mini|TEM-Aufnahme von drei PhiCrAss001-Partikeln: vom Morphotyp der Podoviren. Crassvirales (früher auch , , deutsch etwa crAss-ähnliche Phagen oder kurz crAssphagen genannt) ist die Bezeichnung für eine Ordnung von Bakteriophagen (Viren, die Bakterien infizieren). Der erste Vertreter und Prototyp (mit aktueller Bezeichnung Carjivirus communis, früher Carjivirus crAssphage) wurde 2014 durch rechnergestützte Analyse öffentlich zugänglicher wissenschaftlicher Daten zu Genomen im menschlichen Stuhl entdeckt. Zum Zeitpunkt der Entdeckung der crAssphagen wurde vorausgesagt, dass crAssphagen Bakterien des Phylums (Abteilung) Bacteroidetes infizieren, wie sie im Darmtrakt vieler Tiere, einschließlich des Menschen, häufig vorkommen. Als nach diesen ersten Metagenomik-Ergebnissen der erste Vertreter dieser Gruppe in vitro isoliert wurde, konnte auch bestätigt werden, dass dieser Bacteroides intestinalis infiziert. Dieser erste kultivierte Vertreter (Bacteroides-Phage crAss001, ΦcrAss001, Familie Steigviridae) hat eine Podoviren-Morphologie, aber im Gegensatz zu den damals bekannten Podoviren kein lineares, sondern ein zirkuläres Doppelstrang-DNA-Genom mit einer Größe von etwa 97 kbp (Kilo-Basenpaaren) und enthält nach Vorhersage 80 offene Leserahmen (, ORFs). Derartige Sequenzen sind häufig in menschlichen Stuhlproben zu finden.
Weitere Vertreter der Gruppe infizieren Bacteroidetes-Bakterien der Gattungen Azobacteroides (Bacteroidales), Cellulophaga (Flavobacteriales) und Flavobacterium (Flavobacteriales). Solange noch keine weiteren Vertreter kultiviert werden, lassen sich noch keine sicheren Aussagen über deren Morphologie machen.
Basierend auf der Analyse von Metagenomdaten wurden bei etwa der Hälfte aller untersuchten Menschen crAssphagen-Sequenzen identifiziert. Das Virus bzw. die Ordnung wurde nach der Software crAss (cross-assembly) benannt, mit der das virale Genom gefunden wurde. Damit sind die crAssphagen möglicherweise die ersten Organismen, die zu Werbezwecken nach einem Computerprogramm benannt wurde.
Im März 2021 wurde vorgeschlagen, die bisherige monotypische Ordnung Caudovirales im Phylum Caudoviricetes aufzulösen und die Klade der crAssphagen selbst in den Rang einer Ordnung Crassvirales mit (damals) sechs Familien zu erheben. Dem Vorschlag folgte das (ICTV) im März/April 2022.
Diese Ordnung von Bakterienviren ist wohl zu unterscheiden vom Phylum Cressdnaviricota der CRESS-DNA-Viren mit einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Genom, deren Wirte Eukaryoten (möglicherweise auch Archaeen) sind.
Beschreibung mini|hochkant=2.0|Genome verschiedener Phagen der Crassvirales im Vergleich mini|RNA-Polymerase der crAssphagen CrAssphagen benutzen ein eigenes Enzym (RNA-Polymerase), um RNA-Kopien ihrer Gene zu erstellen. Da alle Zellen, von Bakterien bis hin zum Menschen mit Hilfe solcher RNA-Polymerase RNA-Kopien (mRNA) ihrer Gene herstellen, sind diese Enzyme sehr alt und in allen Lebewesen auch sehr ähnlich (hoch konserviert). Die RNA-Polymerase der crAssphagen ähnelt dagegen eher einem Enzym im Menschen und anderen höheren Organismen, das an der RNA-Interferenz beteiligt ist.
Forschungsgeschichte Zum Zeitpunkt seiner Entdeckung im Jahr 2014 hatte crAssphage keine bekannten Verwandten. Im Jahr 2017 wurde jedoch eine Reihe verwandter Viren entdeckt. Basierend auf einem Screening verwandter Sequenzen in öffentlichen Nukleotiddatenbanken und einer phylogenetischen Analyse wurde zunächst vorgeschlagen, dass crAssphage Teil der ehemaligen expansiven Phagenfamilie Podoviridae in der damaligen Ordnung Caudovirales ist. Diese Zuordnung entspricht heute dem Morphotyp der Podoviren (kein Taxon!) in der Klasse Caudoviricetes. Die Podoviren stimmten in ihrer Morphologie (Kopf-Schwanz-Architektur mit kurzer Schwanzstruktur) äußerlich mit der tatsächlichen bzw. nur vermuteten Erscheinungsform von crAssphage und den anderen „“ überein. Auch das Genom der Podoviren bzw. der Klasse Caudoviricetes ist so wie das der crAssphagen ein Doppelstrang-DNA-Molekül. Hauptunterschied ist aber, dass dieses bei den damals bekannten Podoviren linear vorlag, bei den crAssphagen aber zirkulär.
