Betacoronavirus pandemicum (früher Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus) bezeichnet die bisher einzige vom offiziell bestätigte Spezies (Art) der Untergattung Sarbecovirus der Gattung Betacoronavirus in der Familie der Coronaviridae (Stand 7. Mai 2024). Geläufige Abkürzungen wie SARSr-CoV, oder deutsch „SARS-assoziierte(s) Coronavirus/-viren“ sind vom Speziesnamen abgeleitete sogenannte „Sammelbezeichnungen“ ().

Die Spezies wurde vom ICTV 2009 ratifiziert aus der Vereinigung den vorherigen Spezies Severe acute respiratory syndrome coronavirus und Severe acute respiratory syndrome-related bat coronavirus (einer Gruppe nahe verwandter Viren). zentriert|mini|hochkant=1.1|Unterschiede von SARS-CoV(-1) und 2 Die bekanntesten Vertreter dieser Spezies sind SARS-CoV(-1) und SARS-CoV-2, die die Erkrankungen SARS bzw. COVID-19 auslösen.

Name Bis 2009 existierte die Spezies als Severe acute respiratory syndrome coronavirus, welche nur Viren enthielt, die mit dem SARS-Ausbruch 2003 in Verbindung standen, nebst einer Reihe praktisch identischer Virus-Isolate von Tieren. 2008 wurde vorgeschlagen, weitere weiter entfernt verwandte, neu entdeckte Fledermausviren (29 an der Zahl) zur Spezies hinzuzunehmen, die große genetische Übereinstimmungen (bis zu 97 % in Schlüsselbereichen) mit den Viren der bisherigen Spezies hatten. Darunter befanden sich z. B. SARS-Rh-BatCoV HKU3, SARSr-Rh-BatCoV und SARSr-Rh-BatCoV 273.

Daraufhin wurde die Spezies mit der Gruppe von neuen, sehr ähnlichen Fledermausviren, genannt oder „“, zur neuen Spezies vereint. Im Rahmen dessen wurde auch die neue Unterfamilie Coronavirinae in der Familie Coronaviridae gebildet, und aus der vorherigen Gattung Coronavirus die neuen Gattungen Alpha-, Beta- und Gammacoronavirus (aus den vorherigen Phylogruppen 1, 2 respektive 3 der vorherigen Gattung).

Die Regeln des (ICTV) zur Virustaxonomie geben vor, dass Spezies-Namen weder abgekürzt noch in andere Sprachen übersetzt werden sollen. Daher sind die geläufigen Abkürzungen wie „SARSr-CoV(s)“ und „SARS-related coronavirus(es)“ keine (international offiziellen) Alternativ-Bezeichnungen der Spezies, sondern zulässige, gebräuchliche Sammelbezeichnungen für einzelne oder alle Viren in dieser Spezies.

Mit schrittweisen der Einführung binärer Namen für Virus-Spezies durch das ICTV bekam die Art im April 2024 schließlich die neue binäre Bezeichnung Betacoronavirus pandemicum.

Systematik Zwar ist Betacoronavirus pandemicum (mit SARS-CoV und SARS-CoV-2) die derzeit (Stand 3. Juni 2024) einzige offiziell vom (ICTV) bestätigte Spezies in der Untergattung Sarbecovirus, in der Taxonomie das (NCBI) finden sich aber innerhalb dieser Untergattung eine Reihe vorgeschlagene Kandidaten, die dieser Spezies nicht zugeordnet sind. Die Systematik der Untergattung Sarbecovirus ist nach ICTV (Stand 7. Mai 2024), ergänzt um einige Vorschläge ach der NCBI-Taxonomie (Stand 3. Juni 2024) wie folgt:

mini|TEM-Aufnahme von Virionen des SARS-CoV-2 Unterfamilie Orthocoronavirinae: Gattung Betacoronavirus … Untergattung Sarbecovirus

Spezies Betacoronavirus pandemicum [SARS-assoziierte Coronaviren, , SARSr-CoV, „Kenya bat coronavirus BtKY72“]

Severe acute respiratory syndrome coronavirus [SARS coronavirus] (SARS-CoV, SARS-CoV-1) – Erreger von SARS Subtyp Tor2 – Referenz ( ) Subtyp PC4-227 Subtyp SARS-CoV/SARS-CoV-2 RdRp – künstliche Mutante: ursprüngliches SARS-Virus SARS-CoV-1 mit ausgetauschtem RdRp-Gen von SARS-CoV-2)

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 [SARS coronavirus 2, , ] (SARS-CoV-2, 2019-nCoV) – Erreger von COVID-19 Subtyp Wuhan-Hu-1NCBI Nucleotide: txid2697049[Organism:noexp] AND Wuhan-HU-1. Subtyp Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/ZAF/NHLS-UCT-LA-ZC45/2023 (Bat_SL-CoV_ZC45, bat-SL-CoVZC45),NCBI: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/ZAF/NHLS-UCT-LA-ZC45/2023, … (Genbank: OQ826158.1).

Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus BtKY72 [Kenya bat coronavirus BtKY72] (SARSr-CoV BtKY72) Subtyp BtKY72

Rhinolophus affinis bat coronavirus RaTG13 [Bat coronavirus RaTG13] (BatCoV-RaTG13, Bat_SL-CoV_RaTG13) – gefunden in Java-Hufeisennasen (Rhinolophus affinis, ) in der chinesischen Provinz Yunnan (mit Gensequenz KP876546 zu BtCoV/4991 Polymerase)

SARS-related betacoronavirus Rp3/2004 (Bt-SLCoV Rp3) – infiziert Rhinolophus sinicus

Bat SARS coronavirus HKU3: Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-3 (Bat_SL-CoV_HKU3-3) Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-7 (Bat_SL-CoV_HKU3-7) Subtyp Bat SARS coronavirus HKU3-12 (Bat_SL-CoV_HKU3-12)

Civet SARS CoV SZ3/2003 (SARS-CoV SZ3) – infiziert Larvenroller

Civet SARS CoV SZ16/2003 (SARS-CoV SZ16) – infiziert Larvenroller

BtRs-BetaCoV/YN2013 (Bat_SL-CoV_YN2013)

Bat coronavirus Rp/Shaanxi2011 (Bat_SL-CoV_Shaanxi2011)

Bat coronavirus Cp/Yunnan2011 (Bat_SL-CoV_Yunnan2011)

BtRs-BetaCoV/GX2013 (Bat_SL-CoV_GX2013)

BtRs-BetaCoV/HuB2013 (Bat_SL-CoV_HuB2013)

Bat SARS CoV Rm1/2004 Subtyp Bat CoV 279/2005 (Bat_SL-CoV_279)

Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231 (Bat_SL-CoV_Rs4231)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231, … (GenBank: KY417146.1).

Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4247 (Bat_SL-CoV_Rs4247)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4247, … (GenBank: KY417148.1).

Bat SARS-like coronavirus isolate Rs7327 (Bat_SL-CoV_Rs7327)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs7327, … (GenBank: KY417151.1).

Bat SARS-like coronavirus isolate Rs9401 (Bat_SL-CoV_Rs9401)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate Rs9401, … (GenBank: KY417152.1).

Bat SARS-like coronavirus isolate As6526 (Bat_SL-CoV_As6526)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate As6526, … (Genbank: KY417142.1)

Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus strain BtKY72 (Bat_SL-CoV_BtKY72)

Bat SARS-like coronavirus YNLF_34C (Bat_SL-CoV_YNLF-34C)NCBI: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus strain BtKY72, … (Genbank: KY352407.1).

Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45 (Bat_SL-CoV_ZXC21, bat-SL-CoVZXC21)NCBI: Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45, … (Genbank: MG772933.1).

…

Spezies „Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008“ Bat_SL-CoV_BM48-31

Spezies „Bat coronavirus RacCS203“ Spezies „Bat coronavirus RacCS22“ Spezies „Bat coronavirus RacCS253“ Spezies „Bat coronavirus RacCS264“ Spezies „Bat coronavirus RacCS271“ Spezies „Bat SARS-like coronavirus Khosta-1“ Spezies „Bat SARS-like coronavirus Khosta-2“ Spezies „Bat SARS-like virus BtSY1“ Spezies „Bat SARS-like virus BtSY2“

Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN05“ Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN07“ Spezies „Betacoronavirus sp. RmYN08“ Spezies „Betacoronavirus sp. RpYN06“ Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN03“ Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN04“ Spezies „Betacoronavirus sp. RsYN09“

Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018A“ Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B“ Bat_SL-CoV_YN2018B Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018C“ Bat_SL-CoV_YN2018C Spezies „Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018D“

Spezies „Horseshoe bat sarbecovirus“

Spezies „“ [Manis-CoV, , Pan_SL-CoV, Pangolin-CoV] – bei Schuppentieren Pangolin coronavirus isolate MP789 – aus der MetagenomikNCBI: txid2509511[Organism:exp] AND MP789. Klade Pan_SL-CoV_GX gefunden in Malaiischen Schuppentieren (Manis javanica, , vom chinesischen Zoll in der Provinz Guangxi beschlagnahmt) Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P4L Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P2V Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P1E Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P5L Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P5E Subtyp Pan_SL-CoV_GX/P3B Klade Pan_SL-CoV_GD gefunden in Malaiischen Schuppentieren (Manis javanica, , vom chinesischen Zoll in der Provinz Guangdong beschlagnahmt) Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P1La Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P2S Subtyp Pan_SL-CoV_GD/P1L mit den SRANCBI Sequence Read Archive (SRA). -Bezeichnern SRR10168374, SRR10168392, SRR10168376, SRR10168377 und SRR10168378

Spezies „Pangolin coronavirus GZ5-2“

Spezies „Rhinolophus siamensis bat sarbecovirus“

Spezies „Sarbecovirus RhGB01“ Bat coronavirus RhGB01 (BatCoV-RhGB01) – aus Metagenomanalysen bei der Kleinen Hufeisennase (Rhinolophus hipposideros) in Gloucestershire (England) und Wales.

