„Candidatus Hodarchaeum“ ist eine Kandidaten-Gattung von Archaeen. Sie gehört zur monotypischen Kandidaten-Familie „Ca. Hodarchaeaceae“ und mit dieser zur monotypischen Kandidaten-Ordnung „Ca. Hodarchaeales“ (früher als LC-3 bezeichnet). Diese gehört zur monotypischen Kandidaten-Klasse „Ca. Hodarchaeia“ im monotypischen Kandidaten-Phylum „Ca. Hodarchaeota“. Während dieses Phylum in der LPSN ohne Zuordnung zu einem Archaeen-Reich ist, wird es in der NCBI-Taxonomie dem Reich Promethearchaeati (Asgard-Archaeen) zugeordnet.
Die GTDB klassifiziert jedoch abweichend die Ordnung Hodarchaeales in die Klasse Heimdallarchaeia im Phylum Asgardarchaeota (entspricht dort vom Umfang her dem Reich Promethearchaeati).
„Ca. Hodarchaeum“ umfasst die einzige (Kandidaten-)Art „Ca. Hodarchaeum mangrovi“. Die GTDB ordnet jedoch zusätzlich etliche DNA-Sequenzen („Isolate“) aus der Metagenomik weiteren Spezies der Gattung zu, die in der NCBI-Taxonomie meist den Hodarchaeen ohne nähere Zuordnung (incertae sedis) untergeordnet werden.
Forschungsgeschichte Yang Liu, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Meng Li et al. veröffentlichten 2021 eine vergleichende Analyse von 162 vollständigen oder nahezu vollständigen Genomen von Asgard-Archaeen. Darunter befanden sich 75 neue MAGs (aus Metagenomen zusammengesetzte Genome), was zu dieser Zeit eine erhebliche Erweiterung der phylogenetischen Vielfalt der Asgard-Archaeen darstellte und sie veranlasste, zugleich sechs zusätzliche Phyla in dieser Supergruppe vorzuschlagen. Eines dieser Kandidaten-Phyla war Hodarchaeota, das den Stamm bzw. das MAG As_027 (Spezies „Ca. Hodarchaeum mangrovi“) beherbergt.
Sun et al. klassifizierten 2021 die Ordnung „Ca. Hodarchaeales“ [Klade LC-3] in die Klasse „Ca. Heimdallarchaeia“ zu.
Zhang et al. schlossen 2025 auf Basis einer detaillierten phylogenomischen Analyse unter Einbeziehung mehrerer Markersätze, dass die Eukaryoten bereits vor der Diversifizierung der Klasse „Ca. Heimdallarchaeia“ abzweigten und nicht (wie anderweitig früherer angenommen) zusammen mit „Ca. Hodarchaeales“ innerhalb der Klasse „Ca. Heimdallarchaeia“.
Systematik Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der (LPSN) und dem (NCBI), ergänzt um Einträge aus der (GTDB), Stand: 4. Januar 2026:
Gattung "Candidatus Hodarchaeum" et al. 2021(L) bzw. 2020(N) Spezies "Candidatus Hodarchaeum mangrovi" et al. 2021(L,G) bzw. 2020(N) Stamm As_027(L) alias FT2_5_011 – Fundort: Meeresküsten-Sediment, Futian Nature Reserve, Shenzhen, China Stamm FT_5_011(N,G) – Fundort: Meeresküsten-Sediment, Futian Nature Reserve, Shenzhen, China(N) Stamm MWH_BASALT_bin2412(N) (Autor: H. Li) – Fundort: China(N) Stamm SJG_metabat2_bin1771(N) (Autor: H. Li) – Fundort: China(N)
Spezies Hodarchaeum sp011364965(G) Stamm N1B_bin6.179(N,G) – Fundort: Ästuar des Chang Jiang, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp020353515(G) Stamm bin6(N,G) – Fundort: westlich der Insel Diu Tin LukDiu Tin Luk. Auf: alamy (alamy.it, ). im SW von Lantau, Hongkong(N)
Spezies Hodarchaeum sp020351745(G) Stamm bin76(N,G) – Fundort: westlich der Insel Diu Tin Luk im SW von Lantau, Hongkong(N)
Spezies Hodarchaeum sp020348965(G) Stamm bin272(N,G) – Fundort: westlich der Insel Diu Tin Luk im SW von Lantau, Hongkong(N)
Spezies Hodarchaeum sp016840035(G) Stamm YT1_021(N,G) – Fundort:marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp016839815(G) Stamm YT2_004(N,G) – Fundort:marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp016839785(G) Stamm YT2_065(N,G) – Fundort:marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp016839625(G) Stamm YT5_056(N,G) – Fundort: marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp003144275(G) Stamm B3_Heim(N,G) – Fundort: im Meeresgebiet zwischen Hongkong und Kaoshiung (Taiwan)(N)
