Orthocoronavirinae

Orthocoronavirinae ist eine Virusunterfamilie innerhalb der Familie Coronaviridae, die weitestgehend mit dieser übereinstimmt. Die Viren innerhalb dieser Unterfamilie werden (fach)umgangssprachlich Orthocoronaviren und veraltet und zweideutig auch bloß Coronaviren genannt.

Auch alle Coronaviren, die den Menschen infizieren, gehören zu den Orthocoronaviren. Darunter auch SARS-CoV-2, das Virus, das für die COVID-19-Pandemie verantwortlich war.

Beschreibung

Bis heute (Stand 2020) entspricht die Beschreibung der Unterfamilie Orthocoronavirinae nahezu vollständig der der übergeordneten Familie Coronaviridae. Das liegt daran, dass die einzige Schwestergruppe – die Unterfamilie der Letoviren (Letovirinae) – nur wenig erforscht ist und nur eine einzige Art – Microhyla letovirus 1 – enthält. Neben strukturellen und statistischen Unterschieden im Virusgenom bei computergestützten Analysen (vgl. Bioinformatik) besteht der wesentlichste Unterschied zwischen den beiden Unterfamilien Orthocoronavirinae und Letovirinae vor allem darin, dass die Letoviren die ersten Coronaviren sind, die Amphibien infizieren.

Benennung Etymologie Der Name der Unterfamilie Orthocoronavirinae setzt sich aus dem Vorsatz „Ortho-“ () und dem früheren Namen dieser Unterfamilie Coronavirinae zusammen. „Orthocoronaviren“ bedeutet so viel wie: „richtige, eigentliche, klassische oder echte Coronaviren“. Das entspricht der zuvor gebrauchten umgangssprachlichen Bezeichnung: „echte Coronaviren“ (), für die Viren dieser Gruppe, bevor die Gruppe den jetzigen Namen erhielt.

Diese Virengruppe wurde zunächst als Gattung unter dem Namen Coronavirus geführt (bis 2008). Durch den Aufstieg in den Rang einer Unterfamilie wurde die Endung in „-virinae“ geändert. Die Herkunft des Namensbestandteils „corona“ wird genauer im Abschnitt Etymologie im Artikel zur Familie Coronaviridae erläutert.

Die Namenserweiterung „Ortho-“ beendete 2018 gewisse Mehrdeutigkeiten, die innerhalb der Familie Coronaviridae aufgrund dessen bestanden, dass der gleiche Wortstamm „Corona-“ für mehrere ineinanderliegende Gruppen verwendet worden war. Näheres unter Taxonomische Hintergründe.

Verwendete Namen Aus dem Taxonnamen Orthocoronavirinae ergibt sich systematisch die Sammelbezeichnung () „Orthocoronaviren“ für Viren dieser Unterfamilie. Besonders im Englischen wird diese Art der Sammelbezeichnung auch „Vernakularname“ () genannt.

Die Sammelbezeichnung „Orthocoronaviren“ ist noch verhältnismäßig jung im Vergleich zum seit den 1960er Jahren gebrauchten Namen „Coronaviren“. Obwohl der ältere Name „Coronaviren“ zweideutig sowohl die Viren der ganzen Familie als auch nur der Unterfamilie (früher: Gattung) bezeichnet, ist er weiter auch für nur die Viren der Unterfamilie im Gebrauch.

Aus diesen Gründen existieren grundsätzlich immer noch zwei Vernakularnamen für die Viren dieser Gruppe. Einmal der doppeldeutige Name „Coronaviren“ (). Dieser findet sich in Literatur bis 2018 und häufig auch noch nach 2018. Und dann der eindeutige Name „Orthocoronaviren“ als taxonomische Sammelbezeichnung seit 2018. Der eigentlich korrekte und eindeutige englische Vernakularname „“ findet allerdings auch heute noch nur gelegentlich Verwendung, dieser ist analog der Bezeichnung des ICTV für die Familie Nanoviridae, sowie bzw. für die Familien der Hominiden respektive Cameliden gebildet.Das ICTV benutzt diese Konstruktion dort zur Unterscheidung von den "", d. h. den Mitgliedern der Gattung Nanovirus innerhalb dieser Familie. Ähnlich findet man "" und "" für die Geminiviridae respektive Genomoviridae im ICTV-akzeptierten Vorschlag 2019.012DA.v1 (ZIP: docx, xlsx) von Krupovic et al. (2019) zum Phylum Cressdnaviricota.

