Die Rektoren der Universität Basel wechselten sich anfangs zweimal pro Jahr ab, seit 1565 jährlich und heute alle vier Jahre.Rektoren der Universität Basel.
Name des Rektors Jahr(e) des Rektorats Georg von Andlau 1460 Kaspar zu Rhein 1460 Peter zum Luft 1461 Johann Kreuzer 1461 Gerhardus In-Curia 1462 Werner Wölflin 1462 Wilhelmus Textoris 1463 Johann Helmich 1463 Johann Blicherod 1464 Arnold Truchses von Wolhusen 1464 Niklaus Betzlin 1465 Johannes Grütsch 1466 Stephanus Mistralis 1466 Peter zum Luft 1467 Wilhelmus Textoris 1467 Georius Bernolt 1468 Jodocus von Bruchsal 1468 Gerhardus von Eremberg 1469 Petrus Testoris 1469 Peter Brunnstein 1470 Johannes Siber 1470 Hiltbrandus Brandenburg 1471 Peter von Andlau 1471 Otto Klingen 1472 Jacobus Lapidis 1472 Georg Fuchs 1473 Christoph von Utenheim 1473 Johannes von Berwangen 1474 Adam Brun 1474 Johannes Institoris 1475 Wilhelm Dremborn 1475 Ulrich Wild 1476 Jakob Lauber 1476 Johannes Lauber 1477 Jakobus Hugonis 1477 Arnold Reich von Reichenstein 1478 Bernhard Oeglin 1478 Bernhardus Molitoris 1479 Johannes Sporer 1479 Jakob von Liebenstein 1480 Hieronimus von Weiblingen 1480 Johannes Mathie von Gengenbach 1481 Bernhard Oeglin 1481 Johannes Siber 1482 Johann Ulrich Surgant 1482 Johannes Herborn 1483 Adam Brun 1483 Heinrich Vischer alias Currificis 1484 Andreas Oudorp 1484 Hieronimus von Weiblingen 1485 Georius Bernolt 1485 Ludwig Odertzheim 1486 Thammo Loser 1486 Johann Ulrich Surgant 1487 Johannes Siber 1487 Johannes Parva Petra et de Rupe 1488 Bernhard Oeglin 1488 Michael Wildeck 1489 Johannes Sigrist 1489 Johannes Marolf 1490 Heinrich Vogt 1490 Andreas Oudorp 1491 Jacob Zimmermann (Carpentarius) 1491 Johannes Schenk von Limburg 1492 Erhard Battmann von Neuenburg 1492 Wilhelm Grieb 1493 Johannes Institoris 1493 Johannes Stump 1494 Johann Ulrich Surgant 1494 Michael Wildeck 1495 Ulrich Krafft 1495 Melchior von Baden 1496 Michael Oeglin 1496 Johann von Tunsel (Silberberg) 1497 Matheus Bubenhofer 1497 Heinrich Fischer 1498 Johannes Herborn 1498 Leonhard Marschalk 1499 Hieronimus von Weiblingen 1499 Arnold zum Luft 1500 Ulrich Krafft 1500 Johann Ulrich Surgant 1501 Georius Bernolt 1501 Johannes Wentz 1502 Johann von Tunsel (Silberberg) 1502 Theobald Westhofer 1503 Adam von Müllenberg 1503 Ladislaus Ulricher 1504 Wilhelm Grieb 1504 Hieronymus Brilinger 1505 Johannes Sattler 1505 Theobald Westhofer 1506 Werner Schlierbach 1506 Johannes Gebwiler 1507 Christian Strub 1507 Johannes Wysshar 1508 Arnold zum Luft 1508 Adam von Müllenberg 1509 Niklaus Justinger 1509 Jacob Göttisheim 1510 Augustin Lutenwang 1510 Georius Graf von Tengen 1511 Niklaus Briefer 1511 Martin Schiner 1512 Johannes Wentz 1512 Johannes Sattler 1513 Mathias Hölderlin (Sambucellus) 1513 Ludwig Bär 1514 Heinrich Rink 1514 Peter Wenck 1515 Johannes Gebwiler 1515 Werner Schlierbach 1516 Johannes Suter 1516 Wolfgang Fabricius Capito 1517 Augustin Lutenwang 1517 Johannes Sattler 1518 Werner Schlierbach 1518 Johannes Romanus Wonnecker 1519 Claudius