Spezies Hodarchaeum sp011364965(G) Stamm SZ_4_bin2.246(N,G) – Fundort: Mangroven-Sediment, Bucht von Shenzhen, China(N)
Spezies Hodarchaeum sp019057635(G) Stamm MAG_8(N,G) – Fundort: Sediment einer Methan-Ausströmung, Santa Monica Mounds, Pazifik vor Kalifornien(N)
Spezies Hodarchaeum sp030589605(G) Stamm CSMAG_10(N,G) – Fundort: Metagenom einer kalten Sickerstelle ()(N)
Spezies Hodarchaeum sp029856365(G) Stamm WORE3(N,G) – Fundort: Ästuar des White Oak River (WOR),White Oak River. Mapcarta (de).The White Oak River. Auf: North Carolina's Southern Outer Banks & Crystal Coast (coastalnc.org). North Carolina, USA(N)
Spezies Ca. Hodarchaeota archaeon isolate YT_005(N) [früher Stamm YT_005(N) – Fundort: marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Ca. Hodarchaeota archaeon isolate YT_019(N) [früher Stamm YT_019(N) – Fundort: marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
Spezies Ca. Hodarchaeota archaeon isolate YT5_036(N) [früher Stamm YT5_036(N) – Fundort: marine Küstensedimente im Schwanensee-Naturreservat (), Provinz Shandong, China(N)
L – (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) N – Taxonomie des (NCBI) G – (GTDB), dazu: G* – früherer Eintrag in der GTDB G:N – NCBI-Name laut GTDB offenbar frühere NCBI-Bezeichnung Die NCBI-Bezeichnungen einiger Stämme spiegeln offenbar noch die frühere Klassifizierung der Gattung bzw. Ordnung zur Klasse „Ca. Heimdallarchaeia“ mit ihren Phylum wider.
Etymologie Der vorgeschlagene Gattungsname Hodarchaeum setzt sich zusammen aus dem neu Suffix ; der Präfix verweist auf Höd(ur) (Höðr), in der nordischen Mythologie Sohn des Gottes Odin.
Das Art-Epitheton mangrovi ist neuer Genitiv mit der Bedeutung ‚von einer Mangrove‘ oder ‚zur Mangrove gehörig‘.
Anmerkungen
Einzelnachweise LPSN: Genus "Candidatus Hodarchaeum" Liu et al. 2021, Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ). NCBI: "Candidatus Hodarchaeum", Details: "Candidatus Hodarchaeum" Liu et al. 2020 (genus); graphisch: Candidatus Hodarchaeum, auf Lifemap. GTDB: Salinirubellus. Rohdaten: ar53_metadata.tsv.gz (Fallback).
Yingchun Han, Chuwen Zhang, Zhuoming Zhao, Yongyi Peng, Jing Liao, Qiuyun Jiang, Qing Liu, Zongze Shao, Xiyang Dong: A comprehensive genomic catalog from global cold seeps. In: Scientific Data, Band 10, Nr. 1, 8. September 2023, S. 596; , , PMID 37684262 (). Yang Liu, Kira S. Makarova, Wen-Cong Huang, Yuri I. Wolf, Anastasia N. Nikolskaya, Xinxu Zhang, Mingwei Cai, Cui-Jing Zhang, Wei Xu, Zhuhua Luo, Lei Cheng, Eugene V. Koonin, Meng Li: Expanded diversity of Asgard archaea and their relationships with eukaryotes. In: Nature, Band 593, 28. April 2021, S. 553–557; , , PMID 33911286 (). Jiarui Sun, Paul N. Evans, Emma J. Gagen, Ben J. Woodcroft, Brian P. Hedlund, Tanja Woyke, Philip Hugenholtz, Christian Rinke: Recoding of stop codons expands the metabolic potential of two novel Asgardarchaeota lineages. In: ISME Communications, Band 1, Nr. 1, Dezember 2021, S. 30; , , PMID 36739331; Epub 28. Juni 2021 Jun 28 (). Jiawei Zhang, Xiaoyuan Feng, Meng Li, Yang Liu, Min Liu, Li-Jun Hou, Hong-Po Dong: Deep origin of eukaryotes outside Heimdallarchaeia within Asgardarchaeota. In: Nature, Band: 642, Nr. 8069, 7. Mai 2025, Print-, S. 990–998; , , PMID 40335687, Online-, Epub 7. Mai 2025 (). Siehe insbes. Fig. 3 und Ext. Data Fig. 1. Dazu: Eukaryotes’ Deep Origin Outside Heimdallarchaeia. Auf: Bioengineer (bioengineer.org) vom 8. Mai 2025.
Kategorie:Asgardarchaeota