Wegen der Namensähnlichkeit zwischen Familie und Unterfamilie kommt es allenthalben auch zur Falschschreibung des Unterfamiliennamens in der Form: Orthocoronaviridae.

Systematik

Äußere Systematik Die Unterfamilie Orthocoronavirinae besitzt in der Familie Coronaviridae mit Stand 7. Mai 2024 die beiden Schwester-Unterfamilien Letovirinae und Pitovirinae. Nicht mehr dabei die frühere Schwester-Unterfamilie Torovirinae, die 2018 zur heutigen Familie Tobaniviridae mit der neuen(!) Unterfamilie Torovirinae hochgestuft wurde.

Familie UnterfamilieCoronaviridaeLetovirinaePitovirinaeOrthocoronavirinae

Innere Systematik Systematische Darstellung nach ICTV (Stand: 7. Mai 2024).Taxonomy Browser. ICTV.Virus Metadata Resource (VMR). ICTV. (*) ehem. Typusart

Unterfamilie Orthocoronavirinae Gattung Alphacoronavirus (ehem. Phylogruppe Gruppe-1-Coronaviren) Untergattung Amalacovirus Untergattung Colacovirus Untergattung Decacovirus Untergattung Duvinacovirus (mit HCoV_229E) Untergattung Luchacovirus Untergattung Minacovirus Untergattung Minunacovirus Untergattung Myotacovirus Untergattung Nyctacovirus Untergattung Pedacovirus Untergattung Rhinacovirus Untergattung Setracovirus (mit HCoV_NL63) Untergattung Soracovirus Untergattung Sunacovirus Untergattung Tegacovirus Gattung Betacoronavirus (ehem. Phylogruppe Gruppe-2-Coronaviren) mini|hochkant=0.8|Virionen von HCoV_OC43Untergattung Embecovirus (mit HCoV_OC43 und HCoV_HKU1) Untergattung Hibecovirus Untergattung Merbecovirus (mit MERS-CoV) Untergattung Nobecovirus Untergattung Sarbecovirus (mit SARS-CoV und SRS-CoV-2, Details siehe Betacoronavirus pandemicum, §Systematik) mini|TEM-Aufnahme von Virionen des SARS-CoV-2 Untergattung Brangacovirus Untergattung Cegacovirus Untergattung Igacovirus Gattung Deltacoronavirus Untergattung Andecovirus Untergattung Buldecovirus (inkl. ehem Untergattung Moordecovirus) Untergattung Herdecovirus Gattung „Epsiloncoronavirus“ – Vorschlag Untergattung „Tropepcovirus“ – Vorschlag

Taxonomische Hintergründe

Anmerkungen

Einzelnachweise Revision of the family Coronaviridae. (PDF; 0,2 MB) ICTV, Taxonomic proposal to the ICTV Executive Committee 2008.085-126V.

Datenbankeintrag und relevantes Proposal: Eintrag: Proposal 2019.021S zu ICTV-Revision № 2019:

How Llamas Wally and Winter Are Helping Scientists Find Effective COVID-19 Treatments. SciTechDaily, 5. Mai 2021.

Ravi Shankar Singh, Abhishek Kumar Singh, Kamla Kant Shukla, Amit Kumar Tripathi: COVID-19 Pandemic: Evidences from Clinical Studies. In: J Comm Pub Health Nursing, 21. September 2020, 6(4), S. 251; . JE Thomas, B Gronenborn, RM Harding, B Mandal, I Grigoras, JW Randles, Y Sano, T Timchenko, HJ Vetten, HH Yeh, H Ziebell: ICTV Virus Taxonomy Profile: Nanoviridae. ICTV Report Consortium. In: The Journal of General Virology, 12. Januar 2021; doi:10.1099/jgv.0.001544, PMID 33433311.

Kategorie:Virusunterfamilie Kategorie:Coronaviren