Ein Cap-independent Translation Element (CITE oder 3'CITE, zu deutsch Cap-Struktur-unabhängiges Translationselement) ist eine bestimmte RNA-Sequenz in der 3'UTR von einigen pflanzenpathogenen RNA-Viren.
Eigenschaften In Eukaryoten dient die Cap-Struktur am 5'-Ende der mRNA der Einleitung der Proteinbiosynthese. In manchen RNA-Viren kommen alternative Mechanismen vor, z. B. IRES oder CITE. Durch die alternativen Mechanismen werden entweder die 60S-Untereinheit des Ribosoms oder Translations-Initiationsfaktoren (z. B. eIF4E)Z. Wang, M. Parisien, K. Scheets, W. A. Miller: The cap-binding translation initiation factor, eIF4E, binds a pseudoknot in a viral cap-independent translation element. In: Structure (London, England : 1993). Band 19, Nummer 6, Juni 2011, , S. 868–880, , PMID 21645857, . gebunden. Das CITE in manchen Viren führt zu einer Annäherung des 5'- und des 3'-UTRs.R. Shen, A. M. Rakotondrafara, W. A. Miller: trans regulation of cap-independent translation by a viral subgenomic RNA. In: Journal of virology. Band 80, Nummer 20, Oktober 2006, , S. 10045–10054, , PMID 17005682, .
In der RNA2 des red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) ist das CITE zudem essentiell für die Replikation der viralen RNA negativer Polarität.
CITE können nach ihrem Aufbau in verschiedene Typen eingeteilt werden:
Struktur Beispiel TED (translation enhancer domain) Satellite tobacco necrosis virus (STNV)R. Shen, W. A. Miller: Structures required for poly(A) tail-independent translation overlap with, but are distinct from, cap-independent translation and RNA replication signals at the 3' end of Tobacco necrosis virus RNA. In: Virology. Band 358, Nummer 2, Februar 2007, , S. 448–458, , PMID 17023016, . BTE (BYDV-like translation element) Barley yellow dwarf virus (BYDV)N. M. Salem, W. A. Miller, A. Rowhani, D. A. Golino, A. L. Moyne, B. W. Falk: Rose spring dwarf-associated virus has RNA structural and gene-expression features like those of Barley yellow dwarf virus. In: Virology. Band 375, Nummer 2, Juni 2008, , S. 354–360, , PMID 18329064. PTE (PMV-like translation element) Hirse-Mosaik-Virus (en. Panicum mosaic virus, PMV) TSS (T-shaped structure, ‚T-förmige Struktur‘) Turnip crinkle virus (TCV)X. Zuo, J. Wang, P. Yu, D. Eyler, H. Xu, M. R. Starich, D. M. Tiede, A. E. Simon, W. Kasprzak, C. D. Schwieters, B. A. Shapiro, Y. X. Wang: Solution structure of the cap-independent translational enhancer and ribosome-binding element in the 3' UTR of turnip crinkle virus. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Band 107, Nummer 4, Januar 2010, , S. 1385–1390, , PMID 20080629, . Y-förmig Tomato bushy stunt virus (TBSV) I-förmig Maize necrotic streak virus (MNeSV)
Literatur
Einzelnachweise
Kategorie:RNA