Phaeovirus ist eine Gattung von Viren in der Familie der Phycodnaviridae und gehört damit zum Phylum Nucleocytoviricota (alias Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV). Als natürliche Wirte dienen Algen der Ordnung Ectocarpales. Es gibt (mit Stand 30. April 2024) drei Spezies in dieser Gattung. Der Wortbestandteil Phaeo- ist abgeleitet von griechisch φαιός phaiós: „dunkel“.
Systematik Innere Systematik Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat mit Stand 30. April 2024 folgende Spezies anerkannt:ICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
Gattung Phaeovirus Spezies Phaeovirus feldmanniae mit Feldmannia species virus (FLSV, FsV, FspV, Wirt Feldmannia sp., Ectocarpales: Acinetosporaceae)William H. Wilson, Ilana C. Gilg, Mohammad Moniruzzaman, Erin K. Field, Sergey Koren, Gary R. LeCleir, Joaquín Martínez Martínez, Nicole J. Poulton, Brandon K. Swan, Ramunas Stepanauskas, Steven W. Wilhelm: Genomic exploration of individual giant ocean viruses, in: ISME Journal, Band 11, Nr. 8, August 2017, S. 1736–1745, doi:10.1038/ismej.2017.61, , PMID 28498373Christoph M. Deeg, Cheryl-Emiliane T. Chow, Curtis A. Suttle: The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea, in: eLife 7, 27. März 2018, e33014, doi:10.7554/eLife.33014. Hier insbes.: Fig. 6 Supplement 1 Spezies Phaeovirus irregularis mit Feldmannia irregularis virus a (FirrV-a, auch FirrV-1) Spezies Phaeovirus unasiliculosus mit Ectocarpus siliculosus virus 1 (EsV-1, ehem. Typusspezies, Wirt Ectocarpus siliculosus, Ectocarpales: Ectocarpaceae)
Nicht mehr offiziell geführt werden folgende Vertreter: Spezies „Ectocarpus siliculosus virus a“ (EsV-a, auch EsV-1a, Wirt Ectocarpus siliculosus, Ectocarpales: Ectocarpaceae) Spezies „Ectocarpus fasciculatus virus a“ (EfV-a, Wirt Ectocarpus fasciculatus) Spezies „Feldmannia species virus a“ (FsV-a) Spezies „Hincksia hinckiae virus a“ (HhV-a, auch HhV-1, Wirt Hincksia hinckiae, Ectocarpales: Acinetosporaceae) Spezies Myriotrichia clavaeformis virus a (McV-a, auch McV-1, Wirt Myriotrichia clavaeformis, Ectocarpales: Chordariaceae) Spezies „Pilayella littoralis virus 1“ (PlV-1, Wirt Pylaiella littoralis — sic! siehe WoRMSWoRMS: Pilayella littoralis (Linnaeus) Kjellman, 1872 (x Status: unaccepted), und Pylaiella littoralis (Linnaeus) Kjellman, 1872 (✔︎ Status: accepted) und AlgaeBase,Guiry & Guiry: Pylaiella littoralis, AlgaeBase, World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway 2018 (Aufgerufen am 21. Dezember 2018) Ectocarpales: Acinetosporaceae)
Eine Liste, die auch einzelne Stämme (Isolate) und Abkürzungen aufführt findet man bei ScienceDirect.Phycodnaviridae: List of species in the genus Phaeovirus, Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, in: Virus Taxonomy (ScienceDirect), 2012, S. 249-262, doi:10.1016/B978-0-12-384684-6.00024-0 Oft – nicht immer – bezeichnet der Zusatz -a eine Spezies, -1 den zugehörigen Typus-Stamm (Isolat).
Äußere Systematik Die folgende Systematik folgt Schulz et al. (2018) mit Korrekturen und Ergänzungen nach Hao et al. (2018):
YSLPV = „Yellowstone Lake Phycodnavirus“ DSLPV = „Dishui Lake Phycodnavirus“ Chlorovirus-Typ = „Phycodnaviridae“ s. s.
Greiner et al. (2018) sehen YLPV2 (alias YSLPV2, Yellowstone Phycodnavirus 2) jedoch nicht in der Klade der Viren vom Chlorovirus-Typ.
Coccolithovirus, „Sylvanvirus“ und die PV_04-Klade werden heute jedoch meist in einer gemeinsamen Klade „Pandoravirales“ gesehen.
Aufbau Die Virionen (Virusteilchen) der Phaeoviren haben eine Hülle mit ikosaedrischer oder sphärischer Geometrie mit der Triangulationszahl . Der Durchmesser beträgt ca. 120–150 nm.
Genom mini|Karte des linearen Genoms von EsV-1, kreisförmig dargestellt. Das Genom ist linear und hat eine Länge von etwa 150–350 Kbp (Kilobasenpaaren).
