Orthologie (altgriech. orthos (Ὀρθός Orthós): ‚gerade, aufrecht‘ bzw. 'rechtens, richtig' und logos (λόγος lógos) ‚die Lehre, das Wissen‘) steht für: in der Medizin die Kunde oder die Wissenschaft vom Normalzustand eines Organs oder Systems; das Gegenteil ist die Pathologie in der Genetik das Verhältnis zwischen zwei Genen in verschiedenen Spezies, die eine gemeinsame Abstammung haben, siehe Homologie (Genetik) #Homologie zwischen verdoppelten oder fremden Genen