mini|EM-Auzfnahme zweir Virionen von Staphylococcus-Phage CSA13,Gattung Rosenblumvirus
Rountreeviridae ist die Bezeichnung für eine 2021 vom neu eingerichtete Familie von Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes).E. N. Adriaenssens, I. Tolstoy, C. Moraru, J. Barylski, Y. Tong, Andrew M. Kropinski, M. Łobocka: 2020.140B.R.Rountreeviridae.zip (docx, xlsx), Vorschlag an das ICTV 2020.140B.R.Rountreeviridae: Create one new family (Rountreeviridae) including two subfamilies and six genera of predominantly Staphylococcus and Enterococcus phages (Caudovirales), Juli 2020ICTV: ICTV: (zip): 2020.146B.R.Schitoviridae.xlsx Die Mitglieder der Familie Rountreeviridae sind Bakterienviren (Bakteriophagen) mit Podoviren-Morphologie (Kopf-Schwanz-Aufbau mit kurzer Schwanzstruktur). Die Familie wurde 2021 eingerichtet, um die phylogenetische (genomische wie proteomische) Verwandtschaft der neu eingerichteten Unterfamilie Sarlesvirinae mit der (zu der inzwischen aufgelösten Familie Podoviridae der Podoviren gehörenden) Unterfamilie Rakietenvirinae taxonomisch abzubilden. Auch die beiden bereits bestehenden Gattungen Fischettivirus und Negarvirus erwiesen sich als ähnlich verwandt, ohne einer dieser beiden Unterfamilien zugeordnet werden zu können.
Beschreibung Die Familie Rountreeviridae wurde 2021 vom ICTV nach einem Vorschlag von 2020 offiziell bestätigt. Sie wurde zusammen mit der Familie Salasmaviridae eingerichtet, um Phi29-ähnliche Phagen, die vorwiegend Staphylococcus- und Enterococcus-Stämme infizieren, taxonomisch korrekt zu erfassen. Sie enthält die früher aufgrund ihrer Morphologie zu den Podoviren gestellte Unterfamilie Rakietenvirinae Während Bacillus-Virus phi29 Mitglied jener Salasmaviridae ist, haben die Rountreeviridae mit dieser Unterfamilie die Vertreter Staphylococcus-Phage 44AHJD, Staphylococcus-Phage 66, Staphylococcus-Phage CSA13 und das mutmaßliche Mitglied „Staphylococcus-Phage P68“ geerbt.
Unterfamilie Sarlesvirinae Diese neue Unterfamilie besteht aus den beiden mit ihr ebenfalls neu eingerichteten Gattungen Copernicusvirus und Minhovirus.
Der Enterococcus-Phage vB_Efae230P-4 (Gattung Copernicusvirus) wurde erstmals 2014 an der Nikolaus-Kopernikus-Universität in Toruń, Polen isoliert wurde.
Der Enterococcus-Phage vB_EfaP_Zip (Gattung Minhovirus) wurde aus Rohabwasser einer Kläranlage unter Verwendung des Stammes Enterococcus faecium C410 als Wirtsbakterium isoliert. Der Enterococcus-Phage vB_EfaP_IME199 (aus derselben Gattung) wurde aus Krankenhausabwasser isoliert, wobei ebenfalls ein Stamm von Enterococcus faecium als Wirtsbakterium diente. Die Transmissionselektronenmikroskopie zeigte, dass dieser Phage ein ikosaedrisches Kapsid von ca. 54 nm Durchmesser und einen kurzen, nicht kontraktilen Schwanz hat. Er besitzt (wie alle offiziell bestätigten Mitglieder der Ordnung Caudovirales) ein lineares, doppelsträngiges DNA-Genom. Es hat an jedem Ende von ca. 65 bp (Basenpaaren), die denen anderer Phi29-ähnlicher Viren ähnlich sind.
Morphologie Die Virionen (Viruspartikel) der Rountreeviridae sind vom Morphotyp der Podoviren: Kopf-Schwanz-Aufbau mit kurzer Schwanzstruktur und einen ikosaedrischen Kopf.
Wirte Die natürlichen Wirte der Rountreeviridae sind Bakterien, soweit bekannt aus den Gattungen Staphylococcus, Enterococcus, Streptococcus und Lactococcus. Diese gehören den Ordnungen Lactobacillales (Milchsäurebakterien) und Bacillales an; beides sind Ordnungen in der Klasse Bacilli des Phylums Firmicutes.
