Pseudomonadati ist ein 2024 aufgestelltes Bakterien-Reich, das etwa ein Drittel aller bekannten Arten von Prokaryoten (Bakterien und Archaeen) umfasst (Stand 2009ohne die sog. mikrobielle dunkle Materie: DNA-Sequenzen aus der Metagenomik etc.). Es umfasst hauptsächlich gramnegative Bakterien und deren Verwandte. Es galt (auf seiner Ebene) als der nächste Verwandte eines noch größeren Reiches der Bakterien, der Bacillati, bei denen es sich überwiegend um grampositive Bakterien handelt (seit der Ausgliederung des kleinere Reichs Thermotogati aus den Bacillati gilt das so nicht mehr).
Benennung und Namensherkunft Der Name des Taxons, Pseudomonadati, ist neu und zusammengesetzt aus den Namen der Typusgattung Pseudomonas, sowie der Plural-Endung , die Prokaryoten-Reiche kennzeichnet. Der Name bezeichnet also das Reich der Gattung Pseudomonas. Dieser Gattungsname Pseudomonas selbst setzt sich zusammen aus dem Präfix (‚so wie‘, ‚scheinbar‘) von bzw. , und , ‚Einheit‘ (‚Einzeller‘). Die Gattung wurde zuerst von Walter Migula Ende des 19. Jahrhunderts identifiziert und er wollte sie damit möglicherweise als nicht wirkliche Mitglieder der Protisten-Gattung Monas begeißelter nanogroßer Goldbrauner Algen kennzeichnen.
Die heutige Bezeichnung Pseudomonadati ist der offizielle Name für eine bereits 1978 von Gibbons und Murray umschriebene Klade „Gracilicutes“ und umfasst das 2012 von Luketa vorgeschlagene Superphylum „Hydrobacterida“ [„Hydrobacteria“, deutsch Hydrobakterien], ergänzt um das von ihm gleichzeitig vorgeschlagene Superphylum „Aquificida“ [„Aquificae“]. Die beiden Namen leiten sich ab von der bzw. en Bezeichnung für Wasser (, als Präfix , respektive ) und beziehen sich auf die feuchte Umgebung, die für den gemeinsamen Vorfahren dieser Arten angenommen wird. Auf heutiger Ebene der Reiche (als offizielle Rangstufe anstelle des informellen ‚Superphylum‘) sind daher beide Bezeichnungen von Luketa Juniorsynonyme des seit 2024 nach dem (einzig) gültig veröffentlichten und damit offiziellen Namens Pseudomonadati.
Das 1978 von Gibbons und Murray beschriebene Taxon „Gracilicutes“ wurde oder wird noch manchmal anstelle der modernen Bezeichnung Pseudomonadati verwendet. Allerdings umfasste „Gracilicutes“ auch die zum Reich Bacillati gehörenden Cyanobakterien. Zudem wurde dieser Name nicht nach dem heute allgemein anerkannten Drei-Domänen-System (Bakterien, Archaeen, Eukaryoten) konstruiert. Im Jahr 2006 wurde von Thomas Cavalier-Smith eine Neudefinition von „Gracilicutes“ vorgeschlagen, die jedoch keine molekulare Phylogenie oder statistische Analysen umfasste. Zudem folgte sie ebenfalls nicht dem Drei-Domänen-System, da eine Abstammungslinie der Klade aus Eukaryoten und Archaeen als innerhalb der Bakterien entspringend mit dem Phylum Actinomycetota als engen Verwandten vorausgesetzt wurde – ein Stammbaum, der in molekularen Phylogenie nirgends unterstützt wird.
Systematik Nach Gareth A. Coleman et al. (2021) und Raphaël R. Léonard et al. gehören zum Reich Pseudomonadati folgende Phyla und Superphyla (mit heutigen Bezeichnungen): FCB-Superphylum, PVC-Superphylum, Acidobacteriota, Aquificota, Bdellovibrionota,mit Klasse Oligoflexia; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN Campylobacterota [„Epsilonbacteraeota“],mit Klasse Epsilonproteobacteria [„Campylobacteria“, „Nautiliia“]; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN Deferribacterota,in der GTDB zu Chrysiogenota Thermodesulfobacteriota,Desulfobacteria, Desulfuromonadia, Dissulfuribacteria, … Elusimicrobiota, Myxococcota,mit Klasse Myxococcia, …; eigenes Phylum in der NCBI-Taxonomie, Synonym in der LPSN Nitrospirota, Pseudomonadota,Proteobacteria s. l., d. h. als Phylum, nicht Klasse: Purpurbakterien und Verwandte Spirochaetota.
Im Detail ist die derzeit (Stand 20. Januar 2026) akzeptierte Taxonomie, basierend auf der (LPSN) und dem (NCBI), ergänzt um Einträge aus der (GTDB), wie folgt:
Reich Pseudomonadati 2024(L,N) [„Aquificida“ 2012(L), „Hydrobacterida“ 2012(L), …] (Proteobakterien s. l.)
