mini|Blatt der Tabakpflanze Nicotiana debneyi. Links gesund, rechts infiziert mit Kartoffelvirus S (PVS). Carlavirus, früher bekannt als und , ist eine Gattung von Viren in der Ordnung Tymovirales, Familie Betaflexiviridae, Unterfamilie Quinvirinae. Das Genom ist eine Einzelstrang-RNA mit positiver Polarität, (+)ssRNA (Gruppe IV der Baltimore-Klassifikation). Die Virionen (Viruspartikel) sind gerade oder leicht gewundene Filamente. Als natürliche Wirte dienen Pflanzen (Pflanzen- oder Phytoviren). Derzeit (Stand März 2021) gibt in dieser Gattung es vom bestätigt 53 Spezies (Arten), einschließlich der Typusart . Zu den mit dieser Gattung assoziierten Krankheiten gehören: Mosaik- und Ringspot-Symptome.
Etymologie Der Gattungsname Carlavirus ist eine Kombination aus der ersten Silbe der ersten beiden Wortteile im Namen der Typusart Carnation latent virus.
Beschreibung Die Gattung Carlavirus wird im 9. Bericht des ICTV (2009) beschrieben. Morphologie Die Virionen (Virusteilchen) der Gattung sind nicht umhüllt, fadenförmig (filamentös) gerade oder leicht gebogen mit Helixsymmetrie. Ihre Länge beträgt grob 470–700 nm (im Extremfall 310–1000 nm, die Angaben schwanken je nach Autor) und 12–15 nm im Durchmesser bei einer Ganghöhe von etwa 3,4 nm.
Genom mini|links|hochkant=1.2|Genomkarte der Gattung Carlavirus Das Genom besteht aus einem einzelsträngigen RNA-Molekül positiver Polarität von üblicherweise 7,4–7,7 kb (Kilobasen), ggf. auch (je nach Autor) 5,8–9,0 kb.
Die Gattung zeichnet sich dadurch aus, dass sie sechs Offenen Leserahmen (, ORFs) mit kurzen untranslatierten Regionen (UTRs) an den Enden: Der 3'-Terminus ist polyadenyliert, bei einigen Arten ist das 5'-Ende mit einer Cap-Struktur versehen.
Das Genom kodiert für 3 bis 6 Proteine, darunter ein Kapsidprotein, das sich am 3'-Ende befindet, und eine RNA-abhängige RNA-Polymerase, die sich am 5'-Ende des Genoms befindet. Beim Kartoffel-M-Virus kodiert ORF1 für ein Polypeptid mit 223 kDa (Kilodalton), das die Replikase des Virus darstellt.
Die sich überlappenden Gene/ORFs 2, 3 und 4 bilden einen Block (, TGB) und kodieren für Polypeptide von 25, 12 und 7 kDa. Diese Triple-Gen-Block-Proteine (, TGBp: TGBp1, TGBp2 und TGBp3) ermöglichen oder erleichtern als Movement-Proteine die Bewegung der Virionen von Zelle zu Zelle und über große Distanzen. Einen solchen TGB findet man bei allen Betaflexiviridae mit Ausnahme der Gattungen Capillovirus, Citrivirus, Trichovirus, und Vitivirus, die ein einfaches Movement-Protein (MP) haben.
ORF5 kodiert für ein Kapsidprotein (CP) mit 34 kDa und überlappt mit ORF6, der für ein Cystein-reichen Protein mit 11–16 kDa kodiert.
RBP ist ein RNA-bindendes Protein: ORF 5 überlappt mit ORF 6, der für ein Cystein-reichen Polypeptids mit 11–16 kDa kodiert, dessen Funktion noch nicht ganz geklärt ist. Seine Fähigkeit, Nukleinsäure zu binden, lässt vermuten, dass es die Übertragung durch Blattläuse erleichtern, oder am Gen-Silencing des Wirts oder der viralen RNA-Replikation beteiligt sein könnte.
Replikationszyklus Die virale Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszelle und ist lysogen. Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt durch Eindringen in diese. Die Replikation folgt dem Modell der Replikation von Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität. Die Transkription erfolgt nach dem Modell von Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität.
Übertragung Die Viren werden durch Insekten (Blattläuse) als Vektoren übertragen.ICTV: ICTV 9th Report (2011) – Betaflexiviridae Die Infektion wird manchmal durch Blattläuse in einem semi-persistenten Modus verbreitet, d. h. der Vektor ist für einige Stunden infektiös. Einige Arten werden durch die Tabakmottenschildlaus (Bemisia tabaci) in einem semi-persistenten Modus oder durch das Saatgut übertragen. Die meisten Arten infizieren nur einige wenige Wirte und verursachen Infektionen mit wenigen oder keinen Symptomen, z. B. (AHLV) und (LSV). Andere, wie das (BlSV) und das (PMV, Pappel-Mosaik-Virus), verursachen aber schwere Krankheiten.
Systematik Die Gattung wurde erstmals im ersten Bericht der ICTV 1971 als vorgeschlagen, wurde aber 1975 in und 1995 (6. Bericht) in die Gattung Carlavirus umbenannt. Im Jahr 2005 (8. Bericht) wurde es in die Familie der Flexiviridae gestellt, nachdem es zuvor nicht zugeordnet war. Die aktuelle Position im 9. Bericht (2009) als Gattung der Familie Betaflexiviridae ergibt sich aus der späteren Unterteilung der Flexiviridae.
Mit Stand Mai/Juni 2024 ist die Systematik der Gattung wie folgt:ICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
Ordnung Tymovirales Familie Betaflexiviridae ● Unterfamilie Quinvirinae Gattung Carlavirus Spezies Carlavirus alphacapsici mit (PepVA) Spezies Carlavirus alphacliviae mit (ClCVA) Spezies Carlavirus alphaconiti mit (AcVA) Spezies Carlavirus alphaligustri mit (LiVA, Ligustervirus A) Spezies Carlavirus alpharosae mit (RoVA) Spezies Carlavirus americanense mit (AHLV) Spezies Carlavirus atractylodis mit (AtrMV) Spezies Carlavirus betachrysanthemi mit (CVB) Spezies Carlavirus betagapanthi mit (AgCVB) Spezies Carlavirus betaphlocis mit (PhVB, Phloxvirus B) Spezies Carlavirus betarosae mit (RVB) Spezies Carlavirus betulae mit (BiCV) Spezies Carlavirus cacti mit (CV2) mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von Virionen des Kartoffelvirus H (PVH)mini|hochkant=0.8|Genomkarte von Kartoffelvirus H (PVH) Spezies Carlavirus chisolani mit (PotVH, PVH, Kartoffelvirus H) Spezies Carlavirus chloroipomoeae mit (SPCFV) Spezies Carlavirus colei mit (CVNV) Spezies Carlavirus cornutum mit alias (SJOLV, SjoLV, SJOLV0) Spezies Carlavirus cucumis mit (CvCV) Spezies Carlavirus deltasambuci mit alias (SVD, Holundervirus D) Spezies Carlavirus duocacti mit (CCV-2) Spezies Carlavirus duopseudostellariae mit (PhCV2) Spezies Carlavirus epsilonsambuci mit alias (SVE, Holundervirus E) Spezies Carlavirus fragariae mit (SPMYEV) Spezies Carlavirus gammasambuci mit alias (SVC, Holundervirus C) Spezies Carlavirus hellebori mit (HMV, Nieswurz-Mosaikvirus) Spezies Carlavirus humuli mit (HpMV, Hopfen-Mosaikvirus) Spezies Carlavirus hydrangeae mit (HCMV) Spezies Carlavirus ipomoeae mit (SPC6V, SPC6V0, Süßkartoffelvirus C6) Spezies Carlavirus jasmini mit (JVC) Spezies Carlavirus latensaconiti mit (AcLV) Spezies Carlavirus latensallii mit (GarCLV) Spezies Carlavirus latensascalonici mit (SLV, SLV000) Spezies Carlavirus latensbrassicae mit (CoLV) Spezies Carlavirus latenscapparis mit (CapLV)
Spezies Carlavirus latensdianthi mit (CLV)ICTVdB: Carnation latent virus (via WebArchiv vom 11. September 2006) Spezies Carlavirus latensdioscoreae mit (YLV) Spezies Carlavirus latensgaillardiae mit (GLV) Spezies Carlavirus latenshippeastri mit (HLV) Spezies Carlavirus latenshumuli mit (HpLV, unterscheide: , HpLVd, Gattung Cocadviroid) Spezies Carlavirus latenskalanchoe mit (KLV) Spezies Carlavirus latensnarcissi mit (NCLV) Spezies Carlavirus latensnerinis mit (NeLV) Spezies Carlavirus latensolani mit (PotLV) Spezies Carlavirus latenspassiflorae mit (PLV) Spezies Carlavirus latensverbenae mit (VeLV) Spezies Carlavirus lilii mit (LSLV, LSV, Lily-symptomless-Virus, Symptomloses Lilienvirus) Spezies Carlavirus maculapapayae mit (PapMaV) Spezies Carlavirus melonis mit (MYaV) Spezies Carlavirus miphlocis mit (PhVM, Phloxvirus M) Spezies Carlavirus mirabilis mit (MjMV) mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von Virionen des Kartoffelvirus M (PVM)mini|hochkant=0.8|Genomkarte von Kartoffelvirus M (PVM) Spezies Carlavirus misolani mit (PotVM, PVM, Kartoffelvirus M) Spezies Carlavirus mitipapayae mit (PaMMaV) Spezies Carlavirus necroligustri mit (LNRSV) Spezies Carlavirus necroretis mit (HNNV) Spezies Carlavirus oleraceae mit (CoMMV) Spezies Carlavirus petasitis mit (BuMV, Pestwurz-Mosaikvirus) Spezies Carlavirus pisi mit (PeSV) Spezies Carlavirus pisolani mit (PotVP, PVP, Kartoffelvirus P) Spezies Carlavirus populi mit (PopMV, Pappel-Mosaikvirus) Spezies Carlavirus rhochrysanthemi mit (CVR) Spezies Carlavirus sigmadaphnis mit (DVS, Seidelbastvirus S) Spezies Carlavirus sigmahelenii mit (HVS, Sonnenbrautvirus S) Spezies Carlavirus sigmaphlocis mit (PhVS, Phloxvirus S) Spezies Carlavirus sigmascalonici mit Shallot virus S ShVS Spezies Carlavirus sigmasolani mit (PotVS, PVS, Kartoffelvirus S) Spezies Carlavirus sigmavaccinii mit (BVS) Spezies Carlavirus trifolii mit (RCVMV, Rotklee-Adernmosaikvirus) Spezies Carlavirus tripseudostellariae mit (PhCV3) Spezies Carlavirus unicacti mit (CCV-1) Spezies Carlavirus uniglycinis mit (SCV1) Spezies Carlavirus unipseudostellariae mit (PhCV1) Spezies Carlavirus unisteviae mit (StCV1) Spezies Carlavirus vaccinii mit (BlScV, BlSV) mini|EM-Aufnahme von Virionen des (CPMMV) Spezies Carlavirus vignae mit (CPMMV)
Literatur
Weblinks
Taxon: Genus Carlavirus (virus) The Taxonomicon Viralzone: Carlavirus
Einzelnachweise
Kategorie:Virusgattung Kategorie:Pflanzenvirus