Etymologie Die Namensherkunft der neuen Taxa ist gemäß Vorschlag von 2020 wie folgt: Rountreeviridae: Benannt zu Ehren von Phyllis Margaret Rountree (1911–1994), einer australischen Bakteriologin und Expertin für Staphylokokken. Sie war Gründungsmitglied des (gegründet 1953) und hatte von 1966 bis 1982 den Vorsitz inne. Ehrendoktor der Universität von Sydney (1987). Sarlesvirinae: Benannt nach William Bowen Sarles (1906–1987), einem amerikanischen Bakteriologen, ausgezeichnet mit der der Vereinigten Staaten, Herausgeber des Journal of Bacteriology, Präsident der und ehemaliger Vorsitzender der bakteriologischen Abteilung der (1954–1968). Er war einer der ersten Wissenschaftler, der Enterococcus-Phagen isolierte. Gattung Copernicusvirus: Benannt nach der Nikolaus-Kopernikus-Universität in Toruń, Polen, wo 2014 das erste Virus dieses Typs, der Enterococcus-Phage vB_Efae230P-4, isoliert wurde. Gattung Minhovirus: Benannt nach der Universität Minho in Portugal, an der der Phage Zip isoliert wurde.
Systematik Innere Systematik Die Familie Rountreeviridae setzt sich nach ICTV mit Stand 24. Mai 2026 wie folgt zusammen (einige Vorschläge sind hinzugefügt, wo nicht anders angegeben gemäß der NCBI-Taxonomie):ICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
Familie Rountreeviridae (veraltet: P68-ähnliche Phagen, P68-ähnliche Viren, en. ),Yoyeon Cha, Jihwan Chun, Bokyung Son, Sangryeol Ryu: Characterization and Genome Analysis of Staphylococcus aureus Podovirus CSA13 and Its Anti-Biofilm Capacity. In: MDPI: Viruses, Band 11, Nr. 1, Section Bacterial Viruses, 12. Januar 2019, S. 54; doi:10.3390/v11010054 (). Morphotyp: Podoviren Unterfamilie Rakietenvirinae (früher zur ehemaligen Familie Podoviridae) Gattung Andhravirus – Wirte: Staphylococcus epidermis-Stämme (nach NCBI Nucleotide) Spezies Andhravirus andhra (Staphylococcus-Virus Andhra, ehem. Typus) mit (Staphylococcus-Phage Andhra) – Wirt: Staphylococcus epidermidis RP62A Staphylococcus-Phage JBug18 – Wirt: Staphylococcus epidermidis LM1680 Staphylococcus-Phage Pike – Wirt: Staphylococcus epidermidis LM1680 Staphylococcus-Phage Pontiff – Wirt: Staphylococcus epidermidis RP62A Spezies Andhravirus besep3 mit Staphylococcus-Phage BESEP3 alias Staphylococcus-Phage vB_SepP_BE03 – Wirt: Staphylococcus epidermidis F12 Spezies Andhravirus sealphi mit Staphylococcus-Phage SeAlphi – Wirt: Staphylococcus epidermidis Spezies Andhravirus St134 (Staphylococcus-Virus St13) mit (Staphylococcus-Phage St 134) – Wirt: Staphylococcus epidermidis CEMTC 2044 Gattung Rosenblumvirus (veraltet P68virus, Ahjdlikevirus, AHJD-like viruses, AHJD-ähnliche Viren; 18 ICTV-bestäigte Spezies)SIB: Rosenblumvirus. Auf: ViralZone. Spezies Rosenblumvirus AGO13 (Staphylococcus-Virus phiAGO13) mit und Spezies Rosenblumvirus BP39 (Staphylococcus-Virus BP39) mit (Staphylococcus-Phage BP39) Spezies Rosenblumvirus cap046, mit Staphylococcus-Phage CapO46 Spezies Rosenblumvirus CSA13 (Staphylococcus-Virus CSA13, veraltet Staphylococcus aureus Podovirus CSA13) mit Spezies Rosenblumvirus EBHT mit Staphylococcus-Phage Portland Spezies Rosenblumvirus GRCS (Staphylococcus-Virus GRCS) mit Spezies Rosenblumvirus jpl50 mit Staphylococcus-Phage JPL-50 Spezies Rosenblumvirus LSA2366 mit Spezies Rosenblumvirus pabna (Staphylococcus-Virus Pabna) mit Spezies Rosenblumvirus portland mit Spezies Rosenblumvirus PSa3 (Staphylococcus-Virus PSa3) mit alias Spezies Rosenblumvirus rv44AHJD (Staphylococcus-Virus 