Stoney Brook ist der Name folgender Fließgewässer:
in Kanada: Stoney Brook (Niles Brook), New Brunswick Stoney Brook (Bridge Lake), Nova Scotia Stoney Brook (Panuke Lake), Nova Scotia Stoney Brook (Meteghan River), Nova Scotia Stoney Brook (Jordan River), Nova Scotia
in den Vereinigten Staaten: Stoney Brook (Stratton Brook), Maine Stoney Brook (St. Louis River), Minnesota Stoney Brook (Spring Run), Pennsylvania
Siehe auch: Stony Brook (Begriffsklärung)