Cantiuncula 1519 Ludwig Bär 1520 Niklaus Briefer 1520 Peter Wenck 1521 Johannes Sattler 1521 Johannes Gebwiler 1522 Johannes Romanus Wonnecker 1522 Petrus Fabrinus 1523 Niklaus Briefer 1523 Peter Wenck 1524 Werner Schlierbach 1524 Johannes Vischer (Currificis) 1525 Heinrich Rink 1525 Bonifazius Amerbach 1526 Leonhard Rebhan 1526 Hieronimus Blotzheim 1527 Nicolaus Dumanus (Gaillard) 1527 Sebastian Müller (Molitoris) 1528 Oswald Bär 1532 Paulus Constantinus Phrygio 1533 Paulus Constantinus Phrygio 1534 Bonifazius Amerbach 1535 Wolfgang Wissenburg 1536 Andreas Bodenstein (Karlstadt) 1537 Hieronymus Artolphus 1538 Niklaus Briefer 1539 Bonifazius Amerbach 1540 Simon Grynaeus 1541 Albanus Torinus 1542 Johannes Huber 1543 Oswald Bär 1544 Johannes Sphyractes (Jeuchdenhammer) 1545 Martin Borrhaus 1546 Sebastian Münster 1547 Ulrich Iselin 1548 Wolfgang Wissenburg 1549 Oswald Bär 1550 Bonifazius Amerbach 1551 Simon Sulzer 1552 Martin Borrhaus 1553 Ulrich Iselin 1554 Johannes Huber 1555 Bonifazius Amerbach 1556 Wolfgang Wissenburg 1557 Johannes Sphyractes (Jeuchdenhammer) 1558 Isaak Keller 1559 Ulrich Iselin 1560 Basilius Amerbach 1561 Simon Sulzer 1562 Ulrich Coccius 1563 Marcus Hopper 1564 Ulrich Coccius 1564 Theodor Zwinger 1565 Basilius Amerbach 1566 Johannes Huber 1567 Simon Sulzer 1568 Isaak Keller 1569 Felix Platter 1570 Ulrich Coccius 1571 Theodor Zwinger 1572 Basilius Amerbach 1573 Samuel Grynaeus 1574 Simon Sulzer 1575 Felix Platter 1576 Christian Wurstisen 1577 Nicolaus Stupanus 1578 Ulrich Coccius 1579 Basilius Amerbach 1580 Theodor Zwinger 1581 Felix Platter 1582 Christian Wurstisen 1583 Christian Wurstisen 1584 Heinrich Pantaleon 1585 Basilius Amerbach 1586 Johannes Brandmüller 1587 Felix Platter 1588 Samuel Grynaeus 1589 Johann Jacob Grynaeus 1590 Johannes Gut 1591 Caspar Bauhin 1592 Samuel Grynaeus 1593 Johannes Brandmüller 1594 Felix Platter 1595 Johann Jacob Grynaeus 1596 Ludwig Iselin 1597 Caspar Bauhin 1598 Heinrich Justus 1599 Amandus Polanus von Polansdorf 1600 Johannes Gut 1601 Thomas Coccius 1602 Johann Jacob Grynaeus 1603 Johannes Jacob Fäsch 1604 Felix Platter 1605 Jacob Zwinger 1606 Ludwig Iselin 1607 Peter Ryff 1608 Amandus Polanus von Polansdorf 1609 Johannes Gut 1610 Caspar Bauhin 1611 Johannes Jacob Fäsch 1612 Martin Chmieleck 1613 Johannes Buxtorf 1614 Johannes Gut 1615 Peter Ryff 1616 Sebastian Beck 1617 Johannes Jacob Fäsch 1618 Caspar Bauhin 1619 Johann Rudolf Burckhardt 1620 Johannes Wolleb 1621 Johannes Gut 1622 Thomas Platter 1623 Ludwig Lucius 1624 Sebastian Beck 1625 Johannes Jacob Fäsch 1626 Martin Chmieleck 1627 Johann Rudolf Burckhardt 1628 Martin Chmieleck 1629 Johannes Jacob Fäsch 1630 Emanuel Stupanus 1631 Jacob Burckhardt 1632 Sebastian Beck 1633 Johann Jakob von Brunn 1634 German Obermeyer 1635 Theodor II. Zwinger 1636 Remigius Faesch 1637 Johann Caspar I. Bauhin 1638 Johannes II. Buxtorf 1639 Sebastian Beck 1640 Johann Jacob I. Hoffmann 1641 Emanuel Stupanus 1642 Jacob Hagenbach 1643 Theodor II. Zwinger 1644 