Over de Zesdaagse Oorlog - een strijd die van 5 juni tot 10 juni 1967 werd uitgevochten tussen Israël en zijn buurlanden Egypte (dat zich toentertijd de Verenigde Arabische Republiek noemde), Jordanië en Syrië - en die begon met een grote (verrassings-)luchtaanval door Israël op Egypte en eindigde met een Israëlische overwinning en enkele belangrijke geopolitieke verschuivingen in het Midden-Oosten, zijn een aantal controverses ontstaan die de oorzaken en het verloop van de oorlog betreffen.

De belangrijkste vragen zijn: Of de Israëlische actie een preventieve aanval was, gerechtvaardigd door de dreiging van een op handen zijnde aanval van de Arabische staten, of een ongerechtvaardigde, niet-uitgelokte aanval. Of de Egyptenaren achterblijvers van hun eigen strijdkrachten gedood hebben toen ze terugkwamen van de nederlaag. Of de Israëli's ongewapende Egyptische gevangenen gedood hebben. Hoe groot de omvang was van de buitenlandse steun aan de strijdende partijen in de oorlog.

thumb|Universal Newsreel van 13 juni 1967 over de Zesdaagse Oorlog.

Aard van de aanval Er bestaat geen eenduidig antwoord op de vraag of de Israëlische actie werd gerechtvaardigd door een onmiddellijke dreiging van de Arabische staten en dus een preventieve aanval was of dat dit een ongerechtvaardigde, niet-uitgelokte aanval was; de opvattingen hierover lopen uiteen en verschillende later gedane analyses en uitspraken spreken elkaar tegen.

Eerste claims Zowel Egypte als Israël hebben verklaard dat ze werden aangevallen door het andere land. Gideon Rafael, de Israëlische ambassadeur bij de VN, ontving een bericht van het Israëlische ministerie van buitenlandse zaken: Om 3:10 uur wekte Rafael ambassadeur Hans Tabor, de Deense voorzitter van de Veiligheidsraad voor juni, met het nieuws dat Egyptische strijdkrachten in beweging waren gekomen tegen Israël. Op de raadsvergadering van 5 juni van de Veiligheidsraad beweerden zowel Israël als Egypte dat het land bezig was met afweren van een invasie door de ander.

Op 5 juni beschuldigde Egypte, gesteund door de Sovjet-Unie, Israël van agressie. Israël beweerde dat Egypte als eerste een oorlogsdaad had verricht en vertelde de raad: In feite was dit niet correct.The Case for Palestine: An International Law Perspective; John B Quigley Het "US Office of Current Intelligence" kwam al snel tot de conclusie dat de Israëli's – in tegenstelling tot hun verklaringen – de eerste oorlogsdaad hadden gepleegd.

Preventieve aanval De Israëlische opvatting was dat het begin van de Zesdaagse Oorlog een preventieve aanval was, aangezien Israël een geplande invasie door de Arabische landen verwachtte.BBC Panorama. Gearchiveerd op 8 april 2023. Een aantal bronnen ondersteunen deze visie (zie voetnoten 1 en 2). De voorafgaande weken had de Egyptische president Nasser de spanning opgevoerd door de VN-troepen in het grensgebied naar huis te sturen, de Golf van Akaba af te sluiten voor Israëlische schepen en door in redevoeringen te dreigen, de zionisten in zee te drijven.

Onterechte aanval De Arabische opvatting was dat het een niet-uitgelokte aanval was (zie voetnoot 3). Het standpunt dat de dreiging van de Arabische staten geen preventieve aanval rechtvaardigde wordt ook ondersteund door een aantal bronnen (zie voetnoot 4).

