Die FCB-Gruppe ( ) ist eine Klade (Verwandtschaftsgruppe; inoffizieller Rang „Superphylum“) im Bakterien-Reich Pseudomonadati. Die Bezeichnung ist ein Akronym, benannt nach den ursprünglichen drei Mitglieds-Phyla Fibrobacteres, Chlorobiota (Chlorobien) und Bacteroidota (Bacteroidetes). Die Mitglieder werden aufgrund einer Reihe von konservierten charakteristischen Indels als Klade betrachtet (in der Rangstufe zwischen einem Phylum und einem Prokaryoten-Reich).
Thomas Cavalier-Smith hatte diese Klade 1987 als ein Phylum (Klasse/Abteilung) mit dem Namen Sphingobacteria und den Mitgliedsklassen Fibrobacteres, Chlorobiota, Bacteroidota und Flavobacteria beschrieben.
Inzwischen werden die ersten drei dieser Gruppen – nebst weiteren hinzugekommenen – selbst als Phyla klassifiziert und die Flavobacteria als Teil der Bacteroidota gesehen (s. u.). Außerdem wurden und werden immer weitere Gruppen (Phyla) als Mitglieder der gemeinsamen Klade identifiziert, wenngleich diese oft nur aus der Metagenomik bekannte Kandidaten sind („mikrobielle dunkle Materie“). Daher wird inzwischen die FCB-Gruppe von vielen Autoren auch mit dem taxonomischen Rang eines Superphylums belegt.
Cavalier-Smith hatte 2002 die Bezeichnung Sphingobacteria unter Beibehaltung des Rangs als Phylum im engeren Sinn als Synonym für Bacteroidota/Bacteroidetes verwendet. Egal, ob mit Sphingobacteria die ganze FCB-Gruppe oder nur dieser Teil zu verstehen ist, sie ist in jedem Fall zu unterscheiden von der Klasse Sphingobacteriia innerhalb der Bacteroidota/Bacteroidetes.
Phylogenie upright=2.5|mini|links|In diesem Stammbaum des Lebens von 2016 auf Basis ribosomaler Proteine sind die Bacteroidetes/Chlorobi-Gruppe mit brauner Farbe gekennzeichnet. Darüber befinden sich die anderen FCB-Mitglieder. Siehe auch Dudek et al. (1017), Fig. 1.
Die folgenden phylogenetische Bäume zeigen die inneren Verwandtschaftsverhältnisse in der FCB-Gruppe: links ein etwas älteres Kladogramm nach Gupta, Eloe-Fadrosh und Kirkegaard (mit Stand 2016), rechts ein etwas neueres mit einigen bis 2019 hinzugekommenen Phyla:
Eine ähnliche Situation ist bei der PVC-Gruppe (alias Planctobakteria) zu beobachten.
Systematik Im Zug der Hochstufung der FCB-Mitglieder von Klassen zu Phyla wurden für diese neue Bezeichnungen vorgeschlagen, die mit der für Bakterienphyla üblichen Endung ‚-ota‘ versehen sind. Die große Anzahl von Synonymien (verschiedene Bezeichnungen für dieselbe Gruppe/Klade) – inklusive vieler Schreibvarianten – zeigt, wie sehr die Taxonomie dieser Supergruppe diskutiert wurde und noch wird. Umgekehrt gibt es mehrere Beispiele, wo sich die Bezeichnungen verschiedener Gruppen nur minimal unterscheiden. Aus diesem Grund wird eine ausführliche Liste von Namensvarianten im Anmerkungsteil §Synonymien zur Verfügung gestellt.
Die hier angegebene Konsensus-Taxonomie der FCB-Gruppe basiert mit Stand 9. März 2022 auf den folgenden Quellen: L – (LPSN), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) N – (NCBI, ) G – (GTDB), University of Queensland (UQ), Australien. – hier nur ersatzweise benutzt bei fehlender Referenz zu LPSN und NCBI (siehe Anmerkung unten). LPSN kennt die Supergruppe FCB selbst nicht, daher sind unten die jeweiligen Mitgliedsphyla einzeln referenziert.