Johann Jakob I. Faesch 1645 Johann Jakob von Brunn 1646 Jacob Burckhardt 1647 Sebastian Beck 1648 Remigius Faesch 1649 Johann Caspar I. Bauhin 1650 Felix Platter 1651 Johannes II. Buxtorf 1652 Lukas Burckhardt 1653 Emanuel Stupanus 1654 Peter Falckeisen 1655 Johann Rudolf II. Wettstein 1656 Jakob Brandmüller 1657 Johann Jakob von Brunn 1658 Lukas Gernler 1659 Remigius Faesch 1660 Johann Caspar I. Bauhin 1661 Johannes II. Buxtorf 1662 Lukas Burckhardt 1663 Johann Caspar I. Bauhin 1664 Johann Friedrich Buckhardt 1665 Johannes Zwinger 1666 Johann Rudolf I. Burckhardt 1667 Simon Battier 1668 Johann Rudolf II. Wettstein 1669 Jakob Brandmüller 1670 Johann Heinrich Glaser 1671 Christoph Faesch 1672 Lukas Gernler 1673 Nikolaus Passavant 1674 Johann Caspar I. Bauhin 1675 Jakob Rüdin 1676 Peter Werenfels 1677 Lukas Burckhardt 1678 Johann Rudolf I. Burckhardt 1679 Johann Jakob Buxtorf 1680 Johannes Zwinger 1681 Nikolaus Passavant 1682 Jakob Roth 1683 Johann Jakob Harder 1684 Peter Werenfels 1685 Sebastian Faesch 1686 Nikolaus Eglinger 1687 Bonifacius Faesch 1688 Johann Rudolf III. Wettstein 1689 Lukas Burckhardt 1690 Jakob Roth 1691 Johannes Wettstein 1692 Johannes Zwinger 1693 Sebastian Faesch 1694 Johann Jakob Harder 1695 Johann Jakob Buxtorf 1696 Peter Werenfels 1697 Jakob Burckhardt 1698 Nikolaus Eglinger 1699 Jakob I Bernoulli 1700 Johann Rudolf III. Wettstein 1701 Bonifacius Faesch 1702 Johann Jakob Harder 1703 Theodor III. Zwinger 1704 Samuel Werenfels 1705 Jakob Burckhardt 1706 Nikolaus Eglinger 1707 Johann Jakob Battier 1708 Johann Rudolf III. Wettstein 1709 Bonifacius Faesch 1710 Theodor III. Zwinger 1711 Emanuel Zaeslin 1712 Hieronymus Burckhardt 1713 Johann Jakob Battier 1714 Johann Rudolf Beck 1715 Johannes I. Bernoulli 1716 Jacob Christoph Iselin 1717 Johann Jakob Battier 1718 Johann Heinrich Staehelin 1719 Johannes III. Buxtorf 1720 Nikolaus Harscher 1721 Samuel Werenfels 1722 Samuel Battier 1723 Johann Rudolf Beck 1724 Hieronymus Burckhardt 1725 Emanuel Zaeslin 1726 Johann Rudolf von Waldkirch 1727 Johann Rudolf Mieg 1728 Johann Rudolf II. Zwinger 1729 Hieronymus Burckhardt 1730 Johannes II. Tonjola 1731 Christoph Eglinger 1732 Nikolaus Harscher 1733 Emanuel II. König 1734 Jacob Christoph Iselin 1735 Benedict Staehelin 1736 Peter Ryhiner 1737 Nikolaus I Bernoulli 1738 Nikolaus I Bernoulli 1739 Johann Rudolf II. Zwinger 1740 Johannes I. Bernoulli 1741 Johannes Grynaeus 1742 Nikolaus I Bernoulli 1743 Daniel Bernoulli 1744 Andreas Weiss 1745 Johann Balthasar Burckhardt 1746 Nikolaus I Bernoulli 1747 Emanuel II. König 1748 Jeremias Raillard 1749 Jakob Christoph Beck 1750 Johann Rudolf Thurneysen 1751 Johann Rudolf II. Zwinger 1752 Peter Ryhiner 1753 Johann Balthasar Burckhardt 1754 Nikolaus I Bernoulli 1755 Daniel Bernoulli 1756 Jeremias Raillard 1757 Jakob Christoph Beck 1758 Johann Rudolf Thurneysen 1759 Friedrich Zwinger 1760 Jakob Christoph Ramspeck 1761 Emanuel Ryhiner 1762 Johann Rudolf Iselin 1763 Johann Rudolf Staehelin 1764 Johannes