mini|TEM-Aufnahme von Methanoculleus-Virus Blf4 (Spezies Flagovirus limi). Zwei Virionen sind an ein Zellanhängsel (vermutlich ein Flagellum) des Wirts befestigt (Pfeile). Balken: 100 nm.
Pungoviridae ist eine vom im März 2023 neu eingerichtete Familie von Archaeenviren innerhalb der Klasse Caudoviricetes. Sie ist innerhalb dieser Klasse bisher ohne nähere Zuordnung (Stand 28. Februar 2024); mit diesem Stand umfasst die Familie monotypisch nur eine Gattung, Flagovirus mit einer einzigen Art (Spezies) Flagovirus limi (Referenzstamm Methanoculleus-Virus Blf4).
Beschreibung Das Methanoculleus-Virus Blf4 infiziert methanogene Archaeen von Stamm E02.3 der Spezies Methanoculleus bourgensis aus der Ordnung Methanomicrobiales (Methanobacteriota, früher „Euryarchaeota“ genannt). Sowohl das Virus als auch sein Wirt wurden aus dem Schlamm einer kommerziellen Biogasanlage in Deutschland isoliert (Probenentnahme am 13. Juni 2013).
Morphologie Die Virionen (Viruspartikel) zeigen den für die Klasse Caudoviricetes typischen Kopf-Schwanz-Aufbau mit einem ikosaedrischen Kopf von 60 nm Durchmesser und einem langen, nicht kontraktilen Schwanz von 125 nm Länge und 10 nm im Querschnitt (Morphotyp der Siphoviren). Blf4 scheint seinen Wirt durch Bindung an ein Flagellum zu erkennen (siehe Abbildung). Ihr Kopf-Schwanz-Aufbau und Archaeen-Wirt klassifizieren die Pungoviridae nicht-taxonomisch auch als arTVs ().
Genom Das vollständige dsDNA-Genom von Blf4 hat eine Länge von ca. 37 kb (Kilobasenpaaren). Es enthält 63 offene Leserahmen (, ORFs), die alle in der gleichen Transkriptionsrichtung angeordnet sind. Mit Ausnahme der großen Untereinheit der Terminase zeigt Blf4 weder Nukleotid- noch Proteinebene nennenswerte Ähnlichkeit mit anderen zuvor beschriebenen Viren auf.
Systematik Die Systematik der Pungoviridae gemäß – mit Ergänzungen nach der Taxonomie des – ist wie folgt (Stand 24. Mai 2026, MSL #41v1):ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
Familie Pungoviridae
Gattung Flagovirus Spezies Flagovirus limi, mit Methanoculleus-Virus Blf4 syn. Methanoculleus-Siphovirus Blf4 (Genomlänge 37.078 bp)
Etymologie Der Name der Familie Pungoviridae leitet sich ab von , ‚Einstich‘. Dies bezieht sich auf die Fähigkeit des Virus, seinen Wirt (zu infizieren und) zu lysieren. Die Endung ‚-viridae‘ zeigt eine Virusfamilie an.
Der Gattungsname Flagovirus verweist auf das Flagellum, den vermutlichen Adhäsionsrezeptor des Virus hin, an den sich die Viruspartikel bei Kontakt mit der Wirtszelle anheften. Das Art-Epitheton limi ist der Genitiv von lat. , ‚Schlamm‘ und verweist auf den Schlamm der Biogasanlage, aus dem diese Spezies erstmals isoliert wurde.
Einzelnachweise Mart Krupovic, Claire Geslin, Ruth A. Schmitz, Ariane Bize: Create 3 new families for classification of viruses infecting methanogenic archaea (zip:docx). Vorschlag 2022.004A vom Oktober 2021. ICTV: Taxonomy Browser. ICTV: Family: Pungoviridae. 2022 Release, MSL #38. NCBI Taxonomy Browser: Pungoviridae.
Vuong Quoc Hoang Ngo, François Enault, Cédric Midoux, Mahendra Mariadassou, Olivier Chapleur, Laurent Mazéas, Valentin Loux, Théodore Bouchez, Mart Krupovic, Ariane Bize: Diversity of novel archaeal viruses infecting methanogens discovered through coupling of stable isotope probing and metagenomics. In: Applied Microbiology International : Applied Microbiology, Band 24, Nr. 10, Thematic Issue on Pathogen and Antimicrobial Resistance Ecology, Oktober 2022, S. 4853-4868; doi:10.1111/1462-2920.16120, PMID 35848130, , sfam HAL 03727436 (PDF; 6,1 MB), Epub 18. Juli 2022. Katrin Weidenbach, Sandro Wolf, Anne Kupczok, Tobias Kern, Martin A. Fischer, Jochen Reetz, Natalia Urbańska, Sven Künzel, Ruth A. Schmitz, Michael Rother: Characterization of Blf4, an Archaeal Lytic Virus Targeting a Member of the Methanomicrobiales. In: MDPI: Viruses, Band 13, Nr. 10, 26. September 2021, S. 1934; doi:10.3390/v13101934, PMID 34696364, ().
Kategorie:Virusfamilie Kategorie:Bakteriophage