180x180px|mini|Backhefe mini|Der Fadenwurm Caenorhabditis elegans unter dem Mikroskop.
Diese Liste von sequenzierten Genomen umfasst Genome der Eukaryoten - Lebewesen mit - und Prokaryoten - Lebewesen ohne Zellkern - als auch ihrer Viren, deren Genom vollständig sequenziert wurden.
Das kleine zirkuläre und einzelsträngige DNS-Genom (sscccDNA) des φX174 Bakteriophagen von nur wenigen tausend Nukleotiden (5386 Basenpaare, bp) wurde erstmals 1977 von Frederick Sanger sequenziert, welches bedeutet, dass seine Nukleotidsequenz mit Hilfe von Sanger-DNS-Sequenzierung erstmalig vollständig ermittelt werden konnte. Nach und nach wurde die DNS von ganzen Chromosomen und Genomen komplexer Lebewesen sequenziert. Die erste Sequenzierung des vollständigen Genoms eines Lebewesens gelang 1995 mit dem Bakterium Haemophilus influenzae. Die so ermittelten Basensequenzen werden über das Internet, unter anderem vom NCBI, bereitgestellt.
1996 wurde mit der Backhefe (Saccharomyces cerevisiae), die zu den Pilzen gehört, das erste Genom eines Eukaryonten veröffentlicht und 1998 wurde mit dem zu den Tieren gehörenden Fadenwurm Caenorhabditis elegans das erste Genom eines Mehrzellers veröffentlicht.
Die Forschung konzentrierte sich zunächst auf die Sequenzierung von Organismen, die entweder für die Grundlagenforschung oder die für die anwendungsorientierte, medizinisch-pharmazeutische Forschung von besonderem Interesse sind. Solche eukaryontische Organismen sind in dieser Liste zu finden. Mit dem Fortschritt der Technik wurde die Sequenzierung immer schneller, einfacher und somit auch günstiger, so dass inzwischen das Genom von über 50.000 (Stand: 2020) verschiedenen Organismen analysiert werden konnte.
Die Sequenz von Genen und Genomen kann genutzt werden um Konservierung dieser festzustellen und basierend darauf die physiologischen Wichtigkeit einiger Gene und deren RNSn und Proteinen als auch relative Alter der Gene und somit der Spezies zu klären.
Eukaryonten Die Genome eukaryotisches Lebens sind für human-zentrierte Forschung besonders notwendig, da der Mensch selber Teil dieser Domäne ist.
Unikonta
Fungi - Pilze Aufgelistet sind die fünf Pilze, deren Genom zuerst sequenziert wurde. Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung BildSaccharomyces cerevisiaeStrain:S288CBackhefeBackhefe; Modellorganismus Eukaryont12.1 Mb6 294International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing1996 zentriert|160x120pxEncephalitozoon cuniculiMicrosporidiumHumanpathogen2.9 Mb1 997Genoscope und Université Blaise Pascal2001Schizosaccharomyces pombeStrain:972h-SpalthefenModellorganismus Eukaryont14 Mb4 824Sanger Institute und Cold Spring Harbor Laboratory2002 zentriert|160x120pxNeurospora crassaSordariomycetesModellorganismus Eukaryont40 Mb10 082Broad Institute, Oregon Health, Science University, University of Kentucky und die University of Kansas2003 zentriert|160x120pxPhanerochaete chrysosporiumStrain:RP78 StielporlingsartigerHolzpilz für Verrottung, wird für Bioremediation verwendet30 Mb11 777Joint Genome Institute2004
Animalia - Tiere Aufgelistet sind die vier Tiere, deren Genom zuerst sequenziert wurde. Außerdem sind Säugetiere, deren Genom vor 2010 sequenziert wurde und weitere wichtige Modellorganismen in die Liste aufgenommen.
Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation / Bemerkung Jahr der Sequenzierung BildCaenorhabditis elegansStrain:Bristol N2NematodeModellorganismus Tier100 Mb19 000Washington University und das Sanger Institute1998Drosophila melanogasterFruchtfliegeModellorganismus Tier165 Mb13 600Celera, UC Berkeley, Baylor College of Medicine, European DGP2000zentriert|160x110pxHomo sapiensPrimatenMensch3.2 Gb18 826 (CCDS consortium)Human Genome Project Consortium und Celera Genomics2001 Entwurf 2006 Vollständig zentriert|160x130pxAnopheles gambiaeStrain: PESTStechmückeVerbreitung von Malaria278 Mb13 683Celera Genomics und Genoscope2002 zentriert|160x120pxTakifugu rubripesKugelfischWirbeltier mit kleinem Genom, japanischer Kugelfisch390 Mb22 000 – 29 000International Fugu Genome Consortium. International Fugu Genome Consortium2002 zentriert|160x120pxMus musculus Strain: C57BL/6JNagetiereHausmausca. 3 Gb24 0002002Pierre L. Roubertoux et al.: From DNA to mind. In: EMBO Reports. Juli 2007, Band 8 (S1): S7–S11, doi:10.1038/sj.embor.7400991MapViewer Eintrag.zentriert|160x120pxRattus norvegicusNagetiereWanderratte2.8 Gb2004 Entwurf zentriert|160x120pxPan troglodytesPrimatenSchimpanse 3.3 Gb2005MapViewer Eintrag zentriert|160x130pxCanis familiarisCanidaeHaushund2.5 Gb19 3002005MapView Eintrag zentriert|160x120pxOrnithorhynchus anatinusSäugetierSchnabeltier1.9 Gb18 6002007 Entwurf 2021 vollständigY. Zhou et al. Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution. Nature, online publiziert, 6. Januar 2021; doi:10.1038/s41586-020-03039-0 zentriert|160x120pxMonodelphis domesticaBeuteltiereHaus-Spitzmausbeutelratte18 000–20 000 GeneMonodelphis_domestica, Ensembl genome browser 104MIT und Harvard2007zentriert|160x120pxMacaca mulattaPrimatenRhesusaffe3.1 Gb30 0002007MapViewer Eintrag zentriert|160x120pxFelis catusFelidaeHauskatze 2.7 Gb 20 0002007J. U. Pontius, J. C. Mullikin, D. R. Smith, K. Lindblad-Toh, S. Gnerre, M. Clamp, J. Chang, R. Stephens, B. Neelam, N. Volfovsky, A. A. Schäffer, R. Agarwala, K. Narfström, W. J. Murphy, U. Giger, A. L. Roca, A. Antunes, M. Menotti-Raymond, N. Yuhki, J. Pecon-Slattery, W. E. Johnson, G. Bourque, G. Tesler, S. J. O'B: Initial sequence and comparative analysis of the cat genome. In: Genome Research. Band 17, Nummer 11, November 2007, S. 1675–1689, . doi:10.1101/gr.6380007. PMID 17975172. .zentriert|160x120px Wollhaarmammut Elephantidae Erste Sequenzierung des Genoms einer ausgestorbenen Tierart. > 4Gb 2008 rund 70 Prozent der Erbinformation entschlüsselt, 2015 komplettes GenomComplete Genomes Reveal Signatures of Demographic and Genetic Declines in the Woolly Mammoth, Palkopoulou, Eleftheria et al., Current Biology, Volume 25, Issue 10, 1395–1400 2008Webb Miller, Daniela I. Drautz, Aakrosh Ratan, Barbara Pusey, Ji Qi, Arthur M. Lesk, Lynn P. Tomsho, Michael D. Packard, Fangqing Zhao, Andrei Sher, Alexei Tikhonov, Brian Raney, Nick Patterson, Kerstin Lindblad-Toh, Eric S. Lander, James R. Knight, Gerard P. Irzyk, Karin M. Fredrikson, Timothy T. Harkins, Sharon Sheridan, Tom Pringle, Stephan C. Schuster: Sequencing the nuclear genome of the extinct woolly mammoth. In: Nature. 456, 2008, S. 387–390. (online) zentriert|160x120pxLoxodonta africanaElephantidae Afrikanischer Elefant2009zentriert|160x130px Equus caballusUnpaarhuferHauspferd 2.5 Gb2009MapView EintragHorse Genome Assembled. In: NIH News.C. M. Wade u. a.: Genome Sequence, Comparative Analysis, and Population Genetics of the Domestic Horse. In: Science. Band 326, Nr. 5954, 2009, S. 865–867. doi:10.1126/science.1178158 zentriert|160x120pxBos primigenius taurusPaarhuferHausrind2.7 Gb22 000.National Institutes of Health und das US Department of Agriculture2009 zentriert|160x120pxDanio rerioCypriniformes Zebrafisch,Modellorganismus Tier1.5 Gb26 0002013zentriert|160x110pxXenopus laevisAnuraKrallenfrosch, historischer Modellorganismus für embryonale Entwicklung2.7 Gb44 4562021
Archaeplastida
