Die Angiosperm Phylogeny Group war eine Gruppe von Botanikern um Mark Chase (* 1951), die zusammen an der Phylogenie der Bedecktsamer arbeiteten. Die Gruppe hat von 1998 bis 2016 vier Klassifikationen veröffentlicht, die sich rasch gegen ältere Systematiken durchsetzten. Die Publikation von 2016, APG IV, löste alle vorhergehenden Entwürfe der APG ab.

Chase nahm bereits in den 1980er-Jahren die Arbeit auf, erste Anläufe scheiterten jedoch aufgrund nicht hinreichend leistungsfähiger Computertechnik. Erst 1993 konnte die dann Angiosperm Phylogeny Group getaufte Arbeitsgruppe mit der Datensammlung beginnen. 1995 lagen ausreichende Datenmengen vor, um eine Auswertung zu starten, die 1998 in die erste Publikation mündeten. Geleitet wurde die APG von Mark Chase von den Kew Gardens, des Weiteren am Projekt beteiligt waren die Universität Stockholm, der Botanische Garten Bergius Stockholm, die Universität Florida, die University System of Maryland sowie der Botanische Garten Missouri.

Die Arbeit der Gruppe konzentriert sich auf Ordnungen sowie Familien, höhere Rangstufen ersetzt sie durch informelle Gruppen wie beispielsweise Monocots, Rosids, Asterids oder Commelin(o)ids, die zwar monophyletische Gruppen (Taxa), aber keine Kategorien darstellen. Gattungen oder Arten finden nur vereinzelt Erwähnung. Als Grundlage der Klassifikationen dienten Ergebnisse phylogenetischer Arbeiten, die meist anhand molekulargenetischer Untersuchungen gewonnen wurden. Sie wurden rasch zur Referenz auch für Standardwerke und Lehrbücher wie den Strasburger (36. Auflage), die „Evolutionsbiologie“ von Storch, Welsch, Wink oder der 2. Auflage von Thomas N. Taylor u. a. „Paleobotany. The Biology and Evolution of Fossil Plants“ von 2008.

Im Rahmen der weiteren Veröffentlichungen 2003, 2009 (die zunächst die letzte hätte sein sollen) und 2016 wurde die Klassifikation weiter aktualisiert und verbessert.

Spätere molekulargenetische Studien Li et al (2019) hatten aufgrund von Plastiden-DNA aus allen 64 Ordnungen und 85 % aller Familien (nach APG IV) die frühe Evolutionsgeschichte der Bedecktsamer analysiert. Dabei mussten sechs Ordnungen (Petrosaviales, Oxalidales, Celastrales, Malpighiales, Santalales und Berberidopsidales) im Stammbaum geringfügig umplatziert werden; bei weiteren sechs (Dilleniales, Boraginales, Gentianales, Lamiales, Asterales und Escalloniales) konnte der Zeitpunkt, in welcher sich die Kladen in die jeweiligen Ordnungen auftrennten, genauer bestimmt werden.

Lin et al (2025) analysierten die mitochondriale, proteinkodierende DNA aus 63 Ordnungen und 335 Familien. Dabei wurde bemerkt, dass frühere Studien die Petrosaviales aufgrund unterschiedlicher Probensammlung unterschiedlich eingeordneten – die Ergebnisse ändern sich recht deutlich, je nachdem Erbgut von mykoheterotrophen Petrosavia oder von autotrophen Japonolirion im Spiel ist. Heterotrophe Arten unterscheiden sich oft deutlich im Erbgut ihrer Zellkerne und Plastiden, weil der Verlust der Photosynthese die biochemischen Vorgänge deutlich verändert. Bei folgenden Gattungen wurde eine andere Zuordnung nahegelegt: Lotosgewächse (Nelumbonaceae, APG IV: Silberbaumartige) sind eine Schwestergruppe der Silberbaumartigen (Proteales) die Columelliaceae gehören eher den Escalloniales an, als den Bruniales den größten Unterschied ergibt sich bei den Malteserschwammgewächsen (Cynomoriaceae): Diese wurden in die Steinbrechartigen (Saxifragales, Angehörige der Superrosiden) eingeteilt; diese Studie legt eine engere Verwandtschaft mit Storchschnabelartigen nahe, die den Rosiden angehören die Francoaceae sind eher eine Schwestergruppe der Myrtenartigen, als ein Mitglied der Storchschnabelartigen die Huaceae (APG IV: Oxalidales) scheinen eine Familie zu sein, die sich vor den Ordnungen Oxalidales und Celastrales gebildet hatte.

