mini|Der zweite AT-Haken von HMGA1 (schwarz) an die kleine Furche AT-reicher DNA gebunden
Ein AT-Haken ist eine DNA-bindende Domäne in verschiedenen DNA-bindenden Proteinen.
Eigenschaften Der AT-Haken bindet bevorzugt A-T-reiche DNA-Sequenzen in der kleinen Furche doppelsträngiger DNA, bevorzugt (ATAA)n, (TATT)n, AAAT oder AATT. Sie kommen z. B. in High-Mobility-Group-Proteinen, in DNA-bindenden Proteinen von Pflanzen und hBRG1 vor. HMGA-Proteine enthalten drei AT-Haken,M. Fedele, S. Battista, G. Manfioletti, C. M. Croce, V. Giancotti, A. Fusco: Role of the high mobility group A proteins in human lipomas. In: Carcinogenesis. Band 22, Nummer 10, Oktober 2001, , S. 1583–1591, PMID 11576996. es wurden in einzelnen Proteinen bis zu 30 AT-Haken gefunden. In Spalthefen wird der Replikationsursprung von einem 9-AT-Haken-Protein gebunden, um die Replikation einzuleiten.L. Mojardín, E. Vázquez, F. Antequera: Specification of DNA replication origins and genomic base composition in fission yeasts. In: Journal of molecular biology. Band 425, Nummer 23, November 2013, , S. 4706–4713, , PMID 24095860.
Die DNA-bindende Aminosäuresequenz des AT-Hakens ist eine konservierte, palindromische Sequenz Prolin-Arginin-Glycin-Arginin-Prolin (Kurzschreibweise PRGRP), wobei es auch AT-Haken mit nur einem Prolin gibt. Weiterhin enthalten AT-Haken in einer der beiden angrenzenden Sequenzen positiv geladene Aminosäuren wie Lysin und Arginin, sowie eine hakenförmige Struktur.
Weblinks Protein Data Bank:
Einzelnachweise
Kategorie:Desoxyribonukleinsäure Kategorie:Molekularbiologie Kategorie:Nukleinsäure-Methode