San Juan Nepomuceno steht für:
San Juan Nepomuceno, spanischer Name von Johannes Nepomuk (um 1350–1393), böhmischer Priester und Märtyrer
geographische Objekte: San Juan Nepomuceno (Kolumbien), Gemeinde im Departamento Bolívar, Kolumbien San Juan Nepomuceno (Paraguay), Distrikt im Departamento Caazapá, Paraguay San Juan Nepomuceno (Jesuitenreduktion), Jesuitenreduktion und Kirche im Chaco
Sonstiges: San Juan Nepomuceno (Schiff), Linienschiff der gleichnamigen Klasse der spanischen Marine