Bei beiden genannten Arbeiten war Mark W. Chase beteiligt, der Gründer der APG.

Klassifikation APG Die erste Systematik der Bedecktsamer der APG erschien 1998 unter dem Titel An Ordinal Classification for the Families of Flowering Plants und umfasste 462 Familien in 40 Ordnungen. Autoren waren Arne A. Anderberg, Anders Backlund, Birgitta Bremer, Kåre Bremer, Barbara G. Biggs, Mark W. Chase, Peter K. Endress, Michael F. Fay, Peter Goldblatt, Mats H.G. Gustafsson, Sara B. Hoot, Walter S. Judd, Mari Källersjö, Elizabeth A. Kellogg, Kathleen A. Kron, Donald H. Les, Cynthia M. Morton, Daniel L. Nickrent, Richard G. Olmstead, Robert A. Price, Christopher J. Quinn, James E. Rodman, Paula J. Rudall, Peter F. Stevens, Vincent Savolainen, Douglas E. Soltis, Pamela E. Soltis, Kenneth J. Sytsma und Mats Thulin.

Dieser Entwurf war die Modifikation einer Systematik, die von Kåre Bremer, Birgitta Bremer und Mats Thulin in den ersten drei Auflagen ihrer Introduction to phylogeny and systematics of flowering plants von 1995 bis 1997 veröffentlicht worden und seit 1996 auch im Internet zu finden war.Siehe dazu .

Nicht zugeordnet (Keine Benennung) Keine Ordnungseinteilung Austrobaileyaceae, Canellaceae, Chloranthaceae, Hydnoraceae, Illiciaceae, Seerosengewächse (Nymphaeaceae), Cabombaceae, Rafflesiaceae, Schisandraceae, Trimeniaceae, Winteraceae Ceratophyllales Hornblattgewächse (Ceratophyllaceae) Laurales Atherospermataceae, Calycanthaceae, Gomortegaceae, Hernandiaceae, Lorbeergewächse (Lauraceae), Monimiaceae, Siparunaceae Magnoliales Annonaceae, Degeneriaceae, Eupomatiaceae, Himantandraceae, Magnoliengewächse (Magnoliaceae), Myristicaceae Piperales Aristolochiaceae, Lactoridaceae, Pfeffergewächse (Piperaceae), Saururaceae