Bei der Typusspezies EsV-1 haben die Virionen einen Durchmesser von 200 nm, die Genomlänge beträgt 335.593 bp, es werden vorhergesagt 240 Proteine kodiert und der GC-Gehalt liegt bei 51,7 %.Jean-Michel Claverie, Chantal Abergel: Mimiviridae: An Expanding Family of Highly Diverse Large dsDNA Viruses Infecting a Wide Phylogenetic Range of Aquatic Eukaryotes]. In: Viruses. 2018 Sep; 10(9), 18. September 2018, S. 506, doi:10.3390/v10090506, , PMID 30231528, Tab. 2David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, , hier: Supplement 1 (xlsx)
Vermehrungszyklus Die Virusreplikation geschieht nukleo-cytoplasmatisch (vom Zellkern ins Zytoplasma). Das Virus verlässt die Wirtszelle durch Lyse vermittels lytischer Phospholipide. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.
Literatur Dickson Kinyanyi, George Obiero, Peris W Amwayi, Stephen Mwaniki, Mark Wamalwa: In silico structural and functional prediction of African swine fever virus protein-B263R reveals features of a TATA-binding protein. In: PeerJ, Band 6, Nr. 4, S. e4396, 2018; doi:10.7717/peerj.4396, ResearchGate:323344287 (). Siehe S. 13, insbes. Fig. 7. Weijia Zhang, Jinglie Zhou, Taigang Liu, Yongxin Yu, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: Four novel algal virus genomes discovered from Yellowstone Lake metagenomes. In: Scientific Reports, Band 5, Artikel Nr. 15131, 13. Oktober 2015; doi:10.1038/srep15131 ().
Einzelnachweise Frank O. Aylward, Mohammad Moniruzzaman, Anh D. Ha, Eugene V. Koonin: A phylogenomic framework for charting the diversity and evolution of giant viruses. In: PLOS Biology, 27. Oktober 2021; doi:10.1371/journal.pbio.3001430 (). Nicolas Delaroque, Wilhelm Boland: The genome of the brown alga Ectocarpus siliculosus contains a series of viral DNA pieces, suggesting an ancient association with large dsDNA viruses. In: BMC Evolutionary Biology, Band 8, Nr. 110, 12. April 2008; doi:10.1186/1471-2148-8-110, PMID 18405387, (). Mit Genomkarte. Timo Greiner, Anna Moroni, James L. Van Etten, Gerhard Thiel: Genes for Membrane Transport Proteins: Not So Rare in Viruses. In: MDPI Viruses, Band 10, Nr. 9, Special Issue Algae Virus, 26 August 2018, 456; doi:10.3390/v10090456 (). Hao Chen, Weijia Zhang, Xiefei Li, Yingjie Pan, Shuling Yan, Yongjie Wang: The genome of a prasinoviruses-related freshwater virus reveals unusual diversity of phycodnaviruses. In: BMC Genomics, Dezember 2018, 19:49 (online 15. Januar 2018); doi:10.1186/s12864-018-4432-4 () Eugene V. Koonin, Natalya Yutin: Multiple evolutionary origins of giant viruses. In: F1000 Research. 22. November 2018; doi:10.12688/f1000research.16248.1, version 1 (). Fumito Maruyama, Shoko Ueki: Evolution and Phylogeny of Large DNA Viruses, Mimiviridae and Phycodnaviridae Including Newly Characterized Heterosigma akashiwo Virus. In: Front. Microbiol. 30. November 2016, doi:10.3389/fmicb.2016.01942, , PMID 27965659. Luke A. Sarre, Iana V. Kim, Vladimir Ovchinnikov, Marine Olivetta, Hiroshi Suga, Omaya Dudin, Arnau Sebé-Pedrós, Alex de Mendoza: DNA methylation enables recurrent endogenization of giant viruses in an animal relative. In: ScienceAdvances, Band 10, Nr. 28, 12. Juli 2024; doi:10.1126/sciadv.ado6406 (). Frederik Schulz, Lauren Alteio, Danielle Goudeau, Elizabeth M. Ryan, Feiqiao B. Yu, Rex R. Malmstrom, Jeffrey Blanchard, Tanja Woyke: Hidden diversity of soil giant viruses. In: Nature Communications, Band 9, Nr. 4881, 19. November 2018; doi:10.1007/s00705-016-2853-4 (). Helena H. Vieira, Paul-Adrian Bulzu, Vojtěch Kasalický, Markus Haber, Petr Znachor, Kasia Piwosz, Rohit Ghai: Isolation of a widespread giant virus implicated in cryptophyte bloom collapse. In: The ISME Journal, Band 18, Nr. 1, Januar 2024, S. wrae029; doi:10.1093/ismejo/wrae029, Epub 24. Februar 2024 (englisch).
Weblinks Viralzone: Phaeovirus ICTV
Kategorie:Virusgattung Kategorie:Pflanzenvirus Kategorie:Phycodnaviren