44AHJD, ehem. Typus) mit (Staphylococcus-Phage phi44AHJD) Spezies Rosenblumvirus rv66 (Staphylococcus-Virus 66) mit Bacteriophage 66 alias oder (Φ66)NCBI: Rosenblumvirus rv66, equivalent: Staphylococcus virus 66. Spezies Rosenblumvirus S241 (Staphylococcus-Virus S24-1) mit und (sic!) Spezies Rosenblumvirus SA46CL1 mit Staphylococcus-Phage SA46-CL1 Spezies Rosenblumvirus SAP2 (Staphylococcus-Virus SAP2) mit Spezies Rosenblumvirus SCH1 (Staphylococcus-Virus SCH1) mit alias und Spezies Rosenblumvirus SLPW (Staphylococcus-Virus SLPW) mit Spezies „“ („Staphylococcus-Phage P68“, alias „“)NCBI: Staphylococcus phage P68 (species) – detaillierter Aufbau der Virionen bei Hrebík et al. (2019)Dominik Hrebík, Dana Štveráková, Karel ŠkubníkTibor FüzikRoman PantůčekPavel Plevka et al.: Structure and genome ejection mechanism of Staphylococcus aureus phage P68. In: Science Advances, Band 5, Nr. 10, 16. Oktober 2019, eaaw7414; doi:10.1126/sciadv.aaw7414 () Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA03-CTH2“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA1-CTA1“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA30-CTH2“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA44-CTH7“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA46-CL1“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA46-CTH2“) Spezies „“ („Staphylococcus-Phage SA46-CTH4“)
Unterfamilie Sarlesvirinae Gattung Copernicusvirus (13 Spezies) Spezies Copernicusvirus AE417 mit Enterococcus-Phage AE4_17 Spezies Copernicusvirus Ef62 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Ef6.2 Spezies Copernicusvirus Ef63 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Ef6.3 Spezies Copernicusvirus Ef72 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Ef7.2 Spezies Copernicusvirus Ef73 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Ef7.3 Spezies Copernicusvirus Ef74 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Ef7.4 Spezies Copernicusvirus Efae230P4 (Enterococcus-Virus Efae230P4) mit Spezies Copernicusvirus Efmus1 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Efmus1 Spezies Copernicusvirus Efmus3 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Efmus3 Spezies Copernicusvirus Efmus4 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_Efmus4 Spezies Copernicusvirus Idefix (Enterococcus-Virus Idefix) mit (nicht zu verwechseln mit dem Drosophila melanogaster Idefix virus, Spezies Errantivirus idefixi, Ordnung Ortervirales) Spezies Copernicusvirus IME195 mit Enterococcus-Phage vB_EfaP_IME195 Spezies Copernicusvirus mda1 mit Enterococcus-Phage MDA1 Gattung Minhovirus Spezies Minhovirus IME199 (Enterococcus-Virus IME199) mit Spezies Minhovirus zip (Enterococcus-Virus Zip) mit
Unterfamilie nicht zugewiesen Gattung Fischettivirus Spezies Fischettivirus C1 (Streptococcus-Virus C1) mit Gattung Negarvirus Spezies Negarvirus WP2 (Lactococcus-Virus WP2) mit
Äußere Systematik Als im weiteren Sinn Phi29-ähnliche Viren stehen die Rountreeviridae vermutlich den Salasmaviridae (mit der früher als Phi29-like viruses bezeichneten Gattung Salasvirus) innerhalb der gemeinsamen Ordnung Caudovirales nahe.
Einzelnachweise Matthew Dunne, Mario Hupfeld, Jochen Klumpp, Martin J. Loessner: Molecular Basis of Bacterial Host Interactions by Gram-Positive Targeting Bacteriophages. In: MDPI: Viruses, Band 10, Nr. 8, Special Issue Phage-Host Interactions, , 28. Juli 2018, S. 397; doi:10.3390/v10080397 ().
Kategorie:Virusfamilie Kategorie:Bakteriophage