Johann Schäffer oder Johann Schaeffer ist der Name folgender Personen:
* Johann Schäffer (Architekt) (1861–nach 1895), deutscher Architekt Johann Schäffer (Tiermediziner) (* 1952), deutscher Veterinärmediziner, Tiermedizinhistoriker und Hochschullehrer Johann Balthasar Schäffer (1684–1750), deutscher Augustinermönch und Tanzlehrer Johann Christoph Schäffer (1677–1728), deutscher Pfarrer Johann Friedrich Schäffer (auch Schäfer, Scheffer; nach 1685–nach 1748), deutscher Orgelbauer Johann Georg von Schäffer-Bernstein (1757–1838), deutscher Generalleutnant Johann Gottlieb Schaeffer (1720–1795), deutscher Arzt und Naturforscher Johann Jakob Schäffer (1751–1819), deutscher Geistlicher Johann Nepomuk Schäffer (1751–1796), deutscher Geistlicher, Theologe und Hochschullehrer, siehe Johann Nepomuk Schäfer Johann Norbert Schäffer (1813–nach 1868), deutscher Klavierbauer Johann Ulrich Gottlieb von Schäffer (1753–1829), deutscher Arzt
Siehe auch: Johannes Schäffer (1797–1862), deutscher Schreiner und Politiker Johann Scheffer Johannes Scheffer (1621–1679), deutsch-schwedischer Humanist