Spezies „Sarbecovirus sp. RfGB01“ Spezies „Sarbecovirus sp. RfGB02“ Spezies „Sarbecovirus sp. RhGB07“ Spezies „Sarbecovirus sp. RhGB08“

Spezies „SARS-like coronavirus WIV16“ Bat_SL-CoV_WIV16

Spezies „Bat coronavirus BetaCoV/Rm/Yunnan/YN02/2019“ Bat coronavirus RmYN02 [Rhinolophus malayanus bat coronavirus RmYN02] (BatCoV-RmYN02) – gefunden in der Malaiischen Hufeisennase (R. malayanus).

ohne Zuordnung zu einer Spezies

Sarbecovirus sp. isolate Anlong-112 (Bat_SL-CoV_Anlong-112)NCBI: Sarbecovirus sp. isolate Anlong-112, … (Genbank: KY770859.1).

Sarbecovirus sp. isolate SC2018B (Bat_SL-CoV_SC2018)

Bat_SL-CoV_Rf9402NCBI: Coronavirus BtRl-BetaCoV/SC2018, … (Genbank: GenBank: MK211374.1).

Bat coronavirus RmYN01 (BatCoV-RmYN01 BetaCoV/Rm/Yunnan/YN01/2019)

Bat_SL-CoV_Longguan

Bat coronavirus Rc-o319 [Rhinolophus cornutus bat coronavirus Rc-o319] (BatCoV-Rc-o319) – gefunden im Kot von Horn-Hufeisennasen (Rhinolophus cornutus, ) in Japan

…

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Anm.: Es ist nur eine Auswahl der wichtigsten Vertreter angegeben. Der Referenzstamm der Spezies („Exemplar“) ist SARS-CoV mit Tor2

Anmerkungen

Einzelnachweise ICTV: Taxonomy Browser. Stand: (MSL) #39v2 vom 7. Mai 2024 (). ICTV: (VMR) #39v1 vom 17. Mai 2024 (≙ MSL #39v2). ICTV: ICTV 2018b.v2. MSL #34, 31. Mai 2019 (). ICTV: Sarbecovirus (2023 Release, MSL #39). ICTV: Betacoronavirus pandemicum (2023 Release, MSL #39).

Proposal: NCBI Taxonomy Browser: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Details: Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (species). NCBI Taxonomy Browser: Sarbecovirus, Details: Sarbecovirus (subgenus), mit unclassified Sarbecovirus. NCBI Taxonomy Browser: Bat coronavirus RaTG13 (no rank). NCBI Taxonomy Browser: Pangolin coronavirus (species). NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168376. NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168377. NCBI SRA: Virome of dead pangolin individuals: SRR10168378. Versuche an Mäusen: China experimentiert mit tödlicher Corona-Variante. Auf: n-tv.de vom 23. Januar 2024. Im Original publiziert von der Schutzgemeinschaft Deutscher Wald, Oberursel, 16. Dezember 2015.

Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. Auf: virologica.org, Datenstand: 14. Februar 2020. Quelle: ARTIC Network (). Kristian G. Andersen, Andrew Rambaut, W. Ian Lipkin, Edward C. Holmes, Robert F. Garry: The Proximal Origin of SARS-CoV-2. In: NJature Medicine, Band 26, 17. März 2020, S. 450–452; doi:10.1038/s41591-020-0820-9, Datenstand: 11. März 2020 (). Jack M. Crook, Ivana Murphy, Daniel P. Carter, Steven T. Pullan, Miles Carroll, Richard Vipond, Andrew A. Cunningham, Diana Bell: Metagenomic identification of a new sarbecovirus from horseshoe bats in Europe. In: Scientific Reports, Band 11, Nr. 14723, 19. Juli 2021; doi:10.1038/s41598-021-94011-z (). Dazu: Nadja Podbregar: Neues Coronavirus in britischen Fledermäusen entdeckt. Auf: scinexx.de vom 21. Juli 2021. Tiere aus England und Wales: Neues Coronavirus in Fledermäusen entdeckt. Auf: n-tv.de vom 22. Juli 2021.

Alexandre Hassanin: Coronavirus Could Be a 'Chimera' of Two Different Viruses, Genome Analysis Suggests. Auf: sciencealert vom 24. März 2020. Quelle: The Conversation ().

Tommy Tsan-Yuk Lam Na Jia Ya-Wei Zhang, Marcus Ho-Hin Shum Jia-Fu Jiang, Hua-Chen Zhu, Wu-Chun Cao et al.: Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. In: Nature, Band 583, 26. März 2020, S. 282–285; doi:10.1038/s41586-020-2169-0 (). Dazu: