Die Diözese Eisenstadt ist in folgende 12 Dekanate und 172 Pfarren unterteilt:
Dekanat Deutschkreutz Deutschkreutz, Horitschon, Kobersdorf, Lackenbach, Neckenmarkt, Raiding, Ritzing, Unterfrauenhaid, Unterpetersdorf, Weppersdorf Dekanat Eisenstadt-Rust Breitenbrunn am Neusiedler See, Donnerskirchen, Eisenstadt-Dompfarre, Eisenstadt-Oberberg, Großhöflein, Kleinhöflein, Leithaprodersdorf, Loretto, Mörbisch am See, Müllendorf, Neufeld an der Leitha, Oggau am Neusiedler See, Purbach am Neusiedler See, Rust, St. Georgen, St. Margarethen im Burgenland, Schützen am Gebirge, Stotzing, Wimpassing an der Leitha Dekanat Frauenkirchen Andau, Apetlon, Frauenkirchen, Gols, Halbturn, Illmitz, Mönchhof, Pamhagen, Podersdorf am See, St. Andrä am Zicksee, Tadten, Wallern im Burgenland Dekanat Großwarasdorf Frankenau, Großwarasdorf, Kleinwarasdorf, Kroatisch Geresdorf, Kroatisch Minihof, Lutzmannsburg, Nebersdorf, Nikitsch, Unterpullendorf Dekanat Güssing Bildein, Bocksdorf, Deutsch Schützen, Deutsch Tschantschendorf, Eberau, Gaas, Gerersdorf bei Güssing, Großmürbisch, Güssing, Güttenbach, Hagensdorf, Heiligenbrunn, Kukmirn, Litzelsdorf, Moschendorf, Neuberg, Olbendorf, Ollersdorf, St. Kathrein, St. Michael im Burgenland, Stegersbach, Stinatz, Strem, Tobaj Dekanat Jennersdorf Deutsch Kaltenbrunn, Dobersdorf, Heiligenkreuz im Lafnitztal, Jennersdorf, Königsdorf, Maria Bild, Mogersdorf, Neuhaus am Klausenbach, Rudersdorf, St. Martin an der Raab Dekanat Mattersburg Bad Sauerbrunn, Forchtenstein, Hirm, Kleinfrauenhaid, Krensdorf, Marz, Mattersburg, Neudörfl an der Leitha, Pöttsching, Rohrbach bei Mattersburg, Schattendorf, Sieggraben, Sigleß, Walbersdorf, Wiesen Dekanat Neusiedl am See Deutsch Jahrndorf, Edelstal, Gattendorf, Jois, Kaisersteinbruch, Kittsee, Neudorf bei Parndorf, Neusiedl am See, Nickelsdorf, Pama, Parndorf, Potzneusiedl, Weiden am See, Winden am See, Zurndorf Dekanat Oberpullendorf Draßmarkt, Kaisersdorf, Klostermarienberg, Kogl, Landsee, Lockenhaus, Mannersdorf an der Rabnitz, Markt St. Martin, Mitterpullendorf, Neutal, Oberloisdorf, Oberpullendorf, Oberrabnitz, Pilgersdorf, Piringsdorf, Rattersdorf, Steinberg an der Rabnitz, Stoob, Unterrabnitz Dekanat Pinkafeld Bad Tatzmannsdorf, Bernstein, Grafenschachen, Kemeten, Kitzladen, Mariasdorf, Oberdorf im Burgenland, Oberwart, Pinkafeld, Rotenturm an der Pinka, St. Martin in der Wart, Unterwart, Wolfau Dekanat Rechnitz Dürnbach, Großpetersdorf, Hannersdorf, Jabing, Kirchfidisch, Markt Neuhodis, Mischendorf, Neumarkt im Tauchental, Oberkohlstätten, Rechnitz, Schachendorf, Schandorf, Stadtschlaining, Weiden bei Rechnitz Dekanat Trausdorf Antau, Baumgarten, Draßburg, Hornstein, Klingenbach, Oslip, Siegendorf, Steinbrunn, Trausdorf an der Wulka, Wulkaprodersdorf, Zagersdorf, Zillingtal
*Eisenstadt