Die GTDB versteht abweichend von der folgenden Systematik das Phylum Bacteroidota im weiteren Sinne, d. h. dem Umfang nach identisch mit der Bacteroidetes–Chlorobi-Gruppe (Bacteroidota–Chlorobiota); die in dieser Klade enthaltenen Phyla haben bis auf Bacteroidetes selbst jeweils nur eine einzige Klasse und sind in der GTDB auf diese Rangstufe herabgestuft.
Üblicherweise sind alle Subtaxa von FCB bis zur Ordnung ausgeführt. Mit Anführungszeichen veröffentlichte Namen sind nicht gültig veröffentlicht; weniger gebräuchliche Synonyme sind als Anmerkungen wiedergegeben:
Klade/Superphylum: FCB-Gruppe, en. (N), alias Sphingobacteria , 1987
Klade: Bacteroidota–Chlorobiota-Gruppe, en. (N) Phylum: Bacteroidota et al. 2021 (L,N), alias Bacteroidetes et al. 2012 (L,N), „Sphingobacteria“ 2002 (L) – siehe Hauptartikel Phylum: Rhodothermaeota et al. 2016 (L) … emend. et al. 2016 (N) Klasse: Rhodothermia et al. 2017 (L,N) Ordnung: Rhodothermales et al. 2017 (L,N) … emend. et al. 2019 (N), mit Familien: Rhodothermaceae, Rubricoccaceae, Salinibacteraceae, Salisaetaceae Phylum: Balneolaeota et al. 2016 (L,N) Klasse: Balneolia et al. 2017 (L,N) … emend. et al. 2016 (N) Ordnung Balneolales et al. 2017 (L,N), zuvor „Balneolales“ et al. 2016 (L), mit Familie Balneolaceae (L,N), Cyclonatronaceae und die Familie Soortiaceae Phylum: Chlorobi et al. 2010 (L,N), Grüne Schwefelbakterien – bei LPSN synonym mit Ignavibacteriae (d. h. ein gemeinsames Phylum) Klasse: Chlorobea 2002 (L,N) alias „Chlorobia“ 2001 (L,N) bzw. et al. 2018 (L) – siehe Hauptartikel Phylum: Ignavibacteriae et al. 2013 (N) bzw. et al. 2012 (N) – bei LPSN Synonym von Chlorobi (d. h. ein gemeinsames Phylum) Klasse: Ignavibacteria et al. 2010 (L) … emend. et al. 2013 (N) Ordnung: Ignavibacteriales et al. 2010 (L) … emend. et al. 2013 (N) Phylum: „Candidatus Kryptonia“ et al. 2016 (L,N,G), mit Gattungen: Chryseopegocella (alias Chrysopegis), Kryptobacter, Kryptonium, Thermokryptus (L,N) Phylum: „Candidatus Kapabacteria“ et al. 2015 (L,N), mit Gattungen: Kapaibacterium (alias Kapabacteria) und Thermonerobacter (N)
Klade: Calditrichaeota-Marinimicrobia (siehe §Phylogenie) Phylum: Candidatus Marinimicrobia et al. 2013 (N), mit Synonym Marinisomatota (G), früher (N), mit Spezies: Neomarinimicrobium atlanticum (N), TCS52 sp001577215 (G) Phylum Calditrichaeota et al. 2017 (N:incertae sedis ), mit Synonym Calditrichota (G) Klasse: „Calditrichae“ et al. 2017 (N), mit Synonym „Calditrichia“ (N) Ordnung: Calditrichales et al. 2020 (N), zuvor „Calditrichales“ et al. 2017 mit Gattung: Calorithrix (L,N)
Klade: Cloacimonetes-Zixibacteria (siehe §Phylogenie) Phylum: „Candidatus Zixibacteria“ et al. 2013 (L) Phylum: Candidatus Cloacimonetes et al. 2013 (L,N), mit Synonym Candidatus Cloacimonadota (N,G), mit Gattungen: Cloacimonas (mit Schreibvariante Cloacamonas) und Syntrophosphaera (L,N)
