Merxhausen bezeichnet folgende geographische Objekte:

Merxhausen (Bad Emstal), Ortsteil von Bad Emstal, Landkreis Kassel, Nordhessen Merxhausen (Heinade), Ortsteil von Heinade, Landkreis Holzminden, Niedersachsen Merxhausen (gemeindefreies Gebiet), gemeindefreies Gebiet im Landkreis Holzminden, Niedersachsen