Pfaffengraben heißen folgende geographische Objekte:
Orte: Pfaffengraben (Gemeinde Neuhaus), Ort bei Neuhaus am Klausenbach, Bezirk Jennersdorf, Burgenland
Gewässer: Pfaffengraben (Bartelsgraben), linker Zufluss des Bartelsgrabens (zur Wern) bei Niederwerrn, Landkreis Schweinfurt, Bayern Pfaffengraben (Börsbach), linker Zufluss des Börsbachs nahe Gochsheim, Stadt Kraichtal, Landkreis Karlsruhe, Baden-Württemberg Pfaffengraben (Elbach), rechter Zufluss des Elbachs (zur Leitzach) vor Durham, Gemeinde Fischbachau, Landkreis Miesbach, Bayern Pfaffengraben (Fränkische Saale), linker Zufluss der Fränkischen Saale bei Wolfsmünster, Gemeinde Gräfendorf, Landkreis Main-Spessart, Bayern Pfaffengraben (Itz), indirekter linker Zufluss der Itz bei Großheirath, Landkreis Coburg, Bayern Pfaffengraben (Kessach), rechter Zufluss der Kessach bei Oberkessach, Gemeinde Schöntal, Hohenlohekreis, Baden-Württemberg Pfaffengraben (Kuhbach), rechter Zufluss des Kuhbachs bei Kemmeten, Stadt Künzelsau, Hohenlohekreis, Baden-Württemberg Pfaffengraben (Leitzach), rechter Zufluss des Elbachs bei Durham, Gemeinde Fischbachau, Landkreis Miesbach, Bayern Pfaffengraben (Onolzbach), rechter Zufluss des Onolzbachs bei Neudorf, kreisfreie Stadt Ansbach, Bayern Pfaffengraben (Regen), linker Zufluss des Regen in Reichenbach, Landkreis Cham, Bayern Pfaffengraben (Schwarzlofer), linker Zufluss der Schwarzlofer bei der Wirtalm, Gemeinde Reit im Winkl, Landkreis Traunstein, Bayern Pfaffengraben (Sormitz), rechter Zufluss der Sormitz vor Hockeroda, Gemeinde Kaulsdorf, Landkreis Saalfeld-Rudolstadt, Thüringen Pfaffengraben (Suhl), linker Oberlauf der Suhl (Weihe) beim Sommerschloss Blumenstein, Gemeinde Wildeck, Landkreis Hersfeld-Rotenburg, Hessen Pfaffengraben (Thayamühlbach), Kanal des Thayamühlbachs in Laa an der Thaya, Bezirk Mistelbach, Niederösterreich Pfaffengraben (Weißenbach), linker Zufluss des Weißenbachs (zur Halbammer) im Gemeindegebiet von Wildsteig, Landkreis Weilheim-Schongau, an der Grenze zu Halblech im Landkreis Ostallgäu, Bayern
Täler: Pfaffengraben (Eibenstein), bei Eibenstein an der Thaya im Waldviertel, Niederösterreich Pfaffengraben (Hauptkamm des Höllengebirges), Karst-Trockental und Talpasslage (1345 m) im Höllengebirge oberhalb der Langbathseen, Oberösterreich Pfaffengraben (Kamptal), unterhalb des Ottensteiner Stausees im Waldviertel, Niederösterreich Pfaffengraben (Weißenbach), Talung bei Weißenbach an der Enns und Sankt Gallen, Bezirk Liezen, Oberösterreich Pfaffengraben (Hengsberg), bei Hengsberg, Weststeirisches Riedelland, Steiermark Steinacher Pfaffengraben, Karst-Trockental im Höllengebirge oberhalb von Stainach am Attersee, Oberösterreich
Siehe auch: Pfaffenbach Pfaffenstockgraben, rechter Zufluss des Sulzbachs (zum Reutibach) in Grundsheim, Alb-Donau-Kreis, Baden-Württemberg Pfarrgraben