Beschuldigingen van Egyptische wreedheden tegen mede-Egyptenaren Na de oorlog was er weinig overgebleven van de zeven Egyptische divisies die waren ingezet in de Sinaï. Duizenden Egyptische soldaten werden achtergelaten en probeerden wanhopig om hun weg naar het westen in de richting van het Suezkanaal-zone te zoeken. Israël kon ze niet allemaal gevangen nemen, en vergemakkelijkte - waar mogelijk - hun beweging in de richting van het Suezkanaal, waar ze zouden proberen over te zwemmen. Echter, een groep (van de Egyptische achterblijvers) werd neergeschoten door hun eigen strijdkrachten aan de andere kant van het kanaal met machinegeweren."Churchill & Churchill 1967, blz. 179, 198. Er is gesuggereerd dat Nasser niet wilde dat men in Egypte zou horen van de ware omvang van zijn nederlaag en dus bevel gaf tot het doden van de overlevenden die probeerden te ontsnappen.Churchill & Churchill 1967, blz. 179. Andere Egyptische overlevenden die werden overgebracht naar Egypte bij Qantara werden -toen ze aan de Egyptische kant van het kanaal waren- in "compounds" gedreven waar ze werden omringd door prikkeldraad. Winston Churchill, de kleinzoon van de beroemde voormalige Britse premier, wijst erop dat de Egyptische soldaten die erin zijn geslaagd om hun weg terug te vinden naar Egypte nooit thuis arriveerden, maar in plaats daarvan werden bewaard in legerkampen, "om te voorkomen dat de verspreiding van moedeloosheid was onder de burgerbevolking".Churchill & Churchill 1967, p. 198

Beschuldigingen dat het Israëlisch defensieleger Egyptische gevangenen heeft gedood Na de oorlog volgde er een nationaal debat in Israël met betrekking tot beschuldigingen dat soldaten ongewapende Egyptenaren zouden hebben gedood. Een paar soldaten zeiden dat zij getuige waren geweest van de executie van ongewapende gevangenen. Gabriel Brun, een Jeruzalemse journalist voor Yedioth Ahronoth, beschreef hoe hij getuige was geweest van de executie van zeker vijf Egyptische militaire gevangenen in een massagraf.Israelis admit war crimesindependent.co.uk, 17 aug.1995Bron, Gabby specialprograms/mideastaffairs/witness2.htm Egyptian POWs Ordered to Dig Graves, Then Shot By Israeli Army, Yedioth Ahronoth, 17 augustus 1995. Michael Bar-Zohar zei dat hij getuige was geweest van de moord op drie Egyptische krijgsgevangenen door een kok,'Bar-Zohar, Michael 'The Reactions of Journalists to the Army's Murders of POWs', Maariv, 17 August 1995 en Meir Pa'il zei dat hij wist van de vele gevallen waarin soldaten krijgsgevangenen of Arabische burgers hadden gedood.^ Prior 1999, pp. 209–210; Bar-On, Morris and Golani 2002; Fisher, Ronal 'Mass Murder in the 1956 War', Ma'ariv, 8 August 1995. Van Uri Milstein, een Israëlische militair historicus, werd gemeldLaub, Karin 'Historians: Israeli troops killed many Egyptian POWs', Associated Press, 16 August 1995. Retrieved from the Wayback Machine. 14 October 2005. dat hij beweerde dat er veel incidenten in de oorlog van 1967 waren geweest waarin Egyptische soldaten werden gedood door Israëlische troepen nadat ze hun handen in de lucht staken ten teken van overgave. "Het was geen officieel beleid, maar er was een sfeer dat het oké was om het te doen," aldus Milstein. "Sommige commandanten besloten om het te doen, anderen weigerden. Maar iedereen wist ervan.""Israel Reportedly Killed POWs", 17 August 1995. De Israëlische militaire historicus Aryeh Yizhaki bevestigde de liquidaties van zo'n 900 Egyptenaren in de regio El-Arish door een elite-eenheid, nadat ze hun wapens hadden neergelegd en zich hadden overgegeven. Hij verklaarde dat hij op het rapport dat hij in 1968 naar de autoriteiten had gestuurd geen enkel gevolg had gekregen, en dat de "zaak in de doofpot was gestopt."Un historien accuse Tsahal d'avoir massacré des soldats égyptiens en 1967 liberation.fr, 17 augustus 1995 Beschuldigingen dat Egyptische soldaten op de vlucht in de woestijn werden doodgeschoten werden bevestigd in rapporten geschreven na de oorlog. De Israëlische historicus en journalist Tom Segev citeert in zijn boek 1967:

