„Candidatus Micrarchaeota“ ist ein 2013 vorgeschlagenes Phylum (Stamm) von Archaeen. Bisher (Stand 2015) war es nicht möglich, Vertreter dieses Phylums zu kultivieren, Metagenomik-Analysen haben jedoch ergeben, dass es Unterschiede zu anderen Archaeen gibt. Die Kandidatengattung Micrarchaeum wurde in sauren Umgebungen von Minenabwässern in den USA identifiziert und wurde ursprünglich als ARMAN-2-Gruppe genannt. Diese Organismen sind sehr klein: ihre Zellen sind nur 400–500 nm groß und auch ihr Genom besteht aus nur etwa 1000 Genen. Sie sind obligate Symbionten der Thermoplasmata, einer anderen Gruppe von Archaeen. Ein ähnlich großes Archaeon, das in denselben sauren Umgebungen gefunden wurde, ist „Ca. Parvarchaeum“ aus der Ordnung Parvarchaeales (ARMAN-4-Gruppe), wie die Micrarchaeota Mitglied des Reichs Nanobdellati (DPANN-Superphylum).
Seitdem gab es eine Reihe weiterer Vorschläge für Micrarchaeota-Mitgliedskandidaten aus der Metagenomik, unter anderem von Olga Golyshina et al. 2017 (Gattung Ca. Mancarchaeum), von Vitaly Kadnikov et al. 2020 (Gattung Ca. Fermentimicrarchaeum) und von Xabier Vázquez-Campos et al. 2021. mini|hochkant=1.3|Genom-Karte von Ca. Mancarchaeum acidiphilum
Systematik Die hier angegebene Systematik folgt (wo nicht anders angegeben) der Genome Taxonomy Database (GTDB),GTDB: p__Micrarchaeota (phylum) der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) dem National Center for Biotechnology Information (NCBI) Taxonomy Browser (Stand 31. März 2022):
Phylum: Candidatus Micrarchaeota 2013 (früher ARMAN-2-Gruppe) Klasse: Candidatus Micrarchaeia et al. 2021 Ordnung: Candidatus Anstonellales et al. 2021 Familie: Candidatus Anstonellaceae et al. 2021 Gattung: Candidatus Anstonella et al. 2021 Spezies: Candidatus Anstonella stagnisolia et al. 2021 Familie Candidatus Bilamarchaeaceae et al. 2021 Gattung Candidatus Bilamarchaeum et al. 2021 Spezies: Candidatus Bilamarchaeum dharawalense et al. 2021 Ordnung: Candidatus Burarchaeales et al. 2021 Familie Candidatus Burarchaeaceae et al. 2021 Gattung Candidatus Burarchaeum Spezies: Candidatus Burarchaeum australiense et al. 2021 Ordnung: Candidatus Gugararchaeales et al. 2021 Familie Candidatus Gugararchaeaceae et al. 2021 Gattung Candidatus Gugararchaeum et al. 2021 Spezies: Candidatus Gugararchaeum adminiculabundum et al. 2021 mini|hochkant=1.2|EM-Aufnahmen von Ca. Scheffleriplasma hospitalis (Wirt) und Ca. Micrarchaeum harzensis (Symbiont) mini|hochkant=1.2|Cryo-ET-Aufnahmen von Ca. S. hospitalis und Ca. M. harzensis Ordnung: Candidatus Micrarchaeales et al. 2021 Familie: Candidatus Micrarchaeaceae et al. 2021 Gattung: Candidatus Mancarchaeum et al. 2017 Spezies: Candidatus Mancarchaeum acidiphilum et al. 2017, inkl. Ca. Micrarchaeota archaeon Mia14− Fundort: Saure Grubenentwässerung, Insel Anglesey, Wales Gattung: Candidatus Micrarchaeum et al. 2010 Spezies: Candidatus Micrarchaeum acidiphilum et al. 2010, mit Isolat ARMAN-2 Spezies: Candidatus Micrarchaeum harzense corrig. et al. 2021 (syn. Candidatus Micrarchaeum harzensis et al. 2021) mit Stamm A_DKE Spezies: Candidatus Micrarchaeum sp. ARMAN-1 Spezies: Candidatus Micrarchaeum sp. AZ1 Ordnung: Candidatus Norongarragalinales et al. 2021 Familie Candidatus Norongarragalinaceae et al. 2021 Gattung Candidatus Norongarragalina et al. 2021 Spezies: Candidatus Norongarragalina meridionalis et al. 2021 Ordnung: Candidatus Fermentimicrarchaeales et al. 2020 [DTNL01 [ord.] in der GTDB] Familie: Candidatus Fermentimicrarchaeaceae et al. 2020 [DTGH01 (in der GTDB)] Gattung: Candidatus Fermentimicrarchaeum et al. 2020 Spezies: Candidatus Fermentimicrarchaeum limneticum et al. 2020
Anmerkungen Die Gattung Mancarchaeum ist in der LPSN der Familie Cuniculiplasmataceae (Thermoplasmatales) zugeordnet mit Referenz auf Golyshina et al (2017). Diese Autoren stellen diese Gattung klar in die Nahe der DPANN-Klade ARMAN-2 und nicht zu den Cuniculiplasmataceae, betonen jedoch den starken horizontalen Gentransfer (HGT) zwischen dem Referenzstamm Mancarchaeum acidiphilum Mia14 und dem assoziierten Cuniculiplasma divulgatum PM4. Die Phylogenie von Mia14 muss daher streng unterschieden werden von der einzelner Gene. Die hier wiedergegebene Systematik folgt daher der Taxonomie der GTDB (vereinbar mit der des NCBI, und nicht der LPSN). Die Klassenzuweisung erfolgt nach der GTDB. Die GTDB stellt den Stamm A_DKE in eine eigene Gattung mit provisorischem Namen Micrarchaeum_A, nennt die Spezies Micrarchaeum_A acidiphilum_A, und ordnet dieser neben dem Referenzstamm A_DKE auch die Stämme ARMAN-1 und AZ1 zu. D. h. ARMAN-1-Gruppe = Micrarchaeum, ARMAN-2-Gruppe = Micrarchaeum_A.
Weblinks OneZoom: Micrarchaeota
Einzelnachweise GTDB: Micrarchaeaceae. Dies schließt die Gattung Mancarchaeum mit ein. GTDB: DTNL01 [order]. GTDB: GCA_001896515.1 Micrarchaeum_A acidiphilum_A (Unfiltered NCBI Taxonomy: Candidatus Micrarchaeum sp. AZ1). LPSN: Phylum "Candidatus Micrarchaeota". LPSN: "Candidatus Mancarchaeum" Golyshina et al. 2017 (genus). Die Gattung Mancarchaeum ist hier der Familie Cuniculiplasmataceae et al. 2016 (Thermoplasmatales) NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Micrarchaeota, Details: Candidatus Micrarchaeota Baker and Dick 2013 (phylum); graphisch: Candidatus Micrarchaeota, Lifemap NCBI Version. NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Mancarchaeum, Details: "Candidatus Mancarchaeum" Golyshina et al. 2017 (genus). Die Gattung Mancarchaeum ist hier incertae sedis innerhalb der DPANN-Gruppe.
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Kategorie:DPANN