Phylum Abditibacteriota et al. 2023(L,N) – in der GTDB zu Armatimonadota(G) (dieses Phylum gehört aber lt. LPSN und NCBI-Taxonomie zum Reich Bacillati)
Phylum Acidobacteriota 2021(L,G) bzw.
Phylum Aquificota 2021(L,G) bzw. bzw. – Thermosulfidibacterota ist in der NCBI-Taxonomie kein Synonym, sondern eigenes Phylum(N)– mit Aquificales (Aquifex, Persephonella, Hydrogenivirga, …)
Phylum Atribacterota et al. 2021(L,N,G)
Phylum Caldisericota et al. 2021(L,G) bzw. – mit Caldisericum, Coprothermobacter, Thermodesulfobium
Phylum Calditrichota et al. 2021(L,G)
Phylum Chrysiogenota 2021(L,G) ,
Phylum Coprothermobacterota et al. 2021(L,N,G)
Phylum „Candidatus Cryosericota“ et al. 2019(N)– in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Caldisericota(G)
Phylum Deferribacterota 2021(L) bzw. – in der GTDB zu Chrysiogenota(G)
Phylum Dictyoglomerota corrig. 2021(L) – mit Dictyoglomus
Phylum Elusimicrobiota et al. 2021(L,G) – mit Elusimicrobium
Phylum Nitrospinota et al. 2021(L,G)
Phylum Nitrospirota 2021(L,G) bzw. (Thermodesulfovibrio-Nitrospira-Gruppe)– in der GTDB Abspaltungen Nitrosptota_A und Nitrospirota_B(G)
Phylum Pseudomonadota et al. 2021(L,G) bzw. (photosynthetische Purpubakterien und Verwandte(N)) – in der NCBI-Taxonomie ist Bdellovibrionota kein Synonym, sondern eigenes Phylum, ebenso Campylobacterota alias „Epsilonbacteraeota“ und Myxococcota(N)
Phylum Spirochaetota 2021(L,G) bzw. (Spirochäten)– mit Spirochaeta
Phylum Thermodesulfobacteriota 2021(L) bzw. – mit Thermodesulfatator
Phylum Thermomicrobiota 2021(L) bzw. – in der GTDB zu Chloroflexota(G)
Phylum „Candidatus Zhurongbacterota“ et al. 2023(L,N) – in der GTDB zu Coprothermobacterota(G)
Zur FCB-Gruppe (s. l.) innerhalb der Pseudomonadati gehören folgende Phyla:(N)
Phylum Bacteroidota et al. 2021(L,G)
Phylum Balneolota et al. 2021(L) – in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
Phylum Chlorobiota et al. 2021(L) (Grüne Schwefelbakterien) in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien); in der NCBI-Taxonomie ist Ignavibacteriota eigenes Phylum, nicht synonym(N)
Phylum „Candidatus Cloacimonadota“ corrig. et al. 2013(L,G)
Phylum „Candidatus Electryoneota“ et al. 2022(L,N,G) – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
Phylum „Candidatus Fermentibacterota“ et al. 2016(L,G) bzw. – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB inkl. Gattung „Ca. Aegiribacteria“ (sic!)(G) (diese in der NCBI-Taxonomie zur FCB-Gruppe incertae sedis, in der LPSN Bakterien incertae sedis(L))
Phylum Fibrobacterota 2021(L,G)
Phylum Fidelibacterota et al. 2024(L,N)
Phylum Gemmatimonadota et al. 2021(L,G)
Phylum „Candidatus Hydrogenedentota“ corrig. et al. 2015(L,N,G) – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
Phylum „Candidatus Kapaibacteriota“ corrig. et al. 2015(L) bzw. – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
Phylum „Candidatus Kryptoniota“ corrig. et al. 2016(L) – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L), in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
Phylum „Candidatus Latescibacterota“ corrig. et al. 2013(L,G)
Phylum Rhodothermota et al. 2021(L) (Rhodothermaceae etc.)– in der GTDB zu Bacteroidota_A(G) (Grüne Schwefelbakterien)
Phylum „Candidatus Zhuqueibacterota“ et al. 2024(L,N,G)
Phylum „Candidatus Zixiibacteriota“ corrig. et al. 2013(L,N) – verwaister Eintrag in der LPSN(L)
Zur PVC-Gruppe innerhalb der Pseudomonadati gehören folgende Phyla:(N)
Phylum „Candidatus Auribacterota“ et al. 2017(L,N,G) – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
Phylum Chlamydiota 2021(L,G) bzw. corrig. 2021(N)
Phylum Kiritimatiellota et al. 2021(L) bzw. (früher Verrucomicrobia (N); Kiritimatiellia etc.)– in der GTDB zu Verrucomicrobiota(G)
Phylum Lentisphaerota et al. 2021(L) bzw. – in der GTDB zu Verrucomicrobiota(G)
Phylum „Candidatus Omnitrophota“ corrig. et al. 2013(L,G) bzw. – in der LPSN Bakterien incertae sedis(L)
Phylum Planctomycetota 2021(L,G) bzw.