Phyla ohne Zuordnung zu einer Subklade der FCB-Gruppe: Phylum: Fermentibacterota (G), mit Synonym „Candidatus Fermentibacteria“ [phylum] et al. 2016 (L,N) Klasse: Fermentibacteria [class] (G,N) Ordnung: Fermentibacterales (G; N:incertae sedis ) Phylum Fibrobacteres 2012 (L) … emend. et al. 2016 (N), mit Synonym Fibrobacterota 2021 Klasse: Chitinispirillia et al. 2016 (L,N) Ordnung: Chitinispirillales et al. 2016 (L,N) Klasse: Chitinivibrionia et al. 2014 (L,N) Ordnung: Chitinivibrionales et al. 2014 (L,N) Klasse: Fibrobacteria et al. 2012 (L,N) Ordnung: Fibrobacterales et al. 2012 (L,N) Ordnung: „Fibromonadales“ et al. 2016 (N) Phylum: Gemmatimonadaeota et al. 2015 (N), mit Synonym Gemmatimonadetes [phylum] et al. 2003 (N) – siehe Hauptartikel Phylum: Candidatus Hydrogenedentes et al. 2013 (L,N), mit Synonym Hydrogenedentota (G) mit Gattung: Hydrogenedens (L,N) Phylum Delphibacteria et al. 2017 (N:incertae sedis ), mit Spezies: Bacterium DolZOral124_64_63 und Bacterium DolJOral78_63_78 Phylum Candidatus Latescibacteria et al. 2013 (L,N), früher (N), mit Gattung: Latescibacter (N) Phylum: Candidate division LCP-89 (N), mit Gattung (G) und Spezies: (N) alias sp005223185 (G) Phylum Candidatus Krumholzibacteriota et al. 2019 (G; N:incertae sedis ) Klasse Candidatus Krumholzibacteria et al. 2019 (G,N) Ordnung Candidatus Krumholzibacteriales et al. 2019 (G,N) Phylum Candidatus Delongbacteria et al. 2016 (G; N:incertae sedis ) Phylum Candidatus Edwardsbacteria et al. 2016 (G; N:incertae sedis ) Phylum Candidatus Eisenbacteria et al. 2016 (G; N:incertae sedis ) Phylum Candidatus Firestonebacteria et al. 2016 (G; N:incertae sedis ) Phylum Candidatus Goldbacteria et al. 2017 (G; N:incertae sedis )
Synonymien FCB-Gruppe, en. (N), Synonyme: Fibrobacteres-Chlorobi-Bacteroidetes-Superphylum, en. (N), Sphingobacteria , 1987 (ursprünglich im Rang eines Phylums) Bacteroidota–Chlorobiota-Gruppe alias Bacteroidetes-Chlorobi-Gruppe, en. (N), Synonyme: CFB/Green sulfur bacteria group (N) Cytophagales/Green sulfur bacteria group (N) Bacteroidetes et al. 2012 (L,N), Synonyme: Bacteroidota et al. 2021 (L), Bacteroidota et al. 2018 (L,N) „Bacteroidaeota“ et al. 2015 (L,N) „Sphingobacteria“ 2002 (L) BCF group (N), Bacteroides-Cytophaga-Flexibacter group (N) CFB group (N), Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides phylum (N) Balneolaeota et al. 2016 (L,N), Synonyme: Balneolota et al. 2021 (L), zuvor „Balneolota“ et al. 2019 (L) Bacteroidia "Incertae sedis 69" et al. 2016 (NamesforLife, gemeinsame Familie Balneolaceae) „Candidatus Kapabacteria“ et al. 2015 (L,N), früher: OPB56 group (N) Bacteroidia "Incertae sedis 553" et al. 2015 (NamesforLife) Chlorobi et al. 2010 (L,N), zuvor „Chlorobi“ 2001 (L,N), mit Synonymen: Chlorobaeota et al. 2015 (L,N) Chlorobiota et al. 2021 (L,N), zuvor „Chlorobiota“ et al. 2018 (L) Grüne Schwefelbakterien, en. (N) Chlorobea 2002 (L,N), Synonyme: „Chlorobia“ 2001 (L,N) bzw. et al. 2018 „Chlorobiia“ 2020 (L) Ignavibacteriae et al. 2013 (N) bzw. et al. 2012 (N), mit Synonymen: Ignavibacteria et al. 2011 (N) „Ignavibacteraeota“ et al. 2015 (L,N) Ignavibacteriota et al. 2021 (L,N) bzw. „Ignavibacteriota“ et al. 2018 (L) Ignavibacteria et al. 2010 (L) … emend. et al. 2013 (N), mit Schreibvariante: „Ignavibacteriae“ [class] et al. 2013 (L) Rhodothermaeota et al. 2016 emend. et al. 2016 (N) bzw. „Rhodothermaeota“ et al. 2016 (L), mit Synonym: Rhodothermota et al. 2021 (L), zuvor „Rhodothermota“ et al. 2019 (L) Rhodothermales et al. 2017 (L,N) bzw. et al. 2017 emend. et al. 2019 (N), zuvor „Rhodothermales“ et al. 2016 (L) Gemmatimonadaeota et al. 2015 (N), Synonyme: Gemmatimonadota et al. 2021 (L,N,G), zuvor „Gemmatimonadota“ et al. 2018 (L) Gemmatimonadetes [phylum] et al. 2003 (N) (N) Candidatus Latescibacteria et al. 2013 (L,N), früher: (N), (N) „Candidatus Zixibacteria“ et al. 2013 (L), früher: (N) (N) (N) Candidatus Cloacimonetes et al. 2013 (L,N), Synonyme: Candidatus Cloacimonadota (N,G), früher: (N), (N) „Calditrichae“ et al. 2017 (N), mit Synonym: „Calditrichia“ 2021 bzw. 2020 (N) Fermentibacterota (G), mit Synonym „Candidatus Fermentibacteria“ [phylum] et al. 2016 (L,N), früher (N) Fibrobacteres 2012 emend. et al. 2016 (N) bzw. 2012 (L), mit Synonym: „Fibrobacteraeota“ et al. 2015 (L,N) Fibrobacterota 2021 (L,G), „Fibrobacterota“ et al. 2018 (L) Chitinivibrionia et al. 2014 (L,N), früher: (N), (N) Candidatus Hydrogenedentes et al. 2013 (L,N), mit Synonym: Hydrogenedentota (G), früher (N) Candidate division LCP-89 (N), mit Synonym p__AABM5-125-24 (G)
Literatur Matthew E. Gruwell, Geoffrey E. Morse, Benjamin B. Normark: Phylogenetic congruence of armored scale insects (Hemiptera: Diaspididae) and their primary endosymbionts from the phylum Bacteroidetes. In: Molecular Phylogenetics and Evolution, Band 44, Nr. 1, Juli 2007, S. 267–280; doi:10.1016/j.ympev.2007.01.014, PMID 17400002. Matthias Horn, Marit D. Harzenetter, Tanja Linner, Ernst N. Schmid, Karl-Dieter Müller, Rolf Michel, Michael Wagner: Members of the Cytophaga–Flavobacterium–Bacteroides phylum as intracellular bacteria of acanthamoebae: proposal of ‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’. In: Sfam Environmental Microbiology, Band 3, Nr. 7, 20. Dezember 2001, S. 440–449; doi:10.1046/j.1462-2920.2001.00210.x, PMID 11553234.
Einzelnachweise UQ, Australia. Aegiribacteria, GTDB, Release 06-RS202 (27. April 2021). UQ, Australia. Bacteroidota, GTDB. UQ, Australia. sp005223185, GTDB. UQ, Australia. Fermentibacterota, GTDB. UQ, Australia. Calditrichota, GTDB. UQ, Australia. Marinisomatota, GTDB. UQ, Australia. TCS52 sp001577215, GTDB. UQ, Australia. Zixibacteria, GTDB. UQ, Australia. Cloacimonadota, GTDB. UQ, Australia. Gemmatimonadota, GTDB. UQ, Australia. Fibrobacterota, GTDB. UQ, Australia.