Die Phycisphaeraceae sind eine Familie von Bakterien im Phylum Planctomycetota innerhalb der PVC-Gruppe.
Beschreibung Die Typusart ist Phycisphaera mikurensis mit Referenzstamm FYK2301M01T (alias DSM:103959 oder NBRC:102666). Dieser Stamm, sowie zwei weitere, FYK2301M18 (alias NBRC 102667) und FYK2301M52 (alias NBRC 102668) sind alle gramnegativ, kugelförmig, beweglich und fakultativ anaerob. Sie wurden aus einer Meeresalge (Porphyra sp.) isoliert, die aus Proben von der Insel Mikura, Japan, stammte. Die Kolonien dieser Stämme sind kreisförmig und rosa pigmentiert. Sie wurden kultiviert auf Marine Agar 2216 (Difco) bei 25 °C. Die Zellen der Stämme vermehren sich durch binäre Spaltung (Schizotomie). Der G+C-Gehalt der DNA beträgt 73 mol%. Als wichtigstes Isoprenoidchinon war MK-6. Eine phylogenetische Analyse auf der Grundlage von 16S-rRNA-Gensequenzen ergab, dass die Stämme Mitglieder der provisorisch als WPS-1 bezeichneten Gruppe sind (Nogales et al., 2001) sind, die damals keine gültig beschriebenen Taxa innerhalb des Phylums der Planctomyceten umfasste. Der höchste Ähnlichkeitswert der 16S-rRNA-Gensequenzen der drei Stämme mit denen von etablierten Bakterientaxa lag bei nur 78,7 % zu Planctomyces brasiliensis DSM 5305T. Diese Ergebnisse führten zur Einrichtung einer neuen Klasse Phycisphaerae für die WPS-1-Gruppe mit der die drei Stämme umfassenden Typusart Phycisphaera mikurensis, wobei der M01-Stamm als Referenz gewählt wurde.
mini|Darstellung der Zellteilungsmodi im letzten gemeinsamen Vorfahren der PVC-Gruppe und in einigen heutigen PVC-Vertretern: Äußere Membranen werden durch dicke Linien dargestellt, innere Membranen durch dünne Linien. Die Peptidoglykanschicht ist durch gepunktete Linien dargestellt, und FtsZ-Proteine sind als Ring aus grauen Kreisen dargestellt.
Etymologie Die Bezeichnungen der Klasse Phycisphaerae, Ordnung Phycisphaerales und Familie Phycisphaeraceae sind abgeleitet von der Typusgattung Phycisphaera, versehen mit dem für die jeweilige Rangstufe zugehörigen Suffix. Die Bezeichnung der Typusgattung Phycisphaera setzt sich zusammen aus einem von stammenden Präfix und einem von (Sphäre), bzw. ‚Ball‘ (Kugel) stammenden Suffix: Die Bezeichnung verweist auf ein sphärisches (kugelförmiges) Bakterium, dass von Seetang isoliert wurde.
Systematik Thomas Cavalier-Smith und Chao ordneten 2020 diese Klasse dem Infraphylum „Planctomycetia“ 2020 zu. Die gegenwärtig akzeptierte Taxonomie basiert auf der (LPSN) und dem (NCBI). Ergänzt sind einige Mitglieder mit vorläufigen Bezeichnungen nach der (GTDB), Stand 18. November 2023:
Phylum: Planctomycetota Klasse: Phycisphaerae et al. 2010 (früher WPS-1-Gruppe genannt) Ordnung: Phycisphaerales et al. 2010 Familie: Phycisphaeraceae et al. 2010 Algisphaera et al. 2014 Algisphaera agarilytica et al. 2014 (Typus),<br />mit Referenzstamm 06SJR6-2 alias KCTC:32482, NBRC:109894 oder DSM:103725 Algisphaera sp023300125 (GTDB) syn. Phycisphaera sp. isolate g3_MAG_00007 (NCBI)(verschoben) Mucisphaera et al. 2022 Mucisphaera calidilacus et al. 2022 (Monotyp),<br />mit Referenzstamm Pan265 alias DSM:100697 oder CECT:30425 Phycisphaera et al. 2010 Phycisphaera mikurensis et al. 2010 (Typus),<br />mit Referenzstamm FYK2301M01 alias KCTC:22515, NBRC:102666 oder DSM:103959<br />und den Stämmen FYK2301M18 alias NBRC 102667, sowie FYK2301M52 alias NBRC 102668 Phycisphaera sp. RhM Poriferisphaera et al. 2021 Poriferisphaera corsica et al. 2021 (Typus),<br />mit Referenzstamm KS4 alias DSM:103958 oder BCCM/LMG:29824 „Poriferisphaera hetertotrophicis“ et al. 2023 syn. Poriferisphaera sp016350165 (GTDB) und Planctomycetota bacterium strain ZRK32 (NCBI),<br />mit Referenzstamm ZRK32 Mitglieder der Familie ohne Gattungszuweisung mit vorläufigen Bezeichnungen nach der NCBI-Taxonomie Phycisphaeraceae bacterium AH-315-B13 Phycisphaeraceae bacterium D3-23 Phycisphaeraceae bacterium YUMCWW1 Planctomycete GMD14H07 Familie SM1A02 (GTDB) UBA8653 UBA8653 sp002168105 syn. Phycisphaera sp. TMED24 (ausgegliedert aus der Gattung u. Fam.) UBA8653 sp002862275 syn. Phycisphaera sp. TMED151 (ausgegliedert aus der Gattung u. Fam.) UBA12014 UBA12014 sp002167845syn. Phycisphaera sp. TMED9 (ausgegliedert aus der Gattung u. Fam.) UBA12014 sp002690755 syn. Phycisphaeraceae bacterium TMED231 (ausgegliedert aus der Fam.) Mitglieder der Familie ohne Gattungszuweisung Uncultured Planctomycetales bacterium clone SM1A02 (NCBI) Ordnung: „Sedimentisphaerales“ et al.2018 Ordnung: „Tepidisphaerales“ et al. 2015
Phylogenie Grundlage: 120 Markerproteine auf Basis der GTDB 07-RS207 und dem 16S-RNA-basiertem LTP_01_2022
Einzelnachweise NCBI Taxonomy Browser: Planctomycetes bacterium ZRK32 (species), Nucleotide: Search: strain ZRK32. Zugriffsnr. CP066225 & MW376756. NCBI Nucleotide: Uncultured Planctomycetales bacterium clone SM1A02 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Zugriffsnr. AF445645. NCBI Taxonomy Browser: planctomycete GMD14H07 (species), Nucleotide: Planctomycete GMD14H07 small subunit ribosomal RNA gene, partial sequence, Zugriffsnr. AY162124.
GTDB: Phycisphaerae (class). Dazu:
bac120_r207.sp_labels.tree (Newick-Format, : Newick format). Phylogenetischer Baum in: Genome Taxonomy Database. Abgerufen am 20. Juni 2022.
Das ‚The All-Species Living Tree‘-Projekt ([en]). Dazu: (Newick-Format) Phylogenetischer Baum in: LTP. Abgerufen am 23. Februar 2022.
(englischsprachige Gebrauchsanweisung, 2. Auflage; PDF; 656 kB).
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Kategorie:Bakterien Kategorie:Bacteria