Johann Nägeli ist der Name folgender Personen:
* Johann Caspar Nägeli (1696–1742), Schweizer Pfarrer und Agronom Johann Jakob Nägeli (1736–1806), Schweizer Pfarrer, Komponist und Chorleiter, siehe Hans Jakob Nägeli Johann Konrad Nägeli (1768–1828), Schweizer Pfarrer und Landwirt, siehe Hans Konrad Nägeli