Lilyvirus ist die Bezeichnung für eine Gattung von Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau (Ordnung Caudovirales). Ihre Wirte sind Bakterien der Gattung Paenibacillus (Paenibacillaceae), was sie als Bakteriophagen klassifiziert.Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens; 2018.052B.A.v1.Lilyvirus.zip (docx, xlsx), Vorschlag an das ICTV: To create one (1) new genus, Lilyvirus, containing a single species in the family Siphoviridae, Februar 2018Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens, I. Tolstoy: 2019.054B.zip (docx, xlsx), Vorschlag an das ICTV: Move four genera, rename two species and one genus; and, delete one genus in the order Caudovirales (mit Proposal 2: To transfer the genus Lilyvirus to the order Caudovirales), 2019

Beschreibung und Forschungsgeschichte Der Bakteriophage Lily wurde 2015 aus infizierten Bienenwaben ( ) isoliert, die dem Landwirtschaftsministerium von North Carolina, USA, aus dem ganzen Bundesstaat vorgelegt wurden. Er infiziert Bakterien der Spezies Paenibacillus larvae,Virus-Host DB: Paenibacillus larvae des Erregers der Bienenkrankheit Amerikanische Faulbrut, einer Schwesterspezies von P. polymyxa und P. dendritiformis. Für die Phagenisolierung und -vermehrung wurden die Stämme P. larvae ATCC 9545 und ATCC 25747 als Wirte benutzt.

Das Doppelstrang-DNA-Genom der Phagen hat eine Länge von 44.95 kbp (Kilo-Basenpaaren), sein G+C-Gehalt ist 42,7 %. Susan Carson, Emily Bruff, William DeFoor, Jacob Dums, Adam Groth, Taylor Hatfield, Aruna Iyer, Kalyani Joshi, Sarah McAdams, Devon Miles, Delanie Miller, Abdoullah Oufkir, Brinkley Raynor, Sara Riley, Shelby Roland, Horace Rozier, Sarah Talley, Eric S. Miller: Genome Sequences of Six Paenibacillus larvae Siphoviridae Phages. In: Genome Announcements, Band 3, Nr. 3, Mai-Juni 2015, e00101-15, Epub 18. Juni 2015; doi:10.1128/genomeA.00101-15, , PMID 26089405 ().

Erste Analysen deuteten auf Paenibacillus-Phage LeyraNCBI Taxonomy Browser: Paenibacillus phage Leyra (species) als nächsten Verwandten hin; dies ist ein Bakteriophage aus der Spezies (Spezies Paenibacillus-Virus Leyra (wissenschaftlich Fernvirus leyra),ICTV: Taxonomy history: Fernvirus leyra Gattung Fernvirus (früher Sitaravirus), Morphotyp ebenfalls zu den Siphoviren gehörend).ICTV: Taxonomy history: Fernvirus Die Übereinstimmung war aber nicht groß genug, um beide Phagen derselben Gattung zuzuordnen. Aufgrund dieser Ergebnisse hatte das die neue Gattung Lilyvirus ursprünglich ebenfalls der inzwischen jedoch aufgelösten Familie Siphoviridae zugeordnet.SIB: dsDNA, §Caudovirales: Siphoviridae. Auf: ViralZone.

Diese Zuordnung musste inzwischen aufgrund weiterer, genauerer Analysen revidiert werden. Man suchte nach Homologien einzelner Abschnitte des Lily-Genoms zu bekannten Bakteriophagen mit Kopf-Schwanz-Aufbau (Caudovirales). Interessanterweise deuten die Ergebnisse darauf hin, dass der Ursprung des linken Endes von Lily ein anderer ist als der des rechten Endes. Das Protein AJK27737.1 (im Genom LILY_13) wurde als Protein der Schwanzscheide (en. – durch sie injiziert der Phage seine DNA in die Wirtszelle) identifiziert. Das Protein AJK27747.1 (im Genom LILY_23), bei dem es sich um Protein für einen Sektor („Keil“) der Grundplatte der Schwanzstruktur (en. ) handelt. Es scheint also, dass das linke Ende des Lily-Genoms bestimmten Myoviren ähnlich ist, während das rechte Ende enger mit den bereits zuvor ausgemachten Siphoviren der Gattung Fernvirus verwandt ist. Das ICTV ist daher einem Vorschlag von 2019 gefolgt und hat die Familienzuordnung der Gattung Lilyvirus aufgehoben.

Systematik Die Gattung Lilyvirus setzt sich gemäß mit Stand Mai/Juni 2024 wie folgt zusammen:ICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).

Klasse: Caudoviricetes – Morphotyp: Siphoviren Gattung: Lilyvirus (ohne Ordnungs- oder Familienzuweisung) Spezies Lilyvirus lily (Paenibacillus-Virus Lily)ICTV: Taxonomy history: Paenibacillus virus Lily, EC 51, Berlin, Germany, Jul​y 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35) – ehemals vorgeschlagen für Gattung Sitaravirus (inzwischen umbenannt in Fernvirus, vom Morphotyp auch zu den Siphoviren) Bacteriophage LilyNCBI Taxonomy Browser: Bacteriophage Lily (no rank) Dieser Paenibacillus-Phage Lily ist zu unterscheiden von dem ICTV-unbestätigten „Mycobacterium-Phagen Lily“ (en. „“), dessen Wirt der Stamm Mycobacterium smegmatis mc²155 ist.PhagesDB: Mycobacterium phage Lily Wegen der Wirtsspezifität der Bakteriophagen mit Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes bzw. Ordnung Caudovirales) muss es sich um verschiedene Viren handeln, auch wenn der „Mycobacterium-Phage Lily“ wie alle bisher gefundenen Mykobakteriophagen sipho- oder myovirale-Morphologie haben und daher ebenfalls der Klasse Caudoviricetes angehören sollte.

Weblinks Casey Stamereilers, Lucy LeBlanc, Diane Yost, Penny S. Amy, Philippos K. Tsourkas: Comparative genomics of 9 novel Paenibacillus larvae bacteriophages, in: Bacteriophage, Band 6, Nr. 3, e1220349, Epub 5. August 2016, doi:10.1080/21597081.2016.1220349 Casey Stamereilers, Christopher P. Fajardo, Jamison K. Walker, Katterinne N. Mendez, Eduardo Castro-Nallar, Julianne H. Grose, Sandra Hope, Philippos K. Tsourkas: Genomic Analysis of 48 Paenibacillus larvae Bacteriophages, in: MDPI Viruses, Band 10, Nr. 7, Special Issue Bacteriophage Genomes and Genomics: News from the Wild, 377, doi:10.3390/v10070377

Einzelnachweise

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