II. Bernoulli 1765 Jakob Christoph Beck 1766 Johann Heinrich Falckner 1767 Friedrich Zwinger 1768 Jakob Basler 1769 Johann Wernhard Herzog 1770 Johann Rudolf Thurneysen 1771 Johann Rudolf Staehelin 1772 Johann Heinrich Ryhiner Johann Balthasar Burckhardt 1774 Johann Heinrich Falckner 1775 Jakob Meyer 1776 Jakob Christoph Beck 1777 Johann Heinrich David 1778 Johann Rudolf Staehelin 1779 Johann Heinrich Ryhiner 1780 Johann Wernhard Herzog 1781 Johann Jakob d’Annone 1782 Wernhard de Lachenal 1783 Jakob Meyer 1784 Johann Wernhard Herzog 1785 Johann Heinrich Falckner 1786 Achilles Mieg 1787 Johann Rudolf Buxtorf 1788 Jakob Meyer 1789 Johann Heinrich David 1790 Johann Rudolf Staehelin 1791 Johann Heinrich Ryhiner 1792 Johann Wernhard Herzog 1793 Johann Jakob d’Annone 1794 Wernhard de Lachenal 1795 Johann Jakob II. Thurneysen 1796 Jakob Meyer 1797 Johann Heinrich Falckner 1798 Achilles Mieg 1799 Daniel Wolleb 1800 Johann Rudolf Buxtorf 1801 Johann Heinrich Falckner 1802 Johann Jakob Stückelberger 1803 Daniel Huber 1804 Johann Wernhard Herzog 1805 Johann Rudolf Faesch 1806 Carl Friedrich Hagenbach 1807 Christoph Legrand 1808 Jakob Meyer 1809 Johann Heinrich Falckner 1810 Johann Rudolf II. Burckhardt 1811 Hieronymus Koenig 1812 Johann Rudolf Buxtorf 1813 Johann Rudolf Faesch 1814 Johann Jakob Stückelberger 1815 Friedrich de Lachenal 1816 Johann Rudolf Buxtorf 1817 Ignaz Paul Vital Troxler 1831 Wilhelm Martin Leberecht de Wette 1835 Friedrich Brömmel 1836 Franz Dorotheus Gerlach 1837 Friedrich Fischer 1838 Karl Friedrich Meissner 1839 Karl Rudolf Hagenbach 1840 Wilhelm Wackernagel 1841 Johann Georg Müller 1842 Friedrich Miescher 1843 Christian Friedrich Schönbein 1844 Wilhelm Vischer 1845 Johann Jacob Stähelin 1846 Wilhelm Vischer 1846 Franz Dorotheus Gerlach 1847 Franz Dorotheus Gerlach 1848 Wilhelm Martin Leberecht de Wette 1849 Karl Rudolf Hagenbach 1849 Karl Rudolf Hagenbach 1850 Johannes Schnell 1851 Johannes Schnell 1852 Friedrich Miescher 1853 Christoph Johannes Riggenbach 1854 Wilhelm Wackernagel 1855 Roderich von Stintzing 1856 Wilhelm Vischer 1857 Johann Georg Müller 1858 Gustav Heinrich Wiedemann 1859 Peter Merian 1860 Karl Friedrich Meissner 1861 Karl Steffensen 1862 Franz Dorotheus Gerlach 1863 Karl Steffensen 1864 Ludwig Rütimeyer 1865 Wilhelm Wackernagel 1866 Andreas Heusler 1867 Hermann Schultz 1868 Wilhelm His 1869 Eduard Hagenbach 1870 Andreas Heusler-Sarasin 1871 Hermann von der Goltz 1872 Simon Schwendener 1873 Moritz Heyne 1874 Carl Ernst Emil Hoffmann 1875 Friedrich von Wyss 1876 Franz Overbeck 1876 Wilhelm Vischer 1877 Friedrich Schulin 1878 Emil Kautzsch 1879 Hermann Immermann 1880 August von Miaskowski 1881 Hermann Siebeck 1882 Rudolf Stähelin 1883 Albert Teichmann 1884 Moritz Roth 1885 Jakob Mähly 1886 Paul Wilhelm Schmidt 1887 Eugen Huber 1888 Julius Kollmann 1888 Gustav Soldan 1889 Jakob Wackernagel 1890 Hermann Fehling 1891 Conrad von Orelli 1892 Georg Klebs 1893 Ludwig Rudolf von Salis 1894 Karl von der Mühll 1895 Bernhard Duhm 1