mini|350px|Struktur von SYPRO Red, soweit bekannt. m = 5–6, n = 2–4.
SYPRO Red ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Merocyanin-Typ,Aleksandr Petrovich Demchenko: Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology III: Applications in Sensing and Imaging Band 3 von Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology. Springer 2011. ISBN 9783642180354. S. 179ff. der zur Färbung von Proteinen im Zuge einer Proteincharakterisierung verwendet wird, meistens in einer SDS-PAGE.T. H. Steinberg, L. J. Jones, R. P. Haugland, V. L. Singer: SYPRO orange and SYPRO red protein gel stains: one-step fluorescent staining of denaturing gels for detection of nanogram levels of protein. In: Analytical biochemistry. Band 239, Nummer 2, August 1996, S. 223–237, . . PMID 8811914.S. Gallagher, D. Chakavarti: Staining proteins in gels. In: Journal of visualized experiments : JoVE. Nummer 17, 2008, . . PMID 19066521. .
Eigenschaften SYPRO Red bindet wie auch sein Analogon SYPRO Orange selektiv an Proteine über 6,5 Kilodalton (auch Glykoproteine) in SDS-Micellen, nicht jedoch an DNA oder Lipopolysaccharide.T. H. Steinberg, R. P. Haugland, V. L. Singer: Applications of SYPRO orange and SYPRO red protein gel stains. In: Analytical biochemistry. Band 239, Nummer 2, August 1996, S. 238–245, . . PMID 8811917. Die Mutagenität, Reproduktionstoxizität und Karzinogenität von SYPRO Red ist unbekannt. Die Absorptionsmaxima liegen bei λ = 300 nm und 550 nm, die Emission ist bei λ = 630 nm maximal. Die Sensitivität bei SDS-PA-Gelen liegt mit SYPRO Red bei etwa 4–8 ng Protein,Molecular Probes / Life Technologies: SYPRO Orange and SYPRO Red Protein Gel Stains. 2003. PDF. also etwas schlechter als bei der Silberfärbung. Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Red-Färbung bei einer Mengenabschätzung im Vergleich zur Silberfärbung oder Coomassie einen größeren linearen dynamischen Bereich, d. h. eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensität. SYPRO Red eignet sich nicht zur Färbung von Proteinen auf Western Blots, 2D-Gelen oder IEF-Gelen. Im Gegensatz zur Silber- und Coomassie-Färbung werden zur Fixierung vor einer Färbung zwar Essigsäure verwendet, jedoch keine Alkohole wie Methanol oder Ethanol, da SYPRO Red zur Färbung auf die Anwesenheit von SDS angewiesen ist.
Einzelnachweise
Kategorie:Chinolin Kategorie:Phenylethen Kategorie:Aminobenzol Kategorie:Sulfonat Kategorie:Alkylamin Kategorie:Quartäre Ammoniumverbindung Kategorie:Fluoreszenzfarbstoff Kategorie:Proteinfarbstoff Kategorie:Biochemisches Nachweisverfahren