Alphahydrivirus permafrostis ist eine im August 2025 vom (ICTV) offiziell bestätigte Spezies (Art) von Riesenviren. Sie ist (mit Stand 24. April 2026) die einzige Art der Gattung Alphahydrivirus, diese wiederum die einzige in der Familie Hydriviridae der Unterordnung Ocovirineae, zu der die ähnlichen Gattungen Alphacedratvirus und Alphaorpheovirus gehören. Das für die Spezies exemplarische Virus – Siberian hydrivirus MAG1 (SHMAG1, ursprünglich Hydrivirus R_bin116_k1) – wurde per Metagenomik aus sibirischem Permafrostboden identifiziert.
Beschreibung Die vollständige Genomsequenz OW988864 von MAG1 [Hydrivirus R_bin116_k1] wurde aus metagenomischen Daten assembliert. Die phylogenetische Analyse zeigte vergleichsweise lange Zweige, die dieses Virus von Vertretern der Familie Orpheoviridae trennen, sowie große Unterschiede im Geninhalt – was für die Bildung einer eigenen Familie Hydriviridae sprach. Deren Gründungsmitglied ist damit die Gattung Alphahydrivirus, vertreten durch die Art Alphahydrivirus permafrostis.
Zusammen mit den Familien Orpheoviridae und Pithoviridae gehört die Familie Hydriviridae zur Unterordnung Ocovirineae. Deren Mitglieder weisen alle ein charakteristisches, längliches, eiförmiges Virion mit einer endständigen, mundartigen Struktur auf, unterscheiden sich untereinander aber deutlich in Genomgröße und Geninhalt.
Unter den Riesenviren zeigt die (vorgeschlagene) Gattung „Pandoravirus“ eine vergleichbare Morphologie wie die Ocovirineae-Familien Pithoviridae, Orpheoviridae und Hydriviridae, hat aber einen deutlich abweichenden Geninhalt, der eher dem der ikosaedrischen dsDNA-Viren der Phycodnaviridae oder Imitervirales ähnelt.
Genom Die Genomsequenz OW988864 von MAG1 [Hydrivirus R_bin116_k1] ist eine zirkuläre dsDNA mit einer Länge von 1.599.776 bp (Basenpaaren), also etwa 1,6 Mbp.
Systematik Die Systematik gemäß ICTV ist wie folgt:
Familie Hydriviridae Gattung Alphahydrivirus (früher: Hydrivirus) Spezies Alphahydrivirus permafrostis Siberian hydrivirus MAG1 (SHMAG1): Hydrivirus R_bin116_k1 – Fundort: Umweltprobe: Metagenom aus Permafrost-Boden (), Alas, Republik Sacha (Jakutien), Russland61°45'53.6"N 130°27'54.1"E. Auf: Bing Maps.61°45'53.6"N 130°27'54.1"E. Auf: mappingsupport.com. (zwischen Khorobut (Хоробут)Khorobut. Auf: GeoNames. und Bëkë/Byokyo (Беке)Bëkë. Auf: GeoNames.)
Namensherkunft Der Gattungsname besteht aus dem Präfix Alpha für die erste identifizierte Gattung ihrer Familie, gefolgt von virus, was darauf verweist, dass diese Gensequenz offenbar mit Hydrozoa assoziiert scheint. Wirte könnten also einzellige Symbionten dieser Hydrozoen sei – oder diese selbst.
Das Art-Epitheton permafrostis ist neu und hat die Bedeutung „aus dem Permafrost“.
Einzelnachweise ICTV: Master Species Lists (MSL). Abgerufen am 15. April 2026. ICTV: Virus Metadata Resource (VMR). Abgerufen am 15. April 2026. Jean-Michel Claverie, Matthieu Legendre, Sofia Rigou, Chantal Abergel: Creation of a new suborder within the Pimascovirales to position and name Pithovirus-related isolates. ICTV 2024, 2024.005F.Pimascovirales_reorg.zip (zip, docx). 2024.005F.Pimascovirales_reorg. NCBI Nucleotide: uncultured virus genome assembly, scaffold: R_bin116_k1, whole genome shotgun sequence. Accession: OW988864 CALPDT010000000. BioSample: SAMEA12941162; SRA: ERS10539957. Pithovirus/Orpheovirus Permafrost:Hydrivirus. Claire Bertelli, Linda Mueller, Vincent Thomas, Trestan Pillonel, Nicolas Jacquier, Gilbert Greub: Cedratvirus lausannensis – digging into Pithoviridae diversity. In: Environmental Microbiology, Band 19, Nr. 10, 15. Juni 2017, S. 4022-4034; doi:10.1111/1462-2920.13813 (). Jean-Michel Claverie, Matthieu Legendre, Sofia Rigou, Chantal Abergel: Refining the taxonomy of pithovirus-related giant DNA viruses within the order Pimascovirales. In: Archives of Virology, Band 170, Nr. 111, 24. April 2025; doi:10.1007/s00705-025-06297-3, PMID 40268777 (). Matthieu Legendre, Julia Bartoli, Lyubov Shmakova, Sandra Jeudy, Karine Labadie, Annie Adrait, Magali Lescot, Olivier Poirot, Lionel Bertaux, Christophe Bruley, Yohann Couté, Elizaveta Rivkina, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie: Thirty-thousand-year-old distant relative of giant icosahedral DNA viruses with a pandoravirus morphology. In: PNAS, Band 111, Nr. 11, 3. März 2014, S. 4274-4279; doi:10.1073/pnas.1320670111 (). Sofia Rigou, Sébastien Santini, Chantal Abergel, Jean-Michel Claverie, Matthieu Legendre: Past and present giant viruses diversity explored through permafrost metagenomics. In: Nature Communications, Band 13, Nr. 5853, 7. Oktober 2022; doi:10.1038/s41467-022-33633-x ().
Kategorie:Virusspezies Kategorie:Nucleocytoviricota