Monocots (Keine Benennung) Keine Ordnungseinteilung Corsiaceae, Japonoliriaceae, Nartheciaceae, Petrosaviaceae, Triuridaceae Nicht-Commelinoide Kalmusartige (Acorales) Kalmusgewächse (Acoraceae) Froschlöffelartige (Alismatales) Froschlöffelgewächse (Alismataceae), Wasserährengewächse (Aponogetonaceae), Aronstabgewächse (Araceae), Schwanenblumengewächse (Butomaceae), Cymodoceaceae, Froschbissgewächse (Hydrocharitaceae), Dreizackgewächse (Juncaginaceae), Limnocharitaceae, Neptungrasgewächse (Posidoniaceae), Laichkrautgewächse (Potamogetonaceae), Saldengewächse (Ruppiaceae), Blumenbinsengewächse (Scheuchzeriaceae), Tofieldiaceae, Seegrasgewächse (Zosteraceae) Spargelartige (Asparagales) Agapanthaceae, Agavengewächse (Agavaceae), Lauchgewächse (Alliaceae), Amaryllisgewächse (Amaryllidaceae), Anemarrhenaceae, Anthericaceae, Aphyllanthaceae, Spargelgewächse (Asparagaceae), Affodillgewächse (Asphodelaceae), Asteliaceae, Behniaceae, Blandfordiaceae, Boryaceae, Convallariaceae, Doryanthaceae, Hemerocallidaceae, Herreriaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Hypoxidaceae, Schwertliliengewächse (Iridaceae), Ixioliriaceae, Lanariaceae, Laxmanniaceae, Orchideen (Orchidaceae), Tecophilaeaceae, Themidaceae, Xanthorrhoeaceae, Xeronemataceae Yamswurzelartige (Dioscoreales) Burmanniaceae, Yamswurzelgewächse (Dioscoreaceae), Taccaceae, Thismiaceae, Trichopodaceae Lilienartige (Liliales) Alstroemeriaceae, Campynemataceae, Colchicaceae, Liliengewächse (Liliaceae), Luzuriagaceae, Melanthiaceae, Philesiaceae, Ripogonaceae, Smilacaceae Schraubenbaumartige (Pandanales) Scheibenblumengewächse (Cyclanthaceae), Schraubenbaumgewächse (Pandanaceae), Stemonaceae, Velloziaceae Commelinoide Keine Ordnungseinteilung Abolbodaceae, Dasypogonaceae, Hanguanaceae, Palmenartige (Arecales) Palmengewächse (Arecaceae) Commelinaartige (Commelinales) Commelinagewächse (Commelinaceae), Haemodoraceae, Philydraceae, Pontederiaceae Süßgrasartige (Poales) Anarthriaceae, Bromeliengewächse (Bromeliaceae), Centrolepidaceae, Sauergräser (Cyperaceae), Ecdeiocoleaceae, Eriocaulaceae, Flagellariaceae, Hydatellaceae, Joinvilleaceae, Juncaceae, Mayacaceae, Süßgräser (Poaceae), Prioniaceae, Rapateaceae, Restionaceae, Igelkolbengewächse (Sparganiaceae), Thurniaceae, Rohrkolbengewächse (Typhaceae), Xyridaceae Ingwerartige (Zingiberales) Cannaceae, Costaceae, Helikoniengewächse (Heliconiaceae), Lowiaceae, Marantaceae, Bananengewächse (Musaceae), Strelitziaceae, Ingwergewächse (Zingiberaceae)

