al. (2014):Aase B Mikalsen, Pål Nilsen, Marianne Frøystad-Saugen, Karine Lindmo, Trygve M Eliassen, Marit Rode, Øystein Evensen: Characterization of a Novel Calicivirus Causing Systemic Infection in Atlantic Salmon (Salmo salar L.): Proposal for a New Genus of Caliciviridae. In: PLoS ONE 9(9), S. e107132, September 2014, doi:10.1371/journal.pone.0107132
Teilweise abweichende Vorschläge – ohne Berücksichtigung der puativen Gattungen – findet man in älteren Veröffentlichungen wie z. B.: Ian N. Clarke et al. (2017)Ian N. Clarke et al.: The Calicivirus Pages: Calciviridae, auf: The Pirbright Institute, UK (2006–2017) Ian N. Clarke et al. (2012)Ian N. Clarke, M. K. Estes, Kim Y. Green, G. S. Hansman, Nick Knowles, Marion Koopmans, D. O. Matson, G. Meyers, John Neill, A. Radford, A. W. Smith, Michael Studdert, H.-J. Thiel, Jan Vinjé: Caliciviridae, Virus taxonomy: the classification and nomenclature of viruses. In: The ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Januar 2012, S. 977–986. Scipioni et al. (2008)A. Scipioni, Axel Mauroy, Jan Vinjé, E. Thiry: Review of Animal Noroviruses. In: Veterinary Journal 178 (Januar 2008), S. 32–45, Public Health Resources, University of Nebraska – Lincoln Espinosa et al. (2004)Sarbelio Moreno Espinosa, Tibor Farkas, Xi Jiang: researchgate.net. In: Seminars in Pediatric Infections Diseases 15(4), S. 237–245, November 2004, doi:10.1053/j.spid.2004.07.004 – keine Abweichung zu Siqueira et al. (2018)
Äußere Systematik Koonin et al. haben 2015 die Caliciviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) einer von ihnen postulierten Supergruppe „Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Mai 2015; S. 479–480. 2–25, Epub 12. März 2015, , PMID 25771806 Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden. Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die #35 des ICTV vom März 2020ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35) Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Picornavirales §ICTV Master Species List #35.
Literatur K. Y. Green, R. M. Chancock und A. Z. Kapikian: Human caliciviruses. In: David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology. 4. Auflage. Philadelphia 2001, ISBN 978-0-7817-1832-5. C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego, 2005, Family Caliciviridae S. 843–851.
Weblinks The Calcivirus Pages: Calciviridae. The Pirbright Institute (UK), 2006–2017.
Einzelnachweise
Kategorie:Virusfamilie Kategorie:Picornaviren