thumb|Palmvleerhond thumb|Nijlroezet thumb|Taphozous mauritianus thumb|Langsnuitdolfijn thumb|Monameerkat thumb|Afrikaanse civetkat thumb|Wezel Dit is een lijst van zoogdieren die voorkomen in Sao Tomé en Principe.
Van origine kwamen op de eilanden Sao Tomé en Principe elf zoogdiersoorten voor en drie soorten kwamen voor in de territoriale wateren. Er waren vier endemisch inheemse soorten. Zes diersoorten zijn door toedoen van de mens op de eilanden geïntroduceerd en daarnaast worden van acht veelvoorkomende huisdieren (ezel, geit, hond, kat, paard, rund, schaap en varken) soms ferale exemplaren aangetroffen.
Orde vleermuizen (Chiroptera) Familie vleerhonden (Pteropodidae) Palmvleerhond, Eidolon helvum (inheems) Myonycteris brachycephala (inheems, endemisch op Sao Tomé)Myonycteris (Phygetis) brachycephala Mammal Species of the World Nijlroezet, Rousettus aegyptiacus (inheems)Rousettus (Rousettus) aegyptiacus Mammal Species of the World
Familie gladneuzen (Vespertilionidae) Miniopterus minor (inheems)Miniopterus minor Mammal Species of the World
Familie bulvleermuizen (Molossidae) Chaerephon pumila (inheems)Chaerephon pumilus Mammal Species of the World Chaerephon tomensis (inheems, endemisch op Sao Tomé)Chaerephon tomensis Mammal Species of the World
Familie schedestaartvleermuizen (Emballonuridae) Mauritiusgrafvleermuis, Taphozous mauritianus (inheems)Taphozous (Taphozous) mauritianus Mammal Species of the World
Familie hoefijzerneuzen (Rhinolophidae) Hipposideros ruber (inheems)Hipposideros ruber Mammal Species of the World Hipposideros thomensis (inheems, endemisch)Hipposideros thomensis Mammal Species of the World
Orde insecteneters (Eulipotyphla) Familie wittandspitsmuizen (Crocidurinae) Crocidura poensis (inheems, alleen voorkomend op Principe) Crocidura thomensis (inheems, endemisch op Sao Tomé)
De populatie van Crocidura poensis op het eiland Principe is mogelijk een aparte soort, Crocidura fingui.
Orde walvissen (Cetacea) Familie dwergpotvissen (Kogiidae) Kleinste potvis, Kogia sima (inheems, territoriale wateren)
Familie spitssnuitdolfijnen (Ziphidae) Spitssnuitdolfijn van de Blainville, Mesoplodon densirostris (inheems, territoriale wateren)
Familie dolfijnen (Delphinidae) Langsnuitdolfijn, Stenella longirostris (inheems, territoriale wateren)
Orde primaten (Primates) Familie apen van de Oude Wereld (Cercopithecidae) Monameerkat, Cercopithecus mona (geïntroduceerd op beide eilanden)
Familie mensachtigen (Hominidae) Mens, Homo sapiens (geïntroduceerd)
Orde roofdieren (Carnivora) Familie civetkatachtigen (Viverridae) Afrikaanse civetkat, Civettictis civetta (geïntroduceerd op Sao Tomé)
Familie marterachtigen (Mustelidae) Wezel, Mustela nivalis (geïntroduceerd op Sao Tomé)
Orde knaagdieren (Rodentia) Familie muisachtigen (Muridae) Huismuis, Mus musculus (geïntroduceerd) Bruine rat, Rattus norvegicus (geïntroduceerd) Zwarte rat, Rattus rattus (geïntroduceerd)
Zie ook Lijst van amfibieën in Sao Tomé en Principe Lijst van reptielen in Sao Tomé en Principe Lijst van vogels in Sao Tomé en Principe Lijst van zoetwatervissen in Sao Tomé en Principe Lijst van zoutwatervissen in Sao Tomé en Principe
Zoogdieren Sao Tome En Principe Zoogdieren