Dicots Nicht-Core-Eudicots Keine Ordnungseinteilung Sabiaceae, Trochodendraceae, Tetracentraceae Buxales Buchsbaumgewächse (Buxaceae), Didymelaceae Proteales Lotusgewächse (Nelumbonaceae), Platanaceae, Silberbaumgewächse (Proteaceae) Ranunculales Berberidaceae, Circaeasteraceae, Eupteleaceae, Lardizabalaceae, Menispermaceae, Papaveraceae, Hahnenfußgewächse (Ranunculaceae) Core-Eudicots Keine Ordnungseinteilung Aextoxicaceae, Berberidopsidaceae, Dilleniaceae, Gunneraceae, Myrothamnaceae, Vitaceae Caryophyllales Achatocarpaceae, Mittagsblumengewächse (Aizoaceae), Fuchsschwanzgewächse (Amaranthaceae), Ancistrocladaceae, Asteropeiaceae, Basellgewächse (Basellaceae), Kakteengewächse (Cactaceae), Nelkengewächse (Caryophyllaceae), Didiereaceae, Dioncophyllaceae, Sonnentaugewächse (Droseraceae), Taublattgewächse (Drosophyllaceae), Frankeniaceae, Molluginaceae, Nepenthaceae, Nyctaginaceae, Physenaceae, Phytolaccaceae, Plumbaginaceae, Knöterichgewächse (Polygonaceae), Portulakgewächse (Portulacaceae), Rhabdodendraceae, Sarcobataceae, Simmondsiaceae, Stegnospermataceae, Tamaricaceae Santalales Olacaceae, Opiliaceae, Riemenblumengewächse (Loranthaceae), Misodendraceae, Sandelholzgewächse (Santalaceae) Saxifragales Altingiaceae, Cercidiphyllaceae, Crassulaceae, Daphniphyllaceae, Grossulariaceae, Haloragaceae, Hamamelidaceae, Iteaceae, Paeoniaceae, Penthoraceae, Pterostemonaceae, Steinbrechgewächse (Saxifragaceae), Tetracarpaeaceae Core-Eudicots: Rosids: Andere Keine Ordnungseinteilung Aphloiaceae, Crossosomataceae, Ixerbaceae, Krameriaceae, Picramniaceae, Podostemaceae, Stachyuraceae, Staphyleaceae, Tristichaceae, Zygophyllaceae Geraniales Francoaceae, Storchschnabelgewächse (Geraniaceae), Ledocarpaceae, Honigstrauchgewächse (Melianthaceae), Vivianiaceae Core-Eudicots: Rosids: Eurosids (I) Keine Ordnungseinteilung Celastraceae, Huaceae, Parnassiaceae, Lepuropetalaceae, Stackhousiaceae Malpighiales Achariaceae, Balanopaceae, Caryocaraceae, Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Dichapetalaceae, Erythroxylaceae, Wolfsmilchgewächse (Euphorbiaceae), Euphroniaceae, Flacourtiaceae, Goupiaceae, Hugoniaceae, Humiriaceae, Irvingiaceae, Ixonanthaceae, Lacistemataceae, Linaceae, Malesherbiaceae, Malpighiengewächse (Malpighiaceae), Medusagynaceae, Ochnaceae, Pandaceae, Passifloraceae, Putranjivaceae, Quiinaceae, Rhizophoraceae, Weidengewächse (Salicaceae), Scyphostegiaceae, Trigoniaceae, Turneraceae, Violaceae Oxalidales Cephalotaceae, Connaraceae, Cunoniaceae, Elaeocarpaceae, Sauerkleegewächse (Oxalidaceae), Tremandraceae Fabales Schmetterlingsblütler (Fabaceae), Polygalaceae, Quillajaceae, Surianaceae Rosales Barbeyaceae, Hanfgewächse (Cannabaceae), Dirachmaceae, Ölweidengewächse (Elaeagnaceae), Maulbeergewächse (Moraceae), Kreuzdorngewächse (Rhamnaceae), Rosengewächse (Rosaceae), Ulmengewächse (Ulmaceae), Brennnesselgewächse (Urticaceae) Cucurbitales Anisophylleaceae, Begoniaceae, Coriariaceae, Corynocarpaceae, Kürbisgewächse (Cucurbitaceae), Datiscaceae, Tetramelaceae Fagales Birkengewächse (Betulaceae), Casuarinaceae, Buchengewächse (Fagaceae), Juglandaceae, Myricaceae, Nothofagaceae, Rhoipteleaceae, Ticodendraceae Core-Eudicots: Rosids: Eurosids (II) Keine Ordnungseinteilung Cytinaceae, Tapisciaceae Myrtales Alzateaceae, Flügelsamengewächse (Combretaceae), Crypteroniaceae, Weiderichgewächse (Lythraceae), Schwarzmundgewächse (Melastomataceae), Memecylaceae, Myrtengewächse (Myrtaceae), Oliniaceae, Nachtkerzengewächse (Onagraceae), Penaeaceae, Rhynchocalycaceae, Vochysiaceae Brassicales Akaniaceae, Bretschneideraceae, Bataceae, Kreuzblütengewächse (Brassicaceae), Caricaceae, Emblingiaceae, Gyrostemonaceae, Koeberliniaceae, Limnanthaceae, Bennussgewächse (Moringaceae), Pentadiplandraceae, Resedaceae, Salvadoraceae, Setchellanthaceae, Tovariaceae, Tropaeolaceae Malvales