Vertreter wurden in verschiedenen Umgebungen gefunden: dem menschlichen Darm und Kot dem Termitendarm, in terrestrischen Umgebungen und im Grundwasser in Natronseen (hypersaline Sole) im marinen Sediment an Pflanzenwurzeln
Die Klade der crAssphagen () umfasste nach anfänglichenSchätzungen etwa (mindestens) 10 Gattungen. Mit Stand Mitte Juni 2022 hatte das ICTV bereits 42 Gattungen offiziell anerkannt.
Nachdem man zunächst vorgeschlagen hatte, die crAssphagen (etwa als Unterfamilie) der damaligen Familie Podoviridae unterzuordnen, wurde wegen ihrer hohen Diversität untereinander und der genomischen Unterschiede zu den anderen Vertretern der Caudoviricetes trotz der podovirenartigen äußeren Erscheinung vom ICTV im Jar 2022 eine eigene Ordnung Crassvirales innerhalb der gemeinsamen Klasse Caudoviricetes etabliert.
Systematik mini|Clusteranalyse des menschlichen Darm-Viroms Die Systematik der Crassvirales ist nach mit Stand Mai 2026 wie folgtICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Re<--maskiert gegen Fehleranzeige durch WP Rechtschreibprüfung-->source (VMR). – etliche der ursprünglich vorgeschlagenen Spezies, Gattungen und sogar einige Familien sind derzeit noch nicht bestätigt (unten in Anführungszeichen):
Ordnung Crassvirales (alias crAssphagen im weiteren Sinn, en. ), bestätigte Familien und ggf. weitere vorgeschlagene:
Familie Crevaviridae Unterfamilie Coarsevirinae Gattung Junduvirus Spezies Junduvirus copri, mit Spezies Junduvirus hostitypica, mit Unterfamilie Doltivirinae Gattung Kahucivirus Spezies Kahucivirus intestinalis, mit Gattung Kingevirus Spezies Kingevirus coli, mit Spezies Kingevirus communis, mit Spezies Kingevirus oricola, mit Unterfamilie nicht zugewiesen Gattung Arseivirus Spezies Arseivirus communis (früher Junduvirus communis), mit Spezies Arseivirus coprocoli, mit Spezies Arseivirus intestinalis, mit
Familie Darmviridae – abgetrennt von Intestiviridae Unterfamilie Oafivirinae Gattung „Belmavirus“ Gattung Bohxovirus Spezies Bohxovirus oralis, mit Gattung Buhlduvirus Spezies Buhlduvirus porcinus (ursprünglich Buhlduvirus cr272), mit Phage cr272_1 (alias crAssphage cr272_1, )NCBI: crAssphage cr272_1 (species). Gattung Burzaovirus Spezies Burzaovirus faecalis (ursprünglich Burzaovirus cr124), mit Phage cr124_1 (alias crAssphage cr124_1, )NCBI: crAssphage cr124_1 (species). Spezies „Burzaovirus cr221“ Spezies „Burzaovirus cr264“ Spezies „Burzaovirus cr135“ Spezies „Burzaovirus cr136“ Spezies „Burzaovirus cr137“ Spezies „Burzaovirus cr142“ Spezies „Burzaovirus cr146“ Spezies „Burzaovirus cr45“ Spezies „Burzaovirus cr70“ Spezies „Burzaovirus cr72“ Spezies „Burzaovirus cr80“ Spezies „Burzaovirus cr89“ Gattung Cacepaovirus Spezies Cacepaovirus simiae (ursprünglich Cacepaovirus cr131), mit Phage cr131_1 (alias crAssphage cr131_1, )NCBI: crAssphage cr131_1 (species). Gattung „Cahvavirus“ Gattung „Ceneivirus“ Gattung „Cerpitivirus“ Gattung Chuhaivirus Spezies Chuhaivirus simiae (ursprünglich Chuhaivirus cr130), mit Phage cr130_1 (alias crAssphage cr130_1, )NCBI: crAssphage cr130_1 (species). Unterfamilie nicht zugewiesen Gattung Grauhtavirus Spezies Grauhtavirus mutabilis, mit Spezies Grauhtavirus rectalis, mit Gattung Pelduvirus Spezies Pelduvirus vaga, mit Gattung Scendivirus Spezies Scendivirus animalis (früher Buhlduvirus animalis, ursprünglich Buhlduvirus cr273), mit Phage cr273_1 (alias crAssphage cr273_1, )NCBI: crAssphage cr273_1 (species). Gattung Sdahravirus Spezies Sdahravirus coli (früher Burzaovirus coli, ursprünglich Burzaovirus cr7), mit Phage cr7_1 (alias crAssphage cr7_1, )NCBI: crAssphage cr7_1 (species). Gattung Shedivirus Spezies Shedivirus diversa, mit Spezies Shedivirus hominis, mit Gattung Smehivirus Spezies Smehivirus digestiva, mit Spezies Smehivirus intestinihominis (früher Burzaovirus intestinihominis, ursprünglich Burzaovirus cr29), mit Phage cr29_1 (alias )
Familie IntestiviridaeSIB: Intestiviridae. Auf: ViralZone. Unterfamilie Churivirinae Gattung Jahgtovirus Spezies Jahgtovirus autochthodiversa, mit Spezies Jahgtovirus autochthomedialis, mit Spezies Jahgtovirus gastrointestinalis (ursprünglich Jahgtovirus cr36), mit Phage cr36_1 alias Phage cr36_SRX6402628 Spezies Jahgtovirus homonidigestiva, mit Spezies Jahgtovirus intestinihominis (ursprünglich Jahgtovirus cr107), mit Phage cr107_1 () alias crAssphage cr107_1NCBI: crAssphage cr107_1 (species) Spezies Jahgtovirus medialis, mit mini|Virion von crAss002 im Vergleich zu crAss001Spezies Jahgtovirus secundus, mit (de Bacteroides-Phage crAss002)NCBI: Bacteroides phage crAss002 (species) Spezies „Jahgtovirus cr98“, mit Phage cr98_OLFZ01000108 Spezies „Jahgtovirus cr141“, mit Phage cr141_SRS5361371 Spezies „Jahgtovirus cr275“, mit Phage cr275_SRS019381 Spezies „Jahgtovirus cr48“, mit Phage cr48_ERS473359 Spezies „Jahgtovirus cr94“, mit Phage cr94_ERR589786 Unterfamilie Crudevirinae Gattung Carjivirus Spezies Carjivirus alvocoli, mit Spezies Carjivirus autochthophagica, mit CrAssphage ZA Spezies Carjivirus buccosalivaria, mit Spezies Carjivirus coli, mit CrAssphage LMMB Spezies Carjivirus communis (ursprünglich Carjivirus crAssphage), mit Phage cr5_ERR589774 (der erste per Metagenomik identifizierte Vertreter der Ordnung) Spezies Carjivirus colonirectalis, mit Spezies Carjivirus communis, mit crAssphage (BK010471) Spezies Carjivirus coprohirae, mit Spezies Carjivirus hominis (ursprünglich Carjivirus cr99), mit Phage cr99_1 alias Phage cr99_OLQR01000043 Spezies Carjivirus homonienterica, mit Spezies Carjivirus palatobuccalis, mit Spezies Carjivirus rectalis, mit CrAssphage sp. C0521BD4 Spezies Carjivirus salivaria, mit Spezies Carjivirus vaga, mit CrAssphage sp. C0531BW4 Gattung Dabirmavirus Spezies Dabirmavirus hominis, mit Gattung Delmidovirus Spezies Delmidovirus copri, mit Phage cr123_1 Spezies Delmidovirus intestinihominis (ursprünglich Delmidovirus cr110), mit Phage cr110_1 alias crAssphage cr110_1NCBI: crAssphage cr110_1 (species) Spezies Delmidovirus splanchnicus (ursprünglich Delmidovirus cr11), mit Phage cr11_1 alias crAssphage cr11_1NCBI: crAssphage cr11_1 (species) Spezies „Delmidovirus cr14“, mit Phage cr14_OFMB01000041 Spezies „Delmidovirus cr123“, mit Phage cr123_SRX6402549 Spezies „Delmidovirus cr143“, mit Phage cr143_SRS5361427 Spezies „Delmidovirus cr22“, mit Phage cr22_SRS021948 Gattung Diorhovirus Spezies Diorhovirus coli, mit Spezies Diorhovirus copri (ursprünglich Diorhovirus cr49), mit Phage cr49_1 alias Phage cr49_OGTL01000073 Spezies Diorhovirus intestinalis (ursprünglich Diorhovirus cr3), mit Phage cr3_1 (alias crAssphage cr31_1)NCBI: crAssphage cr3_1 (species) Spezies „Diorhovirus cr144“, mit Phage cr144_ERS743416 Spezies „Diorhovirus cr31“, mit Phage cr31_SRS011134 Gattung Drivevirus Spezies Drivevirus gastrointestinalis, mit Spezies Drivevirus stomatis , mit Gattung „Earahsivirus“ Spezies „Earahsivirus cr81“ Spezies „Earahsivirus cr93“ Gattung Endlipuvirus Spezies Endlipuvirus intestinihominis, mit Gattung „Esdrolevirus“ Spezies „Esdrolevirus cr167“ Gattung Whopevirus Spezies Whopevirus animalis (ursprünglich ), mit Unterfamilie Obtuvirinae Gattung Fohxhuevirus Spezies Fohxhuevirus gastrointestinalis (ursprünglich Fohxhuevirus cr8), mit Phage cr8_1 (alias crAssphage cr8_1)NCBI: crAssphage cr8_1 (species). Spezies Fohxhuevirus mutabilis, mit Gattung „Grehyhuvirus“ Spezies „Grehyhuvirus cr216“ Spezies „Grehyhuvirus cr219“ Gattung „Grihfavirus“ Spezies „Grihfavirus cr207“ Gattung Hacihdavirus Spezies Hacihdavirus animalis (ursprünglich Hacihdavirus cr271), mit Phage cr271_1 (alias crAssphage cr271_1)NCBI: crAssphage cr271_1 (species) Gattung „Hahvinivirus“ Spezies „Hahvinivirus cr280“ Gattung Wotdevirus