Johann Jakob Baier ist der Name folgender Personen:

* Johann Jakob Baier (Mediziner, 1677) (1677–1735), deutscher Mediziner, Geologe und Hochschullehrer Johann Jakob Baier (Mediziner, 1724) (1724–1812), deutscher Mediziner

Siehe auch: Johann Jacob Baeyer (1794–1885), deutscher Generalleutnant und Geodät