Plantae - Pflanzen Aufgelistet sind die drei Pflanzen, deren Genome zuerst sequenziert wurden. Organism Typ Relevanz Größe des Genoms Anzahl Chromosomen vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung BildArabidopsis thalianaEcotype:ColumbiaKreuzblütlerartige, Acker-SchmalwandModellorganismus, Unkraut135 Mb525 498,Arabidopsis Genome Initiative2000Acker-Schmalwand|zentriert|160x120pxOryza sativassp indicaSüßgrasartige, ReisFeldfrucht und Modellorganismus420 Mb1232 000–50 000Beijing Genomics Institute, Zhejiang University und Chinese Academy of Sciences2002zentriert|160x120pxWestliche Balsam-PappelMalpighienartige, PappelKohlenstoffsenke, Modellorganismus Baum, Nutz-Holzart und Vergleich mit A. thaliana550 Mb1945 555The International Poplar Genome Consortium2006zentriert|160x120px
Archaeplastida Algen Aufgelistet sind die beiden archaeplastida Algen, deren Genome zuerst sequenziert wurden. OrganismTypRelevanzGröße des GenomsAnzahl Chromosomenvorhergesagte Anzahl von GenenOrganisationJahr der SequenzierungBildCyanidioschyzon merolaeStrain:10DRotalgeeinfacher Eukaryont16.5 Mb205 331University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University und Kumamoto University2004zentriert|160x120pxOstreococcus tauriGrünalgeeinfacher Eukaryont, kleines Genom12.6 Mb207 969 (UniProt)Laboratoire Arago2006zentriert|160x120px
Protisten der SAR, Excavata und Pancryptista Kladden Protisten sind eine historische Kladde hochdiverser eukaryotischer mono- (ein-) oder selten oligo- (wenig-)zellulärer Spezies aus verschiedenen modernen Reichen. Die moderne Taxonomie beruht auf genetischem Konservatismus, welches hauptsächlich durch Genom-Sequenzierung ermöglicht wurde. Mitunter aufgrund der Abstammung des multizellulären Lebens von dieser Kladde ist das Verständnis protistischer Genome notwendig, sowohl zur evolutionsbiologischen Aufklärung als auch zur Feststellung von Konservation spezifischer Nukleotidsequenzen als auch biochemischer Funktionen.
Aufgelistet sind die neun nicht-archaeplastida Protisten, deren Genom zuerst sequenziert wurden. Organismus Typ Relevanz Größe des Genoms vorhergesagte Anzahl von Genen Organisation Jahr der Sequenzierung BildGuillardia thetaCryptomonadModellorganismus551 kbpnucleomorph (nur das Genom)465Canadian Institute of Advanced Research, Philipps-University Marburg und die University of British Columbia2001zentriert|160x110pxPlasmodium falciparumClone:3D7ApicomplexaHumanpathogen (Malaria)22.9 Mb5 268Malaria Genome Project Consortium2002zentriert|160x110pxPlasmodium yoelii yoeliiStrain:17XNLApicomplexaNagetier-Pathogen (Malaria)23.1 Mb5 878TIGR und NMRC2002 zentriert|160x100pxCryptosporidium hominisStrain:TU502ApicomplexaHumanpathogen (Durchfall)10.4 Mb3 994Virginia Commonwealth University2004Cryptosporidium parvumC- or genotype 2 isolateApicomplexaHumanpathogen (Durchfall)16.5 Mb3 807UCSF und University of Minnesota2004 zentriert|160x110pxThalassiosira pseudonanaStrain:CCMP 1335DiatomModellorganismus Kieselalge34.5 Mb11 242Joint Genome Institute und die University of Washington2004 zentriert|160x110pxTrypanosoma cruziStrain:CL-BrenerKinetoplastidHumanpathogen (Chagas)67 Mb22 570The Institute for Genome Research (TIGR), Karolinska Institutet (KI) und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI)2005 zentriert|160x110pxTrypanosoma bruceiClone:TREU 927/4KinetoplastidHumanpathogen (Schlafkrankheit)26 Mb9 068Wellcome Trust Sanger Institute und The Institute for Genome Research (TIGR)2005 zentriert|160x110pxLeishmania majorStrain: FriedlinKinetoplastidHumanpathogen (Orientbeule)32.8 Mb8 272Wellcome Trust Sanger Institute und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI)2005 zentriert|160x100px
Prokaryota - Prokaryoten
Im Folgenden werden wichtige sequenzierte prokaryotische Genome, aufgespalten auf die beiden untergeordneten Domäne aufgelistet.
Bacteria - Bakterien Im Folgenden werden wichtige sequenzierte Bakterien Genome aufgelistet.
+SpeziesStrangFamilieInteresseChromosomengrößePlasmidePlasmidgrößeProtein-SequenzenStandProjektEscherichia coliK-12/MG1655EnterobacteriaceaeModellorganismus gramnegativer Bakterien, Darmflora Mensch (Viele weitere Stränge sequenziert)4.6 Mb0/43002025E. coli Genome Project (GSGSC-UW) PRJNA57779Yersinia pestisKIM10+Yersiniaceae (Ordnung: Enterobacterales)Erreger der Pestilenz, größte pandemische Krankheit der festgehaltenen menschlichen Geschichte4.6 Mb1101.0 kb (pMT-1)42052002GSGSC-UW NIH-Med Salmonella TyphiTy2EnterobacteralesErreger der Abdominaltyphus4.8 Mb0/2003GSGSC-UWShigella flexneri 2a2457TEnterobacteriaceaeErreger der Dysenterie4.6 Mb0/40682003GSGSC-UW