Die Ordnung Tymovirales ist ein Taxon (Verwandtschaftsgruppe) von Viren mit einzelsträngigem RNA-Genom in positiv-Strang-Orientierung, das linear und nicht segmentiert ist. Ihre Vertreter sind überwiegend Pflanzenviren. Der Name für Ordnung ist von der Virusfamilie Tymoviridae und diese wiederum von ihrer Typspezies, dem Turnip yellow mosaic virus abgeleitet.
Beschreibung
mini|links|235px|Genomkarte des Gelbe-Rüben-Mosaikvirus (TYMV) Während die Virusteilchen (Virionen) der Vertreter der Familie Tymoviridae aus isometrischen, ikosaedrischen Kapsiden bestehen, findet man bei den anderen drei Familien filamentöse, helikale Kapsidsymmetrien. Aufgrund von Sequenzähnlichkeiten und ähnlichen Replikationsstrategien ist jedoch ein gemeinsamer evolutionärer Vorläufer für alle vier Familien anzunehmen, weshalb 2011 vom ICTV die neue Ordnung Tymovirales geschaffen wurde.
Systematik Innere Systematik
Nach der offiziellen Virus-Taxonomie des ICTV, Stand Mitte April 2024, umfasst die Ordnung Tymovirales folgende Familien:ICTV: Taxonomy Browser.ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
Familie AlphaflexiviridaeSIB: Alphaflexiviridae, auf: ViralZone. Gattung AllexivirusSIB: Allexivirus, auf: ViralZone. Spezies Shallot virus X (ehem. Typus)S. Majumder, M. Arya, R. P. Pant, V. K. Baranwal: Shallot virus X in Indian shallot, a new virus report for India, in: New Disease Reports (2007) 15, 52, ISSN 2044-0588 Gattung Botrexvirus Gattung Lolavirus
Gattung Platypuvirus Gattung PotexvirusSIB: Potexvirus, auf: ViralZone. mit Untergattung Mandarivirus Gattung Sclerodarnavirus
Familie BetaflexiviridaeSIB: Betaflexiviridae, auf: ViralZone. Unterfamilie Quinvirinae Gattung Banmivirus Gattung CarlavirusSIB: Carlavirus, auf: ViralZone. mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von ASPV-Virionen. Balken 100 nm Gattung FoveavirusSIB: Foveavirus, auf: ViralZone. Spezies (ASPV, ehem. Typus) Gattung Robigovirus Gattung Sustrivirus ohne Gattungszuweisung: Spezies Banana virus X Unterfamilie Trivirinae mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von ASGV-Virionen. Balken 100 nm Gattung CapillovirusSIB: Capillovirus, auf: ViralZone. Spezies (ASGV, ehem. Typus) Gattung Chordovirus Gattung Citrivirus mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von CLBV-Virionen. Balken 200 nm Spezies (CLBV, ehem. Typus) Gattung Divavirus Gattung Prunevirus Gattung Ravavirus Gattung Tepovirus mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von ACLSV-Virionen. Balken 100 nm Gattung TrichovirusSIB: Trichovirus, auf: ViralZone. Spezies (ACLSV, ehem. Typus) mini|hochkant=0.8|EM-Aufnahme von GVA-Virionen. Balken 100 nm Spezies (CMLV) Gattung VitivirusSIB: Vitivirus, auf: ViralZone. Spezies (GVA, ehem. Typus) Spezies (GVB) Gattung Wamavirus
Familie GammaflexiviridaeSIB: Gammaflexiviridae, auf: ViralZone. Gattung Gammaflexivirus Gattung Mycoflexivirus Spezies Botrytis virus F (ehem. Typus)
Familie DeltaflexiviridaeSIB: Deltaflexiviridae, auf: ViralZone. Gattung Deltaflexivirus Spezies Sclerotinia deltaflexivirus 1 (ehem. Typus)
Familie TymoviridaeSIB: Tymoviridae, auf: ViralZone. Gattung Maculavirus Gattung Marafivirus Spezies Marafivirus syrahense (GSyV-1) Gattung Tymovirus Spezies Gelbe-Rüben-Mosaikvirus, alias Rübenmosaikvirus, en. (TYMV, ehem. Typus) Spezies Mildes Anden-Kartoffelmosaikvirus, en. (APMMV0) ohne Gattungszuweisung Spezies Bombyx mori latent virus Spezies Poinsettia mosaic virus
Äußere Systematik Koonin et al haben 2015 die Tymovirales taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.In älteren Arbeiten findet sich (mit abweichender Phylogenie) auch die Bezeichnung ‚Sindbis-like supergroup‘, Sindbis-Virus ist eine Spezies in der Gattung Alphavirus, Familie Togaviridae. Da diese Gruppe (von den Autoren als bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben. Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology Mai 2015; 479–480. 2–25. , PMID 25771806.
Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.
ICTV Master Species List #35 Mit der neuen des ICTV, ratifiziert im März 2020, ergibt sich abweichend folgendes Bild:
Von den Kitrinoviricota sind nur die Klassen mit den bereits genannten Familien gelistet, zwei weitere dieser Familien bleiben mit diesem Stand innerhalb der Orthornavirae noch ohne Zuordnung. Die „Alphavirus-like superfamily“ deckt sich im Wesentlichen mit dem Phylum Kitrinoviricota.
Als mögliches weiteres Mitglied dieses Phylums könnte eine vorgeschlagene Familie um das „Chronische Bienenlähmungsvirus“ (CBPV) infrage kommen, wenn die Nodaviridae und die Tombusviridae dessen nächste Verwandte sind, die Unterschiede aber eine eigene Familie rechtfertigen (siehe dort).
Quellen A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 901ff
Einzelnachweise Grapevine Red Blotch Disease (GRBaV). University of California, Agriculture and Natural Reserves. UCCE Sonoma county. Dazu: Auch Riesling in Gefahr: Ein Virus bedroht die globale Weinproduktion. Auf: n-tv.de vom 15. November 2023.
Kategorie:Virusordnung