Suolaviridae ist eine vom im März 2022 neu eingerichtete Familie von Archaeenviren innerhalb der Klasse Caudoviricetes. Sie ist innerhalb dieser Klasse bisher ohne nähere Zuordnung (Stand 6. März 2024); mit diesem Stand umfasst die Familie monotypisch nur eine Gattung, Pormufvirus mit einer einzigen Art (Spezies) Pormufvirus salinum (früher Pormufvirus HRTV28, Referenzstamm , kurz: ).
Die Zugehörigkeit zu den Caudoviricetes und ihre halophilen Archaeenwirte klassifizieren die Suolaviridae nicht-taxonomisch einerseits als arTVs (), andererseits als Haloviren.
Beschreibung Morphologie Die durch HRTV-28 repräsentierten Suolaviridae sind vom Morphotyp der Siphoviren.
Wirte Der Wirt von HRTV-28 ist der Stamm der halophilen Archaeen-Gattung Halorubrum (Ordnung Haloferacales, Methanobacteriati) – die Spezies trägt den provisorischen Namen Halorubrum sp. .
Habitat und Fundort HRTV-28 wurde aus im November 2009 entnommenen Wasserproben () von Salinen () an der Küste der Provinz Samut Sakhon in Thailand identifiziert ().
Genom und Proteom Das Genom der Suolaviridae unsegmentiert, es ist ein lineares dsDNA-Molekül mit einer Länge von ca. 35 kbp (Kilobasenpaaren).
Das bereits zuvor beschriebene (HHTV-28) fand sich bei einer 2021 veröffentlichten Clusteranalyse mit 63 vollständigen Genomen von arTVs in einem als F10 bezeichneten Singleton
Die Länge des unsegmentierten dsDNA-Genoms von beträgt 35.270 abp.
Die für die Gattung Pormufvirus als charakteristisch geltenden (und namensgebenden, siehe § Etymologie) Proteine sind das Portalprotein und ein gpF-Protein ähnlich dem von Escherichia-Phage Mu (Spezies Muvirus mu, Morphotyp: Myoviren).
Systematik Die Systematik der Familie Suolaviridae gemäß – (MSL #41v1, 20. März 2026),ICTV: Virus Metadata Resource (VMR). und der Taxonomie des (Stand 25. Mai 2024) ist wie folgt:
Familie Suolaviridae (ursprünglich als „F10-Gruppe“ bezeichnet)
Gattung Pormufvirus Spezies Pormufvirus salinum (früher Pormufvirus HRTV28), mt (, Halorubrum-Virus HRTV-28) – Genomlänge: 35.270 bp
Etymologie Die Bezeichnung der Familie Suolaviridae ist abgeleitet von , was sich auf die Haloarchaeen-Wirt dieser Viren bezieht; die Endung ‚-viridae‘ bezeichnet Virenfamilien.
Der Gattungsname Pormufvirus ist als Kofferwort eine Zusammenziehung von , zwei charakteristische Proteine des diese Gattung repräsentierenden Virus HRTV-28. Das Art-Epitheton HRTV28 verweist auf das typische Virus (HRTV-28).
Einzelnachweise
ICTV: Taxonomy Browser. Mart Krupovic: Family: Suolaviridae (interim Report). April 2023. NCBI Taxonomy Browser: Suolaviridae. NCBI Taxonomy Browser: Halorubrum sp. SS8-7 (species). Nucleotide: KJ917643 Halorubrum sp. SS8-7 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Virus-Host DB: Halorubrum tailed virus 28. ICTV: Species: Muvirus mu. 2022 Release, MSL #38. NCBI Taxonomy Browser: Escherichia phage Mu (no rank). SIB: Muvirus. Auf: ViralZone. Ying Liu, Tatiana A. Demina, Simon Roux, Pakorn Aiewsakun, Darius Kazlauskas, Peter Simmonds, David Prangishvili, Hanna M. Oksanen, Mart Krupovic: Diversity, taxonomy, and evolution of archaeal viruses of the class Caudoviricetes. In: PLoS Biology, Band 19, Nr. 11, 9. November 2021, e3001442; doi:10.1371/journal.pbio.3001442, PMID 34752450, ().
Kategorie:Virusfamilie Kategorie:Bakteriophage