Volgens een New York Times artikel van 21 september 1995 verklaarde de Egyptische regering dat twee ondiepe massagraven in de Sinaï in El Arish waren ontdekt met de resten van 30 tot 60 Egyptische gevangenen die naar verluidt zijn doodgeschoten door Israëlische soldaten tijdens de Zesdaagse Oorlog. Israël reageerde door Elli Dayan, een onderminister van Buitenlandse Zaken, naar Egypte te sturen om de zaak te bespreken. Tijdens zijn bezoek bood Dayan een schadevergoeding voor de families van de slachtoffers aan. De Israëlische ambassadeur in Caïro, David Sultan, verzocht te worden ontheven van zijn post nadat de Egyptische krant Al Shaab schreef dat hij persoonlijk verantwoordelijk was voor de moord op 100 Egyptische gevangenen. Zowel de Israëlische ambassade als het ministerie van Buitenlandse Zaken ontkenden de beschuldiging. Israëlische ambtenaren bleven vaag ten aanzien van de vraag of en waar Sultan had gediend in het leger.Egypt Says Israelis Killed P.O.W.'s in '67 War, door Ibrahim, Youssef, New York Times, 21 september 1995

Kapitein Milovan Zorc en verbindingsofficier Miobor Stosic, die lid waren van het Joegoslavische Reconnaissance Bataljon dat deel uitmaakte van de 3400 man sterke UN Emergency Force die sinds 1956 was ingezet als buffer tussen Egypte en Israël, betwijfelden dat Egyptische gevangenen nabij El Arish door Israëlische soldaten zouden zijn doodgeschoten tijdens de Zesdaagse Oorlog. Als een Israëlische eenheid ongeveer 250 krijgsgevangenen had gedood in de buurt van de stad, zouden ze dat waarschijnlijk te weten zouden zijn gekomen, verklaarden Zorc en Stosic."UN soldiers doubt 1967 killing of POWs" door AP. The Jerusalem Post, 29 maart 2007. Bezocht 17 juli 2010.

Uit door de IDF (Israëlische defensieleger) vrijgegeven documenten blijkt dat op 11 juni 1967 (dus na de oorlog) de activiteitentak van de generale staf het nodig vond om nieuwe orders met betrekking tot de behandeling van gevangenen te geven. De order was:

Volgens Israëlische bronnen werden 4.338 Egyptische soldaten gevangengenomen door de IDF. 11 Israëlische soldaten werden gevangengenomen door de Egyptische strijdkrachten. Uitwisselingen van krijgsgevangenen werden voltooid op 23 januari 1968.Achtergrondinformatie over de Israëlische krijgsgevangenen en MIA. Bezocht 14 oktober 2004.

Ten westen van Jeruzalem bij het verwoeste dorp Latrun werd bij destijds kibboets Nahshon (nadien Israëlische nederzetting) een massagraf ontdekt met ongeveer 80 soldaten van een Egyptische elite legereenheid. De gebeurtenis werd verzwegen en het grafveld werd deel van het populaire toeristische Mini-Israël park, op velden van verwoeste Palestijnse dorpen die met de grond gelijk waren gemaakt.Revealed: Dozens of Egyptian Commandos Are Buried Under an Israeli Tourist Attraction haaretz.com, 8 juli 2022Israel says it will probe 1967 mass grave of Egyptian soldiers aljazeera.com, 11 juli 2022

Ondersteuning door buitenlandse strijdkrachten Volgens George Lenczowski gaf de Amerikaanse president Johnson, al op 23 mei, in het geheim bevoegdheid tot het het leveren van een verscheidenheid van wapensystemen aan Israël, ondanks een embargo op wapenleveranties aan het Midden-Oosten.Mansour 1994, blz. 89

Stephen Green schreef in zijn boek dat de Amerikaanse verkenningsvliegtuigen nachtelijke bewegingen van de Egyptische grondtroepen in kaart brachten om overdag de Israëlische luchtaanvallen te vergemakkelijken.Groen 1984 Richard Parker bestrijdt dit en stelt dat het een hoax is, gebaseerd op de twijfelachtige getuigenis van een enkele man.Parker 1997

Op de tweede dag van de oorlog werd -in door Arabische staten gecontroleerde media - gemeld dat Amerikaanse en Britse troepen vochten aan de kant van Israël. Radio Caïro en het regeringsgezinde dagblad Al-Ahram deden een aantal claims, bijvoorbeeld dat de Amerikaanse en Britse vliegtuigen opstegen vanaf vliegdekschepen en aanvallen uitvoerden op Egypte, dat Amerikaanse vliegtuigen gevestigd op Wheelus Air Base in Libië Egypte aanvielen en dat Amerikaanse spionagesatellieten die beelden verstrekten aan Israël. Mohamed Hassanein Heikal, de leider van "Al-Ahram" ten tijde van het Nasserbewind, herhaalde soortgelijke vorderingen op Al Jazeera.