CLIP-Seq (engl. ) ist eine Methode der Biochemie zur Untersuchung von RNA-Protein- und RNA-RNA-Interaktionen. Gelegentlich wird die CLIP-Seq auch als HITS-CLIP bezeichnet.
Prinzip Die CLIP-Seq besteht aus einer Kombination einer UV-Quervernetzung, einer Immunpräzipitation, einer teilweisen Nukleolyse und einer DNA-Sequenzierung im Hochdurchsatz.
Die CLIP-Seq besitzt Ähnlichkeiten zum PAR-CLIP, zum iCLIP, zum RIP-Chip (ohne Vernetzung und mit Microarray anstatt der DNA-Sequenzierung), zur SELEX, zur ChIP-Seq (zur Untersuchung von DNA-Protein-Interaktionen) und zum ChIP-on-Chip (zur Untersuchung von DNA-Protein-Interaktionen mit einem Microarray anstatt der DNA-Sequenzierung).
Weblinks starBase database: eine Online-Datenbank für RNA-Protein-Interaktionen. Abgerufen am 20. Juni 2013. BIMSB doRiNA database: eine Online-Datenbank für RNA-Protein-Interaktionen. Abgerufen am 20. Juni 2013.
Einzelnachweise
Kategorie:Nukleinsäure-Methode Kategorie:Abkürzung Kategorie:Protein-Methode Kategorie:Biochemisches Nachweisverfahren