Phylum Verrucomicrobiota 2021(L,G)
L – (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) N – Taxonomie des (NCBI) G – (GTDB)
Das Phylum Thermodesulfobiota et al. 2023 gehört nach der maßgeblichen LPSN als Synonym von Bacillota zum Reich Bacillati (wird aber in der NCBI-Taxonomie hier zu zu Pseudomonadati(N) klassifiziert).
Als Bakteriengruppen incertae sedis wird heute (18. Januar 2026) in der LPSN und NCBI-Taxonomie angesehen: „Ca. Babelota“ [„Ca. Dependentiae“, ].Zu unterscheiden von Burkholderia sp. TM6 und Pseudomonas sp. TM6 (zu Beta- bzw. Gammaproteobacteria und damit im Phylum Pseudomonadota [Proteobacteriota]).GTDB: Babelota.
Phylogenie und Taxonomie Es wird heute (Stand 2009) angenommen, dass sich Pseudomonadati und Bacillati vor etwa 3 Milliarden Jahren auseinanderentwickelt haben, was darauf hindeutet, dass das Land (die Urkontinente, d. h. Kratone) zu dieser Zeit von Prokaryoten besiedelt war.
Einige ältere nicht „unrooted“ molekulare phylogenetische Analysen haben die Dichotomie von Bacillati und Pseudomonadati nicht bestätigt, aber die neuere genomischen Analysen, einschließlich solcher, die sich auf die Verwurzelung des Stammbaums konzentriert haben, haben ergeben, dass diese beiden Gruppen monophyletisch sind.
Zusammen bilden Pseudomonadati und Bacillati eine große Klade, die 99 % aller bis 2009 bekannten Bakterienarten, und 97 % der Prokaryoten (Bakterien und Archaeen) umfasst. und von Battistuzzi und Hedges in Anspielung auf die phototrophen Fähigkeiten vieler Mitglieder per Vorschlag als „Selabacteria“ bezeichnet wurde (von ). Mit Stand 2022 wurde noch diskutiert, welche bakteriellen Phyla außerhalb der Reiche Pseudomonadati und Bacillati liegen und somit das Taxon Selabacteria rechtfertigen. Inzwischen gelten die Fusobacteriati und Thermotogati als anerkannte weitere Bakterienreiche. Die Definition der beiden Reiche Pseudomonadati und Bacillati als Hauptkladen innerhalb der Domäne Bacteria basiert größtenteils auf verwurzelten phylogenetischen Analysen von Genomen. Nicht verwurzelte Analysen haben diese Einteilung nicht vollständig bestätigt, was die Bedeutung verwurzelter Stammbäume des Lebens unterstreicht.
Phylogenie 2009
Phylogenie 2022 Zwei jüngere Analysen der bakteriellen Phylogenie (2021 und 2022) stützten beide die Unterteilung in Pseudomonadati und Bacillati. Allerdings interpretierten sie die Evolution der Zellwand unterschiedlich: Die eine Studie kam zu dem Schluss, dass der letzte gemeinsame Vorfahr der Bakterien (, LBCA) ein Monoderm (grampositives Bakterium) war, die andere, dass es sich um einen Diderm (gramnegatives Bakterium) handelte. Der folgende Stammbaum wurde aus einer der beiden Studien neu gezeichnet und zeigt die Phylogenie der bakteriellen Phyla und Superphyla, wobei die Position der Fusobacteriota dort noch unklar ist und die DST-Gruppe (siehe Thermotogati) der nächste Verwandte der Bacillati ist:
Anmerkungen
Einzelnachweise LPSN: Kingdom Pseudomonadati (Gibbons and Murray 1978) Oren and Göker 2024. LPSN: Phylum Thermodesulfobiota Frolov et al. 2023. Taxonomic status: synonym. Correct name: Bacillota Gibbons and Murray 2021. NCBI Taxonomy Browser: Pseudomonadati, Details: Pseudomonadati (Gibbons and Murray 1978) Oren and Göker 2024. Graphisch: Pseudomonadati, auf: Lifemap. NCBI Taxonomy Browser: Search: Marinisomatota (complete name). GTDB: Bacteria.
Fabia U. Battistuzzi, S. Blair Hedges: Eubacteria. In: S. Blair Hedges, Sudhir Kumar (Hrsg.): The Timetree of Life. Oxford University Press (Oxford Academic), New York 23. April 2009, S. 106–115; Kapitel-doi:10.1093/oso/9780199535033.003.0007, Online-ISBN 9781383044720, Print-ISBN 9780199535033, Buch-doi:10.1093/oso/9780199535033.001.0001 ().